73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0805 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0805  NUDIX hydrolase  100 
 
 
156 aa  323  6e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.826654  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0876  NUDIX hydrolase  98.08 
 
 
156 aa  316  9e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0246946  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5451  NUDIX hydrolase  66.44 
 
 
161 aa  196  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4015  NUDIX hydrolase  67.57 
 
 
163 aa  194  3e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000561567 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3635  NUDIX hydrolase  65.56 
 
 
174 aa  194  4.0000000000000005e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1298  dATP pyrophosphohydrolase  64 
 
 
170 aa  191  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4121  NUDIX hydrolase  65.77 
 
 
157 aa  191  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0867  dATP pyrophosphohydrolase  65.54 
 
 
148 aa  189  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.198511 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1071  putative dATP pyrophosphohydrolase  63.09 
 
 
160 aa  187  5.999999999999999e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.284114  normal  0.221269 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0910  dATP pyrophosphohydrolase  62.59 
 
 
154 aa  184  4e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.429333  normal  0.400014 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0561  dATP pyrophosphohydrolase  64.47 
 
 
158 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0575  dATP pyrophosphohydrolase  63.7 
 
 
164 aa  176  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.725095  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2642  dATP pyrophosphohydrolase  62.33 
 
 
164 aa  174  5e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.187691 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6051  dATP pyrophosphohydrolase  63.01 
 
 
164 aa  174  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0853  dATP pyrophosphohydrolase  63.16 
 
 
158 aa  173  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2775  dATP pyrophosphohydrolase  62.33 
 
 
170 aa  174  6e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2407  dATP pyrophosphohydrolase  63.16 
 
 
158 aa  173  6e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0692  dATP pyrophosphohydrolase  63.16 
 
 
158 aa  173  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0194  dATP pyrophosphohydrolase  63.16 
 
 
158 aa  173  6e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2751  dATP pyrophosphohydrolase  63.16 
 
 
158 aa  173  6e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2327  dATP pyrophosphohydrolase  63.16 
 
 
158 aa  173  6e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0677  dATP pyrophosphohydrolase  64.38 
 
 
158 aa  173  7e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22126  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2112  dATP pyrophosphohydrolase  62.33 
 
 
164 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2724  dATP pyrophosphohydrolase  62.33 
 
 
164 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0331777  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2751  dATP pyrophosphohydrolase  62.33 
 
 
164 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4042  dATP pyrophosphohydrolase  61.22 
 
 
192 aa  165  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.258324  normal  0.25029 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0380  dATP pyrophosphohydrolase  60.71 
 
 
173 aa  161  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.1829 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0657  dATP pyrophosphohydrolase  58.33 
 
 
171 aa  159  9e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0604  dATP pyrophosphohydrolase  56.74 
 
 
157 aa  153  8e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0358  dATP pyrophosphohydrolase  58.33 
 
 
161 aa  152  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0343  dATP pyrophosphohydrolase  57.64 
 
 
161 aa  152  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0468  dATP pyrophosphohydrolase  58.33 
 
 
162 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.379603  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0441  dATP pyrophosphohydrolase  57.79 
 
 
163 aa  150  7e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0382  NUDIX hydrolase  56.38 
 
 
158 aa  149  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120045  normal  0.571576 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0444  dATP pyrophosphohydrolase  56.55 
 
 
146 aa  148  3e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.847222 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1891  NUDIX hydrolase  53.57 
 
 
152 aa  140  5e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000678046  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2382  dATP pyrophosphohydrolase  52.98 
 
 
159 aa  135  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.830787  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1596  NUDIX hydrolase  57.34 
 
 
147 aa  135  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.159893  normal  0.642184 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0631  dATP pyrophosphohydrolase  51.41 
 
 
150 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.12041  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01728  dATP pyrophosphohydrolase  46.9 
 
 
146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00223975  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2239  dATP pyrophosphohydrolase  48.92 
 
 
148 aa  111  5e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0507  dATP pyrophosphohydrolase  41.84 
 
 
150 aa  97.4  7e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2059  dATP pyrophosphohydrolase  43.66 
 
 
146 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0369752 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2034  dATP pyrophosphohydrolase  41.84 
 
 
147 aa  85.9  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0350059  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2425  dATP pyrophosphohydrolase  41.84 
 
 
147 aa  85.9  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.135739  normal  0.252272 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2147  dATP pyrophosphohydrolase  41.84 
 
 
147 aa  85.9  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1321  dATP pyrophosphohydrolase  42.55 
 
 
147 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.832088  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2114  dATP pyrophosphohydrolase  42.96 
 
 
150 aa  84.7  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00720061 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2054  dATP pyrophosphohydrolase  42.96 
 
 
150 aa  84.7  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.830611 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1223  dATP pyrophosphohydrolase  42.96 
 
 
150 aa  84.7  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.315157  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1767  dATP pyrophosphohydrolase  42.25 
 
 
169 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.502024  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1816  dATP pyrophosphohydrolase  42.96 
 
 
147 aa  84.3  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.825247  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1107  dATP pyrophosphohydrolase  41.55 
 
 
150 aa  84.3  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2095  dATP pyrophosphohydrolase  41.55 
 
 
150 aa  84.3  6e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0764827  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1958  dATP pyrophosphohydrolase  41.55 
 
 
150 aa  84.3  6e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.683601  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01824  hypothetical protein  41.55 
 
 
150 aa  84.3  6e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.452157  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01836  dATP pyrophosphohydrolase  41.55 
 
 
150 aa  84.3  6e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.618356  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2601  dATP pyrophosphohydrolase  41.55 
 
 
169 aa  84  7e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.110942  normal  0.760647 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1775  NUDIX hydrolase  41.55 
 
 
169 aa  84  7e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00597986  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1347  dATP pyrophosphohydrolase  42.25 
 
 
150 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00224987 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2100  dATP pyrophosphohydrolase  42.25 
 
 
147 aa  83.2  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2261  dATP pyrophosphohydrolase  41.84 
 
 
149 aa  82.4  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.995735  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2947  dATP pyrophosphohydrolase  41.67 
 
 
127 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.214504  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2433  dATP pyrophosphohydrolase  41.13 
 
 
147 aa  80.9  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0218705  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2159  dATP pyrophosphohydrolase  41.84 
 
 
154 aa  79  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2780  NUDIX hydrolase  39.72 
 
 
148 aa  78.2  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0389222  normal  0.0318131 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2065  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  30 
 
 
156 aa  53.9  0.0000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  32.58 
 
 
365 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  32.61 
 
 
365 aa  48.5  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  32.61 
 
 
365 aa  48.5  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1417  NUDIX hydrolase  25.56 
 
 
139 aa  41.6  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 
158 aa  41.2  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1946  NUDIX hydrolase  51.72 
 
 
162 aa  40.4  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97992  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>