140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0604 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0604  dATP pyrophosphohydrolase  100 
 
 
157 aa  322  1e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0380  dATP pyrophosphohydrolase  67.79 
 
 
173 aa  199  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.1829 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0444  dATP pyrophosphohydrolase  69.34 
 
 
146 aa  196  1.0000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.847222 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1071  putative dATP pyrophosphohydrolase  62.99 
 
 
160 aa  191  3e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.284114  normal  0.221269 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4015  NUDIX hydrolase  61.33 
 
 
163 aa  174  3e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000561567 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0441  dATP pyrophosphohydrolase  62.41 
 
 
163 aa  173  9e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0468  dATP pyrophosphohydrolase  61.81 
 
 
162 aa  171  2.9999999999999996e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.379603  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0867  dATP pyrophosphohydrolase  60.14 
 
 
148 aa  171  3.9999999999999995e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.198511 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0358  dATP pyrophosphohydrolase  62.14 
 
 
161 aa  171  5e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0343  dATP pyrophosphohydrolase  61.43 
 
 
161 aa  170  5.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2382  dATP pyrophosphohydrolase  55.19 
 
 
159 aa  169  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.830787  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0631  dATP pyrophosphohydrolase  57.25 
 
 
150 aa  164  2.9999999999999998e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.12041  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0910  dATP pyrophosphohydrolase  56.38 
 
 
154 aa  162  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.429333  normal  0.400014 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4042  dATP pyrophosphohydrolase  56.6 
 
 
192 aa  159  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.258324  normal  0.25029 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0657  dATP pyrophosphohydrolase  53.94 
 
 
171 aa  158  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6051  dATP pyrophosphohydrolase  55.7 
 
 
164 aa  157  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2112  dATP pyrophosphohydrolase  55.7 
 
 
164 aa  157  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2724  dATP pyrophosphohydrolase  55.7 
 
 
164 aa  157  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0331777  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2751  dATP pyrophosphohydrolase  55.7 
 
 
164 aa  157  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1298  dATP pyrophosphohydrolase  52.6 
 
 
170 aa  157  8e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0805  NUDIX hydrolase  54.67 
 
 
156 aa  154  4e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.826654  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4121  NUDIX hydrolase  56.46 
 
 
157 aa  153  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0876  NUDIX hydrolase  54 
 
 
156 aa  152  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0246946  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2642  dATP pyrophosphohydrolase  53.69 
 
 
164 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.187691 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0575  dATP pyrophosphohydrolase  53.02 
 
 
164 aa  149  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.725095  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2775  dATP pyrophosphohydrolase  53.02 
 
 
170 aa  149  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0382  NUDIX hydrolase  53.69 
 
 
158 aa  144  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120045  normal  0.571576 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0561  dATP pyrophosphohydrolase  52.35 
 
 
158 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0194  dATP pyrophosphohydrolase  51.68 
 
 
158 aa  142  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0853  dATP pyrophosphohydrolase  51.68 
 
 
158 aa  142  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3635  NUDIX hydrolase  50.64 
 
 
174 aa  141  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2751  dATP pyrophosphohydrolase  51.68 
 
 
158 aa  142  3e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2327  dATP pyrophosphohydrolase  51.68 
 
 
158 aa  142  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0677  dATP pyrophosphohydrolase  51.68 
 
 
158 aa  141  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22126  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0692  dATP pyrophosphohydrolase  51.68 
 
 
158 aa  142  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2407  dATP pyrophosphohydrolase  51.68 
 
 
158 aa  142  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1891  NUDIX hydrolase  50 
 
 
152 aa  140  5e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000678046  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1596  NUDIX hydrolase  53.47 
 
 
147 aa  137  7.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.159893  normal  0.642184 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5451  NUDIX hydrolase  52.32 
 
 
161 aa  131  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01728  dATP pyrophosphohydrolase  46.38 
 
 
146 aa  120  6e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00223975  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2239  dATP pyrophosphohydrolase  45.95 
 
 
148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2114  dATP pyrophosphohydrolase  48.23 
 
 
150 aa  114  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00720061 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2054  dATP pyrophosphohydrolase  48.23 
 
 
150 aa  114  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.830611 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1223  dATP pyrophosphohydrolase  48.23 
 
 
150 aa  114  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.315157  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1347  dATP pyrophosphohydrolase  48.23 
 
 
150 aa  114  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00224987 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2059  dATP pyrophosphohydrolase  48.57 
 
 
146 aa  112  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0369752 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1775  NUDIX hydrolase  46.53 
 
 
169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00597986  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2601  dATP pyrophosphohydrolase  46.53 
 
 
169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.110942  normal  0.760647 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1767  dATP pyrophosphohydrolase  47.22 
 
 
169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.502024  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01836  dATP pyrophosphohydrolase  46.53 
 
 
150 aa  111  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.618356  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01824  hypothetical protein  46.53 
 
 
150 aa  111  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.452157  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1958  dATP pyrophosphohydrolase  46.53 
 
 
150 aa  111  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.683601  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2095  dATP pyrophosphohydrolase  46.53 
 
 
150 aa  111  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0764827  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1107  dATP pyrophosphohydrolase  46.53 
 
 
150 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1321  dATP pyrophosphohydrolase  47.89 
 
 
147 aa  110  6e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.832088  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0507  dATP pyrophosphohydrolase  42.95 
 
 
150 aa  107  5e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1816  dATP pyrophosphohydrolase  46.43 
 
 
147 aa  106  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.825247  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2261  dATP pyrophosphohydrolase  42.57 
 
 
149 aa  105  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.995735  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2159  dATP pyrophosphohydrolase  46.04 
 
 
154 aa  103  6e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2433  dATP pyrophosphohydrolase  45.32 
 
 
147 aa  104  6e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0218705  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2034  dATP pyrophosphohydrolase  44.6 
 
 
147 aa  103  9e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0350059  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2425  dATP pyrophosphohydrolase  44.6 
 
 
147 aa  103  9e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.135739  normal  0.252272 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2147  dATP pyrophosphohydrolase  44.6 
 
 
147 aa  103  9e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2100  dATP pyrophosphohydrolase  45 
 
 
147 aa  102  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2947  dATP pyrophosphohydrolase  42.86 
 
 
127 aa  92.8  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.214504  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2780  NUDIX hydrolase  41.01 
 
 
148 aa  82.8  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0389222  normal  0.0318131 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2065  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  33.33 
 
 
156 aa  62.4  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1417  NUDIX hydrolase  31.85 
 
 
139 aa  60.8  0.000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4065  NUDIX hydrolase  33.09 
 
 
143 aa  59.7  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2453  dATP pyrophosphohydrolase  30.07 
 
 
145 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.401359  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2488  dATP pyrophosphohydrolase  29.86 
 
 
145 aa  53.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000650379  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3131  NUDIX hydrolase  29.17 
 
 
145 aa  53.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.278733  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2528  mutT/nudix family protein  29.86 
 
 
145 aa  52.4  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0638585  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2713  mutT/nudix family protein  29.86 
 
 
145 aa  52.4  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0885  NUDIX hydrolase  29.66 
 
 
145 aa  52  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2776  mutT/nudix family protein  29.86 
 
 
146 aa  51.2  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  33.57 
 
 
365 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2570  mutT/nudix family protein  28.67 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0593331 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  33.57 
 
 
365 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2731  mutT/nudix family protein  29.5 
 
 
146 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2741  mutT/nudix family protein  28.47 
 
 
146 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191847  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0812  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 
166 aa  49.3  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.64339  normal  0.9117 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2727  mutT/nudix family protein  29.17 
 
 
145 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000208593 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  32.86 
 
 
365 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2287  mutT/nudix family protein  40.32 
 
 
156 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  42.62 
 
 
146 aa  47  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0710  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 
154 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2021  NUDIX hydrolase  32.97 
 
 
158 aa  47  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00226256 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3165  NUDIX hydrolase  53.06 
 
 
225 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.036982 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0736  NTP pyrophosphohydrolase including oxidative damage repair enzyme  26.85 
 
 
224 aa  45.4  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0862852  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1163  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 
140 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36667  predicted protein  44.83 
 
 
185 aa  44.7  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.179207 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  41.1 
 
 
137 aa  44.7  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  40.68 
 
 
154 aa  44.3  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2015  mutT/nudix family protein  45.9 
 
 
150 aa  44.3  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0857519  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  40.98 
 
 
153 aa  44.3  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3974  NUDIX hydrolase  33.63 
 
 
169 aa  44.3  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3582  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  30.66 
 
 
131 aa  43.9  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000334964  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0110  NUDIX hydrolase  40 
 
 
136 aa  43.5  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0575  NUDIX hydrolase  38.6 
 
 
157 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.773925  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>