96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0358 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0358  dATP pyrophosphohydrolase  100 
 
 		 161 aa  332  1e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0343  dATP pyrophosphohydrolase  97.52 
 
 		 161 aa  327  4e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0468  dATP pyrophosphohydrolase  88.81 
 
 		 162 aa  268  2.9999999999999997e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.379603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0441  dATP pyrophosphohydrolase  70.27 
 
 		 163 aa  219  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0380  dATP pyrophosphohydrolase  63.98 
 
 		 173 aa  213  9e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.1829 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6051  dATP pyrophosphohydrolase  68.39 
 
 		 164 aa  206  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0575  dATP pyrophosphohydrolase  68.18 
 
 		 164 aa  206  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.725095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2751  dATP pyrophosphohydrolase  68.87 
 
 		 164 aa  203  9e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2724  dATP pyrophosphohydrolase  68.87 
 
 		 164 aa  203  9e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0331777  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2112  dATP pyrophosphohydrolase  68.87 
 
 		 164 aa  203  9e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0561  dATP pyrophosphohydrolase  67.76 
 
 		 158 aa  202  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2775  dATP pyrophosphohydrolase  68.87 
 
 		 170 aa  203  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2642  dATP pyrophosphohydrolase  68.21 
 
 		 164 aa  201  5e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.187691 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0692  dATP pyrophosphohydrolase  67.76 
 
 		 158 aa  200  8e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0194  dATP pyrophosphohydrolase  67.76 
 
 		 158 aa  200  8e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0853  dATP pyrophosphohydrolase  67.76 
 
 		 158 aa  200  8e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2407  dATP pyrophosphohydrolase  67.76 
 
 		 158 aa  200  8e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2327  dATP pyrophosphohydrolase  67.76 
 
 		 158 aa  200  8e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2751  dATP pyrophosphohydrolase  67.76 
 
 		 158 aa  200  8e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0677  dATP pyrophosphohydrolase  68.21 
 
 		 158 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22126  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4042  dATP pyrophosphohydrolase  64.47 
 
 		 192 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.258324  normal  0.25029 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0657  dATP pyrophosphohydrolase  66 
 
 		 171 aa  190  9e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4015  NUDIX hydrolase  66.67 
 
 		 163 aa  186  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000561567 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0867  dATP pyrophosphohydrolase  65.97 
 
 		 148 aa  184  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.198511 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1298  dATP pyrophosphohydrolase  63.64 
 
 		 170 aa  183  8e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0910  dATP pyrophosphohydrolase  64.08 
 
 		 154 aa  183  9e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.429333  normal  0.400014 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1071  putative dATP pyrophosphohydrolase  63.27 
 
 		 160 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.284114  normal  0.221269 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0382  NUDIX hydrolase  60 
 
 		 158 aa  177  7e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120045  normal  0.571576 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0444  dATP pyrophosphohydrolase  62.76 
 
 		 146 aa  174  4e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.847222 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0604  dATP pyrophosphohydrolase  62.14 
 
 		 157 aa  171  5e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4121  NUDIX hydrolase  62.16 
 
 		 157 aa  170  5.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0631  dATP pyrophosphohydrolase  59.44 
 
 		 150 aa  168  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.12041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1596  NUDIX hydrolase  61.97 
 
 		 147 aa  166  8e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.159893  normal  0.642184 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1891  NUDIX hydrolase  57.75 
 
 		 152 aa  165  2e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000678046  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2382  dATP pyrophosphohydrolase  56.76 
 
 		 159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.830787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0805  NUDIX hydrolase  58.33 
 
 		 156 aa  152  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.826654  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0876  NUDIX hydrolase  57.64 
 
 		 156 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0246946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3635  NUDIX hydrolase  57.05 
 
 		 174 aa  147  6e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5451  NUDIX hydrolase  53.33 
 
 		 161 aa  131  5e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01728  dATP pyrophosphohydrolase  46.1 
 
 		 146 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00223975  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2239  dATP pyrophosphohydrolase  47.79 
 
 		 148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1321  dATP pyrophosphohydrolase  48.28 
 
 		 147 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.832088  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2261  dATP pyrophosphohydrolase  47.18 
 
 		 149 aa  108  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.995735  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1767  dATP pyrophosphohydrolase  48.25 
 
 		 169 aa  107  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.502024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1107  dATP pyrophosphohydrolase  47.55 
 
 		 150 aa  107  7.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2601  dATP pyrophosphohydrolase  47.55 
 
 		 169 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.110942  normal  0.760647 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01824  hypothetical protein  47.55 
 
 		 150 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.452157  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01836  dATP pyrophosphohydrolase  47.55 
 
 		 150 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.618356  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1775  NUDIX hydrolase  47.55 
 
 		 169 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00597986  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2095  dATP pyrophosphohydrolase  47.55 
 
 		 150 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0764827  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1958  dATP pyrophosphohydrolase  47.55 
 
 		 150 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.683601  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2425  dATP pyrophosphohydrolase  44.37 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.135739  normal  0.252272 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2034  dATP pyrophosphohydrolase  44.37 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0350059  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2147  dATP pyrophosphohydrolase  44.37 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2114  dATP pyrophosphohydrolase  48.57 
 
 		 150 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00720061 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2054  dATP pyrophosphohydrolase  48.57 
 
 		 150 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.830611 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1223  dATP pyrophosphohydrolase  48.57 
 
 		 150 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.315157  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2059  dATP pyrophosphohydrolase  48.57 
 
 		 146 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0369752 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1347  dATP pyrophosphohydrolase  48.57 
 
 		 150 aa  104  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00224987 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1816  dATP pyrophosphohydrolase  47.18 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.825247  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0507  dATP pyrophosphohydrolase  42.25 
 
 		 150 aa  102  3e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2159  dATP pyrophosphohydrolase  47.18 
 
 		 154 aa  102  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2433  dATP pyrophosphohydrolase  45.07 
 
 		 147 aa  102  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0218705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2100  dATP pyrophosphohydrolase  45.77 
 
 		 147 aa  99.8  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2780  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 		 148 aa  94.4  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0389222  normal  0.0318131 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2947  dATP pyrophosphohydrolase  42.86 
 
 		 127 aa  84.3  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.214504  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2065  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  36.67 
 
 		 156 aa  57  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0730  NUDIX hydrolase  43.3 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.189359  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4065  NUDIX hydrolase  29.71 
 
 		 143 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  32.54 
 
 		 365 aa  48.5  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  32.54 
 
 		 365 aa  48.5  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  33.33 
 
 		 365 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1999  lipoate-protein ligase B  36 
 
 		 383 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2976  NUDIX hydrolase  40.51 
 
 		 162 aa  44.7  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0885  NUDIX hydrolase  28.28 
 
 		 145 aa  44.7  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1647  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 		 157 aa  43.9  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.654975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3131  NUDIX hydrolase  28.28 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.278733  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2534  NUDIX hydrolase  27.87 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0610  NUDIX hydrolase  25.64 
 
 		 178 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0690731 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  37.68 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1352  NUDIX family hydrolase  33.33 
 
 		 153 aa  41.2  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.468385 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1336  NUDIX family hydrolase  33.33 
 
 		 153 aa  41.2  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0415939 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1949  hydrolase, NUDIX family  33.33 
 
 		 153 aa  41.2  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2131  NUDIX family hydrolase  33.33 
 
 		 153 aa  41.2  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480915 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1314  NUDIX family hydrolase  33.33 
 
 		 153 aa  41.2  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.137933 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1595  hydrolase, NUDIX family  33.33 
 
 		 153 aa  40.4  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000876504 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2469  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 153 aa  40.4  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0565  NUDIX hydrolase  25 
 
 		 177 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2513  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 153 aa  40.4  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00897802  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2062  NUDIX hydrolase  27.46 
 
 		 150 aa  40.8  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.894699  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1297  NUDIX family hydrolase  33.33 
 
 		 153 aa  40.4  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1991  NUDIX family hydrolase  33.33 
 
 		 153 aa  40.4  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1254  NUDIX family hydrolase  33.33 
 
 		 153 aa  40.4  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.440982  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01140  hypothetical protein  33.33 
 
 		 153 aa  40.4  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01132  bifunctional thiamin pyrimidine pyrophosphate hydrolase/ thiamin pyrophosphate hydrolase  33.33 
 
 		 153 aa  40.4  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1312  hydrolase, NUDIX family  33.33 
 
 		 153 aa  40.4  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.869507  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>