203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2138 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2138  MutT/NUDIX family mutator protein  100 
 
 
151 aa  309  1e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.728608  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3209  NUDIX hydrolase  31.86 
 
 
134 aa  56.2  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.663648  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  30.97 
 
 
156 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3328  NUDIX hydrolase  30.33 
 
 
160 aa  54.7  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.672481  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1930  NUDIX hydrolase  32.43 
 
 
151 aa  51.6  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.104334  normal  0.229344 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  29.46 
 
 
155 aa  50.8  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  25.95 
 
 
155 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  25.95 
 
 
155 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5041  NUDIX hydrolase  29.03 
 
 
148 aa  50.8  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.216707 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  26.72 
 
 
155 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  29.51 
 
 
160 aa  50.4  0.000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3822  NUDIX hydrolase  33.87 
 
 
145 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0439  NUDIX hydrolase  33.87 
 
 
145 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  41.27 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  39.02 
 
 
137 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2270  NUDIX hydrolase  30.71 
 
 
174 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.792713 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  41.27 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  27.52 
 
 
155 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1185  ADP-ribose pyrophosphatase  33.33 
 
 
164 aa  48.9  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.792217  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  27.52 
 
 
155 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  27.52 
 
 
155 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  35 
 
 
134 aa  48.1  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3895  NUDIX hydrolase  32.31 
 
 
151 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  52.27 
 
 
155 aa  47.4  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0575  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 
161 aa  47.4  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0467  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
135 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1383  NUDIX hydrolase  31.63 
 
 
193 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.744983 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4018  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 
154 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0464  MutT/nudix family protein  33.33 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3658  mutator MutT protein  44.62 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236932  normal  0.362443 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  29.84 
 
 
347 aa  47  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  41.56 
 
 
144 aa  47  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  35.8 
 
 
137 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  37.66 
 
 
136 aa  46.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  27.52 
 
 
154 aa  45.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3290  NUDIX hydrolase  27.68 
 
 
120 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4889  hypothetical protein  27.34 
 
 
337 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  38.96 
 
 
133 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3562  NUDIX hydrolase  32.46 
 
 
135 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0463  NUDIX hydrolase  34.04 
 
 
135 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0597  NUDIX hydrolase  39.71 
 
 
133 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2689  NUDIX hydrolase  31.48 
 
 
141 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5262  NUDIX hydrolase  43.18 
 
 
240 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2957  MutT/nudix family protein  43.55 
 
 
159 aa  45.1  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2084  hypothetical protein  40.98 
 
 
319 aa  45.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.498942 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2844  cytidyltransferase-related domain-containing protein  26.83 
 
 
342 aa  45.1  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  35.9 
 
 
142 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  28.46 
 
 
136 aa  45.1  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5351  NUDIX hydrolase  43.18 
 
 
239 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5641  NUDIX hydrolase  43.18 
 
 
239 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2784  NUDIX hydrolase  31.48 
 
 
141 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.801073  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  26.61 
 
 
155 aa  44.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1412  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.68 
 
 
138 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559865  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2758  putative mut-like protein  29.46 
 
 
163 aa  44.7  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  46.15 
 
 
302 aa  45.1  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2640  MutT/nudix family protein  43.55 
 
 
159 aa  45.1  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0434568  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0710  NUDIX hydrolase  27.78 
 
 
154 aa  44.7  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  27.68 
 
 
139 aa  44.7  0.0005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2650  hypothetical protein  26.95 
 
 
315 aa  44.3  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  36.25 
 
 
138 aa  44.3  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3612  MutT/nudix family protein  30.77 
 
 
169 aa  44.3  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.463705  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  29.69 
 
 
146 aa  44.3  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3543  NUDIX hydrolase  29.46 
 
 
160 aa  43.9  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291144  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2696  mutT/nudix family protein  30 
 
 
128 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0531307  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5852  NUDIX hydrolase  26.72 
 
 
122 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1182  NUDIX hydrolase  29.81 
 
 
147 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  28.69 
 
 
138 aa  43.9  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  48.08 
 
 
318 aa  43.9  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2258  putative NUDIX hydrolase  32.29 
 
 
173 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  38.71 
 
 
316 aa  43.9  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  40.26 
 
 
132 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3429  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 
129 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  40.26 
 
 
132 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  41.94 
 
 
135 aa  43.5  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1694  NUDIX hydrolase  29.81 
 
 
138 aa  43.9  0.0009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.253225 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  40.26 
 
 
132 aa  43.5  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  28.81 
 
 
229 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1303  NUDIX hydrolase  26.52 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3464  NUDIX hydrolase  30.91 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.815689  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2021  NUDIX hydrolase  27.21 
 
 
158 aa  43.5  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00226256 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0011  NUDIX hydrolase  29.69 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.695589  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1874  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.23 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400032  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  26.73 
 
 
155 aa  43.5  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1860  NUDIX hydrolase  31.53 
 
 
153 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00730748  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3311  NUDIX hydrolase  29.57 
 
 
147 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  41.18 
 
 
132 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5787  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 
238 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1043  NUDIX hydrolase  52.94 
 
 
238 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4759  NUDIX hydrolase  25.37 
 
 
203 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.420324 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2614  NUDIX hydrolase  43.06 
 
 
152 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.349258  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3754  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 
132 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1905  NUDIX hydrolase  43.4 
 
 
377 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.173427  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2430  NUDIX hydrolase  32.1 
 
 
132 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.709971  normal  0.0238883 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1913  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  30 
 
 
355 aa  42.4  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.680637  decreased coverage  0.0000316043 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7377  NUDIX hydrolase  52.78 
 
 
169 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  54.55 
 
 
139 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  35.8 
 
 
150 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3231  NUDIX hydrolase  29.25 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000311334 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
138 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  39.06 
 
 
334 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>