More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0097 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0097  NUDIX hydrolase  100 
 
 
151 aa  290  6e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00520  ADP-ribose pyrophosphatase  65.71 
 
 
145 aa  185  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.129301 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0183  NUDIX hydrolase  67.97 
 
 
153 aa  172  9.999999999999999e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0048  NUDIX hydrolase  68.91 
 
 
166 aa  159  1e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.393224  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3865  NUDIX hydrolase  54.48 
 
 
156 aa  152  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.63405  normal  0.664134 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1131  NUDIX hydrolase  59.54 
 
 
132 aa  141  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0202346 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1487  NUDIX hydrolase  58.91 
 
 
147 aa  130  5e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000137627 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1484  NUDIX hydrolase  51.88 
 
 
138 aa  125  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8468  NUDIX hydrolase  53.6 
 
 
130 aa  106  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410235  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14530  ADP-ribose pyrophosphatase  48.97 
 
 
170 aa  103  6e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0742  NUDIX hydrolase  45.03 
 
 
169 aa  102  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.478674 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3053  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 
128 aa  96.3  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0321786  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3838  NUDIX hydrolase  49.62 
 
 
144 aa  95.1  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0218718  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4321  NUDIX hydrolase  50.85 
 
 
291 aa  94.4  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3866  NUDIX hydrolase  48.51 
 
 
167 aa  94  6e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.190486  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0863  NUDIX hydrolase  49.62 
 
 
153 aa  92.8  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.522755 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1154  NUDIX hydrolase  52.38 
 
 
124 aa  90.9  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.271981  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2457  putative mutT-like protein  46.1 
 
 
147 aa  89  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  37.5 
 
 
139 aa  88.2  4e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4152  NUDIX hydrolase  40.3 
 
 
128 aa  87.8  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0641206  decreased coverage  0.0000968848 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1106  NUDIX hydrolase  47.01 
 
 
145 aa  85.5  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00400603  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3078  NUDIX hydrolase  41.01 
 
 
134 aa  85.5  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3770  NUDIX hydrolase  39.42 
 
 
200 aa  84.7  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.288059 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  51.85 
 
 
570 aa  83.2  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1237  NUDIX hydrolase  38.78 
 
 
137 aa  82  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1890  Mutator MutT  35.38 
 
 
142 aa  79  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.620209 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1863  NUDIX hydrolase  40.14 
 
 
132 aa  78.2  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.477977  normal  0.665179 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0634  NUDIX hydrolase  36.43 
 
 
143 aa  76.6  0.00000000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2482  NUDIX hydrolase  39.67 
 
 
138 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1790  NUDIX hydrolase  38.26 
 
 
154 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  40.58 
 
 
132 aa  75.1  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0356  mutator MutT protein  36.92 
 
 
136 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  40.74 
 
 
137 aa  74.7  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  40.44 
 
 
137 aa  74.7  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  40.74 
 
 
142 aa  74.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1617  NUDIX hydrolase  34.53 
 
 
132 aa  74.3  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267139  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  41.48 
 
 
138 aa  74.3  0.0000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  41.48 
 
 
138 aa  74.3  0.0000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  39.71 
 
 
135 aa  72.8  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  39.01 
 
 
134 aa  73.2  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  42.22 
 
 
334 aa  72.4  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4272  NUDIX hydrolase  40 
 
 
132 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.841219  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  40.3 
 
 
129 aa  72.4  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0910  NUDIX hydrolase  36.44 
 
 
141 aa  72.4  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4043  NUDIX hydrolase  40 
 
 
132 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.62945  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0755  NUDIX hydrolase  42.48 
 
 
267 aa  72.8  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0414471  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  40.74 
 
 
138 aa  72.8  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4118  NUDIX hydrolase  40 
 
 
132 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  42.03 
 
 
132 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4548  NUDIX hydrolase  38.69 
 
 
148 aa  72  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.223367  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2154  NUDIX hydrolase  39.2 
 
 
206 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.114898  hitchhiker  0.00867781 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  33.59 
 
 
363 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17541  A/G-specific DNA glycosylase  32.84 
 
 
399 aa  71.6  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  40.74 
 
 
138 aa  71.6  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  40 
 
 
137 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0574  mutator MutT protein  31.54 
 
 
139 aa  71.2  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.37378  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  40.34 
 
 
138 aa  71.2  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  41.3 
 
 
132 aa  70.9  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0099  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  36.92 
 
 
396 aa  70.9  0.000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0722569  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  41.3 
 
 
132 aa  70.9  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11810  ADP-ribose pyrophosphatase  35.71 
 
 
131 aa  70.5  0.000000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1486  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 
131 aa  70.5  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00282357  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3691  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 
141 aa  69.7  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.27613 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0597  NUDIX hydrolase  39.86 
 
 
133 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  41.43 
 
 
135 aa  70.1  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31180  ADP-ribose pyrophosphatase  43.61 
 
 
133 aa  70.1  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.3856  normal  0.753153 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  42.22 
 
 
144 aa  70.1  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  39.26 
 
 
138 aa  68.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  38.52 
 
 
150 aa  68.6  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01721  adenine glycosylase  33.1 
 
 
400 aa  68.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 
133 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  40.58 
 
 
347 aa  67.4  0.00000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2716  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.78 
 
 
133 aa  67.8  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  41.48 
 
 
135 aa  67.4  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11185  mutator protein mutT  40.94 
 
 
141 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0122522  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2204  NUDIX hydrolase  38.66 
 
 
141 aa  67.4  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3099  mutator protein; oxidative damage repair protein  30.83 
 
 
137 aa  67.4  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  41.3 
 
 
132 aa  67  0.00000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20801  adenine glycosylase  31.15 
 
 
384 aa  67  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2053  MutT/nudix family protein  30.53 
 
 
132 aa  66.6  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.381111  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2293  mutator MutT protein  34.09 
 
 
129 aa  66.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.192428  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  40.68 
 
 
138 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2984  NUDIX hydrolase  36.8 
 
 
136 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000021571  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1931  NUDIX hydrolase  33.83 
 
 
133 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000285208  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0356  mutator MutT protein  40.68 
 
 
138 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0223709  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  39.26 
 
 
136 aa  65.5  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2414  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 
126 aa  65.5  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143725  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  43.2 
 
 
136 aa  65.5  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0312  mutator MutT protein  40.68 
 
 
138 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.672809  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1106  NUDIX hydrolase  40.18 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000361121  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  31.58 
 
 
360 aa  65.5  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1907  NUDIX hydrolase  36.57 
 
 
149 aa  65.5  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397506  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5502  NUDIX hydrolase  37.69 
 
 
134 aa  64.7  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.985254 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2045  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.93 
 
 
138 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1205  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  30.33 
 
 
384 aa  65.1  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  63.49 
 
 
151 aa  64.7  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1428  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.93 
 
 
138 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522134  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1102  NUDIX hydrolase  40.6 
 
 
136 aa  64.7  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.142351  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1395  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.93 
 
 
138 aa  64.3  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1874  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.93 
 
 
138 aa  64.7  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400032  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>