122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1987 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1987  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 155 aa  317  5e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0645  NUDIX hydrolase  60.54 
 
 		 155 aa  185  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1098  NUDIX hydrolase  59.72 
 
 		 155 aa  177  4e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.448476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4431  NUDIX hydrolase  57.34 
 
 		 164 aa  171  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4521  NUDIX hydrolase  59.21 
 
 		 156 aa  168  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.506364 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2817  NUDIX hydrolase  56.46 
 
 		 152 aa  167  3e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13765  hypothetical protein  53.95 
 
 		 166 aa  166  7e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.983203 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0645  hypothetical protein  64.14 
 
 		 154 aa  166  8e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5719  NUDIX hydrolase  55.41 
 
 		 154 aa  165  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.943651 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5859  NUDIX hydrolase  57.64 
 
 		 153 aa  165  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315919  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2262  NUDIX hydrolase  56.25 
 
 		 155 aa  164  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.997578  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3428  NUDIX hydrolase  56.86 
 
 		 163 aa  164  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5357  NUDIX hydrolase  54.73 
 
 		 154 aa  164  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.737057 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2044  NUDIX hydrolase  57.53 
 
 		 160 aa  156  8e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3182  NUDIX hydrolase  58.33 
 
 		 163 aa  155  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.565463  normal  0.196576 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3404  NUDIX hydrolase  55.86 
 
 		 174 aa  155  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321528  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2879  NUDIX hydrolase  54.67 
 
 		 157 aa  150  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2923  NUDIX hydrolase  54.67 
 
 		 157 aa  150  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.928534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2909  NUDIX hydrolase  54.67 
 
 		 157 aa  150  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188033  normal  0.899663 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7253  NUDIX hydrolase  53.02 
 
 		 160 aa  150  8.999999999999999e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2646  NUDIX hydrolase  51.05 
 
 		 155 aa  148  3e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3585  NUDIX hydrolase  52.41 
 
 		 162 aa  146  9e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00428581  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16970  predicted NTP pyrophosphohydrolase  51.02 
 
 		 154 aa  142  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.542075  normal  0.366756 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0649  NUDIX hydrolase  52.05 
 
 		 154 aa  141  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3663  NUDIX hydrolase  54.35 
 
 		 154 aa  140  5e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1389  NUDIX hydrolase  48.72 
 
 		 324 aa  140  9e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.524565  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2570  hypothetical protein  47.59 
 
 		 172 aa  139  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00072063  normal  0.0208228 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4185  NUDIX hydrolase  46.41 
 
 		 154 aa  139  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0064  NUDIX hydrolase  47.93 
 
 		 168 aa  139  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2993  NUDIX hydrolase  51.01 
 
 		 154 aa  134  4e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0671  NUDIX hydrolase  50.68 
 
 		 153 aa  134  5e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.616571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0358  NUDIX hydrolase  46.36 
 
 		 162 aa  130  6.999999999999999e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2455  NUDIX hydrolase  47.14 
 
 		 162 aa  128  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.490004  normal  0.610267 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0113  NUDIX hydrolase  47.4 
 
 		 165 aa  128  4.0000000000000003e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3569  NUDIX hydrolase  46.2 
 
 		 163 aa  127  6e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0230  NUDIX hydrolase  41.1 
 
 		 166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2816  NUDIX hydrolase  36.42 
 
 		 326 aa  54.3  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0490383 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0301  NUDIX hydrolase  36.91 
 
 		 324 aa  53.1  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.917756  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0324  putative MutT family protein  45.16 
 
 		 325 aa  52  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1103  nudix hydrolase  43.48 
 
 		 524 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.426954 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  34.4 
 
 		 305 aa  51.6  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1167  NUDIX hydrolase  43.1 
 
 		 164 aa  51.2  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5641  NUDIX hydrolase  32.81 
 
 		 146 aa  51.2  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25640  ADP-ribose pyrophosphatase  48.33 
 
 		 314 aa  50.4  0.000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194053  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  35.77 
 
 		 311 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  35.77 
 
 		 311 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  35.77 
 
 		 311 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0876  NUDIX hydrolase  45.68 
 
 		 333 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.679959  hitchhiker  0.00511053 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03520  ADP-ribose pyrophosphatase  34.33 
 
 		 308 aa  49.7  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.630054 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2727  NUDIX hydrolase  40.45 
 
 		 322 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00813927 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33510  NTP pyrophosphohydrolase  42.05 
 
 		 343 aa  47.8  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0185046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  31.45 
 
 		 303 aa  48.1  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8612  hypothetical protein  34.68 
 
 		 292 aa  47.8  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 341 aa  47.4  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3015  NUDIX hydrolase  36.07 
 
 		 351 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0480  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 184 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.227834  hitchhiker  0.00765199 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  36.9 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0747  hypothetical protein  31.78 
 
 		 153 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5221  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 		 333 aa  45.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.239365  normal  0.144046 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  32.19 
 
 		 473 aa  45.4  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  42.62 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1033  NUDIX hydrolase  36.49 
 
 		 542 aa  45.1  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0906744 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  31.36 
 
 		 317 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1152  NUDIX hydrolase  38.75 
 
 		 296 aa  44.7  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000396101 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  32.64 
 
 		 153 aa  45.1  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4563  NUDIX hydrolase  41.43 
 
 		 166 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4548  NUDIX hydrolase  36.44 
 
 		 156 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0575  NUDIX hydrolase  55.56 
 
 		 161 aa  44.3  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3542  NUDIX hydrolase  42 
 
 		 157 aa  44.3  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0543257  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1047  NUDIX hydrolase  33.96 
 
 		 158 aa  44.3  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 		 164 aa  44.3  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  42.37 
 
 		 289 aa  43.9  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2439  NUDIX hydrolase  49.06 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000635517  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0891  NUDIX domain-containing protein  33.33 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1810  NUDIX family hydrolase  33.33 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2666  NUDIX domain-containing protein  32.54 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.661502  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0922  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1404  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567181  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1418  NUDIX domain-containing protein  33.33 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0460  NUDIX domain-containing protein  33.33 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.080692  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0700  NUDIX domain-containing protein  33.33 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6207  putative NUDIX hydrolase  40.98 
 
 		 322 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1382  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.162154 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1229  septum formation protein Maf  32.14 
 
 		 475 aa  43.5  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000255715 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17440  ADP-ribose pyrophosphatase  41.27 
 
 		 336 aa  43.5  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303863  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25540  ADP-ribose pyrophosphatase  40.58 
 
 		 224 aa  43.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.237744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0212  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  29.37 
 
 		 368 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4127  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 		 167 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0317777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2457  NUDIX hydrolase  42 
 
 		 168 aa  42.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.815124  normal  0.223342 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0260  NUDIX hydrolase  41.27 
 
 		 303 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0697  NUDIX hydrolase  30.52 
 
 		 153 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.405136  normal  0.276525 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3659  NUDIX hydrolase  34.43 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3713  NUDIX hydrolase  34.43 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.34435 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2236  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 356 aa  42.7  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.592107  normal  0.569129 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  34.74 
 
 		 158 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1657  NUDIX hydrolase  35.51 
 
 		 132 aa  42.4  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.809555  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  45.76 
 
 		 144 aa  42  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4727  dinucleoside polyphosphate hydrolase  40 
 
 		 170 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.78787  normal  0.0128864 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0237  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 		 229 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.619114 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>