30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0649 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0649  MutT/nudix family protein  100 
 
 		 136 aa  278  2e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0683  NUDIX hydrolase  73.88 
 
 		 134 aa  210  5.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003515  hypothetical protein  44.44 
 
 		 137 aa  108  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.430687  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02247  hypothetical protein  44.27 
 
 		 148 aa  95.9  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0501  NUDIX hydrolase  51.85 
 
 		 129 aa  90.9  6e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2549  NUDIX hydrolase  36.89 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.925567  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3542  NUDIX hydrolase  35.25 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0543257  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1886  MutT/Nudix family protein  29.31 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2102  mutT/nudix family protein  29.31 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1338  NUDIX hydrolase  25.44 
 
 		 150 aa  45.1  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000650565  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2071  mutT/nudix family protein  29.31 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1876  MutT/Nudix family protein  29.31 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1924  mutT/nudix family protein  29.31 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3273  NUDIX hydrolase  32.5 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2170  mutT/nudix family protein  29.51 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.625771  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2142  mutT/nudix family protein  28.45 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.10318  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  31.91 
 
 		 341 aa  42.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4880  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 		 117 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1412  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.38 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559865  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01716  hypothetical protein  44 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.15744  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1873  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  44 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.440168  hitchhiker  0.000083786 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2479  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  44 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01728  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  44 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.10262  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1920  NUDIX hydrolase  27.83 
 
 		 146 aa  40.8  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.234524  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1883  NUDIX hydrolase  44 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1983  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  44 
 
 		 135 aa  40.8  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000136061  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3248  mutT/nudix family protein  28.7 
 
 		 148 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00145388  normal  0.225138 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2060  mutT/nudix family protein  28.7 
 
 		 148 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0210595  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1395  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  44 
 
 		 138 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1445  MutT/nudix family protein  33.96 
 
 		 153 aa  40  0.01  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>