17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0501 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0501  NUDIX hydrolase  100 
 
 
129 aa  261  3e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003515  hypothetical protein  43.51 
 
 
137 aa  102  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.430687  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02247  hypothetical protein  41.91 
 
 
148 aa  101  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0649  MutT/nudix family protein  48.03 
 
 
136 aa  100  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0683  NUDIX hydrolase  43.51 
 
 
134 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3542  NUDIX hydrolase  33.1 
 
 
157 aa  60.5  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0543257  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2549  NUDIX hydrolase  39.25 
 
 
145 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.925567  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3273  NUDIX hydrolase  31.36 
 
 
154 aa  44.7  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1622  dinucleoside polyphosphate hydrolase  32.54 
 
 
192 aa  43.1  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0981  dinucleoside polyphosphate hydrolase  26.76 
 
 
175 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.12815e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3241  dinucleoside polyphosphate hydrolase  26.76 
 
 
175 aa  42.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000341046  normal  0.0858473 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1033  dinucleoside polyphosphate hydrolase  26.76 
 
 
175 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000236129  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3399  dinucleoside polyphosphate hydrolase  27.87 
 
 
178 aa  42.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000267349  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3272  dinucleoside polyphosphate hydrolase  27.27 
 
 
176 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000105899  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0569  dinucleoside polyphosphate hydrolase  44.23 
 
 
170 aa  40.8  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0412118  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3824  dinucleoside polyphosphate hydrolase  28.93 
 
 
175 aa  40.4  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000167151  normal  0.427646 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0494  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
146 aa  40  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>