96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5451 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_5451  NUDIX hydrolase  100 
 
 
161 aa  334  2.9999999999999997e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0805  NUDIX hydrolase  66.44 
 
 
156 aa  196  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.826654  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0876  NUDIX hydrolase  65.77 
 
 
156 aa  194  3e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0246946  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3635  NUDIX hydrolase  62.5 
 
 
174 aa  173  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1298  dATP pyrophosphohydrolase  57.42 
 
 
170 aa  169  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0910  dATP pyrophosphohydrolase  59.73 
 
 
154 aa  165  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.429333  normal  0.400014 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4015  NUDIX hydrolase  58.94 
 
 
163 aa  163  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000561567 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1071  putative dATP pyrophosphohydrolase  56.05 
 
 
160 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.284114  normal  0.221269 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0867  dATP pyrophosphohydrolase  57.14 
 
 
148 aa  159  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.198511 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0444  dATP pyrophosphohydrolase  58.94 
 
 
146 aa  156  1e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.847222 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2751  dATP pyrophosphohydrolase  53.9 
 
 
164 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2112  dATP pyrophosphohydrolase  53.9 
 
 
164 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2724  dATP pyrophosphohydrolase  53.9 
 
 
164 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0331777  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0575  dATP pyrophosphohydrolase  53.9 
 
 
164 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.725095  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6051  dATP pyrophosphohydrolase  53.25 
 
 
164 aa  142  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4121  NUDIX hydrolase  53.59 
 
 
157 aa  142  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2775  dATP pyrophosphohydrolase  53.25 
 
 
170 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2642  dATP pyrophosphohydrolase  53.25 
 
 
164 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.187691 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0561  dATP pyrophosphohydrolase  53.25 
 
 
158 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2327  dATP pyrophosphohydrolase  53.25 
 
 
158 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2751  dATP pyrophosphohydrolase  53.25 
 
 
158 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0677  dATP pyrophosphohydrolase  51.95 
 
 
158 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22126  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0692  dATP pyrophosphohydrolase  53.25 
 
 
158 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2407  dATP pyrophosphohydrolase  53.25 
 
 
158 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0194  dATP pyrophosphohydrolase  53.25 
 
 
158 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0853  dATP pyrophosphohydrolase  53.25 
 
 
158 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4042  dATP pyrophosphohydrolase  50.96 
 
 
192 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.258324  normal  0.25029 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0604  dATP pyrophosphohydrolase  54.11 
 
 
157 aa  131  3e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0358  dATP pyrophosphohydrolase  53.33 
 
 
161 aa  131  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1891  NUDIX hydrolase  49.66 
 
 
152 aa  130  5e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000678046  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0343  dATP pyrophosphohydrolase  52.67 
 
 
161 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0657  dATP pyrophosphohydrolase  50.64 
 
 
171 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0382  NUDIX hydrolase  50.32 
 
 
158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120045  normal  0.571576 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0380  dATP pyrophosphohydrolase  52.74 
 
 
173 aa  128  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.1829 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0468  dATP pyrophosphohydrolase  52.98 
 
 
162 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.379603  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0441  dATP pyrophosphohydrolase  51.97 
 
 
163 aa  123  8.000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2382  dATP pyrophosphohydrolase  46.25 
 
 
159 aa  123  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.830787  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1596  NUDIX hydrolase  52.67 
 
 
147 aa  122  3e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.159893  normal  0.642184 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0631  dATP pyrophosphohydrolase  46.31 
 
 
150 aa  115  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.12041  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01728  dATP pyrophosphohydrolase  46.26 
 
 
146 aa  110  6e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00223975  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2239  dATP pyrophosphohydrolase  46.48 
 
 
148 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0507  dATP pyrophosphohydrolase  41.38 
 
 
150 aa  93.6  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1347  dATP pyrophosphohydrolase  43.36 
 
 
150 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00224987 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1223  dATP pyrophosphohydrolase  43.36 
 
 
150 aa  89.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.315157  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2054  dATP pyrophosphohydrolase  43.36 
 
 
150 aa  89.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.830611 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2114  dATP pyrophosphohydrolase  43.36 
 
 
150 aa  89.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00720061 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2059  dATP pyrophosphohydrolase  43.36 
 
 
146 aa  89.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0369752 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1321  dATP pyrophosphohydrolase  42.36 
 
 
147 aa  87.8  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.832088  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2261  dATP pyrophosphohydrolase  43.45 
 
 
149 aa  87.4  8e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.995735  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1816  dATP pyrophosphohydrolase  45.14 
 
 
147 aa  87  9e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.825247  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2425  dATP pyrophosphohydrolase  40.69 
 
 
147 aa  87  9e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.135739  normal  0.252272 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2147  dATP pyrophosphohydrolase  40.69 
 
 
147 aa  87  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2034  dATP pyrophosphohydrolase  40.69 
 
 
147 aa  87  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0350059  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2159  dATP pyrophosphohydrolase  42.76 
 
 
154 aa  86.7  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2100  dATP pyrophosphohydrolase  43.75 
 
 
147 aa  83.6  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1767  dATP pyrophosphohydrolase  41.96 
 
 
169 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.502024  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01824  hypothetical protein  42.07 
 
 
150 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.452157  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1107  dATP pyrophosphohydrolase  42.07 
 
 
150 aa  82.8  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2601  dATP pyrophosphohydrolase  41.26 
 
 
169 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.110942  normal  0.760647 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1775  NUDIX hydrolase  41.26 
 
 
169 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00597986  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2095  dATP pyrophosphohydrolase  42.07 
 
 
150 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0764827  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1958  dATP pyrophosphohydrolase  42.07 
 
 
150 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.683601  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01836  dATP pyrophosphohydrolase  42.07 
 
 
150 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.618356  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2780  NUDIX hydrolase  42.47 
 
 
148 aa  80.5  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0389222  normal  0.0318131 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2433  dATP pyrophosphohydrolase  37.5 
 
 
147 aa  77  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0218705  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2947  dATP pyrophosphohydrolase  41.44 
 
 
127 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.214504  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  35.21 
 
 
365 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  33.8 
 
 
365 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  33.8 
 
 
365 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0626  MutT/nudix family protein  30.26 
 
 
161 aa  49.3  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000112131  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3059  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
174 aa  47  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0446727  normal  0.591536 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  43.08 
 
 
158 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1999  lipoate-protein ligase B  35.38 
 
 
383 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1412  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  29.93 
 
 
138 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559865  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1395  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  29.93 
 
 
138 aa  44.7  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1874  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  29.25 
 
 
138 aa  44.3  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400032  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2045  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  29.25 
 
 
138 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1428  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  29.25 
 
 
138 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522134  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2650  hypothetical protein  45 
 
 
315 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0595  NUDIX hydrolase  39.68 
 
 
156 aa  42.7  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.652543 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  38.57 
 
 
146 aa  42.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2095  NUDIX hydrolase  41.1 
 
 
327 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4065  NUDIX hydrolase  30.47 
 
 
143 aa  42.4  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1372  NUDIX hydrolase  36.62 
 
 
172 aa  42.4  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241238  normal  0.0421052 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1466  ADP-Ribose Pyrophosphatase  28.57 
 
 
146 aa  42  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3328  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 
160 aa  41.2  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.672481  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2287  mutT/nudix family protein  43.08 
 
 
156 aa  41.2  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1257  NUDIX hydrolase  46.43 
 
 
146 aa  41.2  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0324  NUDIX hydrolase  43.86 
 
 
134 aa  41.2  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5579  NUDIX hydrolase  45.31 
 
 
173 aa  40.8  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542924  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01716  hypothetical protein  41.94 
 
 
135 aa  40.8  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.15744  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1873  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.94 
 
 
135 aa  40.8  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.440168  hitchhiker  0.000083786 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1983  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.94 
 
 
135 aa  40.8  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000136061  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1883  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 
135 aa  40.8  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01728  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.94 
 
 
135 aa  40.8  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.10262  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2971  NUDIX hydrolase  35.9 
 
 
153 aa  40.4  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000073091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>