98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3288 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3288  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 180 aa  357  6e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.549331 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3520  NUDIX hydrolase  87.22 
 
 		 180 aa  317  7e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00645734 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4123  NUDIX hydrolase  51.88 
 
 		 181 aa  135  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3733  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  30.72 
 
 		 150 aa  62  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0829824  normal  0.0242018 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  31.88 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1946  NUDIX hydrolase  34.91 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0631  NUDIX hydrolase  36.63 
 
 		 144 aa  52  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2852  NUDIX hydrolase  33.88 
 
 		 157 aa  51.2  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000177474  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4178  hydrolase, NUDIX family  33.06 
 
 		 154 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0036026 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1690  NUDIX hydrolase  31.13 
 
 		 184 aa  49.7  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000764223 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0635  NUDIX/MutT family protein  32.71 
 
 		 170 aa  49.7  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.318355  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4063  mutT/nudix family protein  33.06 
 
 		 141 aa  49.3  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000339826  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4380  mutT/nudix family protein  33.06 
 
 		 141 aa  49.3  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000407544  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3901  MutT/Nudix family protein  33.06 
 
 		 154 aa  49.3  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000267829  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0774  NUDIX hydrolase  31.48 
 
 		 171 aa  48.9  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6876  putative ATP/GTP-binding protein  29.06 
 
 		 175 aa  48.9  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4229  mutT/nudix family protein  33.06 
 
 		 154 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000345145  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1221  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 		 221 aa  47.8  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8438  NUDIX hydrolase  32.2 
 
 		 157 aa  47.8  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.370098 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4287  hydrolase, NUDIX family  32.26 
 
 		 152 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000426319  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7095  NUDIX hydrolase  30.15 
 
 		 155 aa  47.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.337747  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2666  NUDIX hydrolase  31.65 
 
 		 182 aa  47.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.167572 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4267  hydrolase, NUDIX family  40.54 
 
 		 154 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.555582  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1428  NUDIX hydrolase  32.61 
 
 		 170 aa  46.6  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.516023  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5221  NUDIX hydrolase  47.83 
 
 		 333 aa  45.8  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.239365  normal  0.144046 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3998  NUDIX hydrolase  32.23 
 
 		 154 aa  46.2  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0404394  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1932  NUDIX hydrolase  35.37 
 
 		 221 aa  46.2  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3942  putative NUDIX-like hydrolase  35.8 
 
 		 167 aa  45.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180458  normal  0.438057 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  29.29 
 
 		 156 aa  45.4  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3449  dinucleoside polyphosphate hydrolase  29.55 
 
 		 171 aa  45.8  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.96666  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3290  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 		 120 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  31.97 
 
 		 152 aa  45.4  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0967  hydrolase, NUDIX family  40.54 
 
 		 154 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00369926  normal  0.920839 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4020  ADP-ribose pyrophosphatase  38.1 
 
 		 143 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1178  NUDIX hydrolase  29.57 
 
 		 156 aa  45.1  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0049447  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2758  putative mut-like protein  31.43 
 
 		 163 aa  45.1  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  27.62 
 
 		 229 aa  44.7  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2655  NUDIX hydrolase  32.47 
 
 		 161 aa  44.7  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3909  MutT/Nudix family protein  32.23 
 
 		 154 aa  44.7  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0016299  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2430  NUDIX hydrolase  39.47 
 
 		 132 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.709971  normal  0.0238883 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0069  NUDIX hydrolase  35.63 
 
 		 221 aa  44.3  0.0009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.509046 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0324  putative MutT family protein  36.09 
 
 		 325 aa  43.9  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3483  NUDIX hydrolase  30.58 
 
 		 142 aa  44.3  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1603  NUDIX/MutT family protein  31.43 
 
 		 164 aa  43.9  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.79603  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2696  mutT/nudix family protein  43.24 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0531307  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1860  NUDIX hydrolase  27.88 
 
 		 153 aa  43.9  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00730748  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0616  mutT/nudix family protein  27.27 
 
 		 169 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189637  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0457  NUDIX hydrolase  29.57 
 
 		 153 aa  43.9  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0641725  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02389  hypothetical protein  27.34 
 
 		 480 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1097  NUDIX hydrolase  33.03 
 
 		 305 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0508  NUDIX hydrolase  31.3 
 
 		 157 aa  43.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0799439  hitchhiker  0.00145151 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1807  mutator MutT-like  34.69 
 
 		 148 aa  43.1  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.829238  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4760  mutT/nudix family protein  29.57 
 
 		 153 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000960716  hitchhiker  5.01668e-23 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  36.9 
 
 		 144 aa  43.1  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 334 aa  42.4  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1281  NUDIX hydrolase  31.76 
 
 		 156 aa  42.4  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5155  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 		 222 aa  42.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.418641 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2404  NUDIX hydrolase  36.25 
 
 		 187 aa  42.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.387956  normal  0.764687 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1249  NUDIX hydrolase  28.7 
 
 		 156 aa  42.4  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000159356 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2940  mutT-like protein  37.35 
 
 		 155 aa  42.7  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.703961  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1811  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 		 145 aa  42.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6512  NUDIX hydrolase  32.59 
 
 		 167 aa  42.4  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.877846  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1730  NUDIX hydrolase  31.09 
 
 		 137 aa  42.4  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5518  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 		 183 aa  42.7  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0756  NUDIX hydrolase  25.45 
 
 		 230 aa  42.4  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229185  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2030  mutT/nudix family protein  26.67 
 
 		 153 aa  42  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.83484e-43 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1825  MutT/Nudix family protein  26.67 
 
 		 153 aa  42  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200422  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1999  mutT/nudix family protein  27.88 
 
 		 153 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00120864  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1854  mutT/nudix family protein  26.67 
 
 		 153 aa  42  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2094  mutT/nudix family protein  26.67 
 
 		 153 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1997  mutT/nudix family protein  26.67 
 
 		 153 aa  42  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000428877  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1181  ADP-ribose pyrophosphatase  28 
 
 		 181 aa  42  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.152697  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1809  MutT/Nudix family protein  26.67 
 
 		 153 aa  42  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00380434  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0157  hydrolase, NUDIX family  35.21 
 
 		 149 aa  42  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0149  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 171 aa  42  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0618  NUDIX hydrolase  35.42 
 
 		 166 aa  42  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003180  MutT/nudix family protein  37.1 
 
 		 96 aa  42  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3309  NUDIX hydrolase  29.84 
 
 		 153 aa  42  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1609  Nucleotide-binding protein  32.22 
 
 		 484 aa  41.6  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5104  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  29.03 
 
 		 345 aa  42  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180722  normal  0.842074 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3330  mutT/nudix family protein  26.67 
 
 		 153 aa  42  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371651  unclonable  1.49498e-25 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2258  NUDIX hydrolase  30.22 
 
 		 187 aa  42  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0325  NUDIX hydrolase  30.08 
 
 		 138 aa  42  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414078  normal  0.0748688 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5579  NUDIX hydrolase  34.35 
 
 		 173 aa  41.6  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0578  mutT/nudix family protein  28.95 
 
 		 153 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000245736  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3076  NUDIX hydrolase  29.23 
 
 		 216 aa  41.6  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4501  NUDIX hydrolase  39.34 
 
 		 322 aa  41.6  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15360  ADP-ribose pyrophosphatase  31.36 
 
 		 152 aa  41.6  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.314217  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3853  NUDIX hydrolase  25.71 
 
 		 149 aa  41.2  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.785148  n/a   
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9419  hypothetical protein  37.68 
 
 		 361 aa  41.2  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5001  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 		 156 aa  41.6  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  32.77 
 
 		 141 aa  41.2  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4001  NUDIX hydrolase  31.53 
 
 		 141 aa  41.2  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  33.07 
 
 		 140 aa  41.2  0.008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4365  NUDIX hydrolase  31.53 
 
 		 141 aa  41.2  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0463  NUDIX hydrolase  25 
 
 		 135 aa  40.8  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1911  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 		 167 aa  41.2  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.389177 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2534  NUDIX hydrolase  26.98 
 
 		 153 aa  41.2  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>