85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0657 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0657  dATP pyrophosphohydrolase  100 
 
 
171 aa  352  1e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4042  dATP pyrophosphohydrolase  88.89 
 
 
192 aa  312  9.999999999999999e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.258324  normal  0.25029 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0382  NUDIX hydrolase  73.72 
 
 
158 aa  240  9e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120045  normal  0.571576 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0561  dATP pyrophosphohydrolase  70.51 
 
 
158 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2751  dATP pyrophosphohydrolase  69.87 
 
 
158 aa  229  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2327  dATP pyrophosphohydrolase  69.87 
 
 
158 aa  229  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0194  dATP pyrophosphohydrolase  69.87 
 
 
158 aa  229  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0692  dATP pyrophosphohydrolase  69.87 
 
 
158 aa  229  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0853  dATP pyrophosphohydrolase  69.87 
 
 
158 aa  229  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2407  dATP pyrophosphohydrolase  69.87 
 
 
158 aa  229  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0677  dATP pyrophosphohydrolase  69.87 
 
 
158 aa  228  3e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22126  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0575  dATP pyrophosphohydrolase  71.05 
 
 
164 aa  225  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.725095  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6051  dATP pyrophosphohydrolase  68.63 
 
 
164 aa  217  7.999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2724  dATP pyrophosphohydrolase  68.63 
 
 
164 aa  215  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0331777  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2751  dATP pyrophosphohydrolase  68.63 
 
 
164 aa  215  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2112  dATP pyrophosphohydrolase  68.63 
 
 
164 aa  215  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2775  dATP pyrophosphohydrolase  67.32 
 
 
170 aa  214  5e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4015  NUDIX hydrolase  70.78 
 
 
163 aa  214  5e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000561567 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2642  dATP pyrophosphohydrolase  67.32 
 
 
164 aa  213  7e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.187691 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1071  putative dATP pyrophosphohydrolase  68.92 
 
 
160 aa  205  3e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.284114  normal  0.221269 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0867  dATP pyrophosphohydrolase  68.28 
 
 
148 aa  191  4e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.198511 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0358  dATP pyrophosphohydrolase  66 
 
 
161 aa  190  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0380  dATP pyrophosphohydrolase  62.09 
 
 
173 aa  188  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.1829 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4121  NUDIX hydrolase  67.57 
 
 
157 aa  187  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0343  dATP pyrophosphohydrolase  64.67 
 
 
161 aa  187  5e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0441  dATP pyrophosphohydrolase  62.75 
 
 
163 aa  186  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1298  dATP pyrophosphohydrolase  63.33 
 
 
170 aa  184  5e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0910  dATP pyrophosphohydrolase  62.84 
 
 
154 aa  179  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.429333  normal  0.400014 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0468  dATP pyrophosphohydrolase  64.63 
 
 
162 aa  179  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.379603  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1891  NUDIX hydrolase  60.93 
 
 
152 aa  174  4e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000678046  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1596  NUDIX hydrolase  63.19 
 
 
147 aa  169  1e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.159893  normal  0.642184 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0631  dATP pyrophosphohydrolase  56.29 
 
 
150 aa  167  5e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.12041  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0876  NUDIX hydrolase  58.33 
 
 
156 aa  160  8.000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0246946  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0805  NUDIX hydrolase  58.33 
 
 
156 aa  159  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.826654  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0604  dATP pyrophosphohydrolase  56.95 
 
 
157 aa  155  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3635  NUDIX hydrolase  56.85 
 
 
174 aa  150  5.9999999999999996e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0444  dATP pyrophosphohydrolase  56 
 
 
146 aa  147  8e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.847222 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2382  dATP pyrophosphohydrolase  50.64 
 
 
159 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.830787  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5451  NUDIX hydrolase  50.64 
 
 
161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2239  dATP pyrophosphohydrolase  44.37 
 
 
148 aa  107  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0507  dATP pyrophosphohydrolase  40.4 
 
 
150 aa  107  8.000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2034  dATP pyrophosphohydrolase  44.37 
 
 
147 aa  106  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0350059  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2147  dATP pyrophosphohydrolase  44.37 
 
 
147 aa  106  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2425  dATP pyrophosphohydrolase  44.37 
 
 
147 aa  106  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.135739  normal  0.252272 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1223  dATP pyrophosphohydrolase  43.45 
 
 
150 aa  99  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.315157  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1816  dATP pyrophosphohydrolase  45.77 
 
 
147 aa  99  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.825247  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2054  dATP pyrophosphohydrolase  43.45 
 
 
150 aa  99  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.830611 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2114  dATP pyrophosphohydrolase  43.45 
 
 
150 aa  99  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00720061 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2059  dATP pyrophosphohydrolase  43.66 
 
 
146 aa  98.2  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0369752 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2780  NUDIX hydrolase  42.25 
 
 
148 aa  97.8  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0389222  normal  0.0318131 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2100  dATP pyrophosphohydrolase  45.07 
 
 
147 aa  97.8  6e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1347  dATP pyrophosphohydrolase  43.45 
 
 
150 aa  97.8  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00224987 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2261  dATP pyrophosphohydrolase  43.66 
 
 
149 aa  97.4  8e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.995735  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2159  dATP pyrophosphohydrolase  43.66 
 
 
154 aa  95.9  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01728  dATP pyrophosphohydrolase  41.13 
 
 
146 aa  95.1  5e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00223975  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1767  dATP pyrophosphohydrolase  42.57 
 
 
169 aa  94.7  5e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.502024  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1321  dATP pyrophosphohydrolase  42.76 
 
 
147 aa  94.4  6e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.832088  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2601  dATP pyrophosphohydrolase  41.89 
 
 
169 aa  94.4  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.110942  normal  0.760647 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1775  NUDIX hydrolase  41.89 
 
 
169 aa  94.4  6e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00597986  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01824  hypothetical protein  41.89 
 
 
150 aa  94.4  8e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.452157  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2095  dATP pyrophosphohydrolase  41.89 
 
 
150 aa  94.4  8e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0764827  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1107  dATP pyrophosphohydrolase  41.89 
 
 
150 aa  94.4  8e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01836  dATP pyrophosphohydrolase  41.89 
 
 
150 aa  94.4  8e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.618356  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1958  dATP pyrophosphohydrolase  41.89 
 
 
150 aa  94.4  8e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.683601  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2433  dATP pyrophosphohydrolase  41.55 
 
 
147 aa  92.4  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0218705  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2947  dATP pyrophosphohydrolase  39.34 
 
 
127 aa  73.2  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.214504  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3131  NUDIX hydrolase  30.26 
 
 
145 aa  50.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.278733  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2570  mutT/nudix family protein  28.57 
 
 
146 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0593331 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0730  NUDIX hydrolase  34.96 
 
 
153 aa  47.8  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.189359  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0885  NUDIX hydrolase  29.87 
 
 
145 aa  47.8  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2065  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  28.87 
 
 
156 aa  46.6  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2776  mutT/nudix family protein  27.27 
 
 
146 aa  44.7  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4065  NUDIX hydrolase  29.49 
 
 
143 aa  43.9  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2731  mutT/nudix family protein  30.08 
 
 
146 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  32.76 
 
 
365 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2713  mutT/nudix family protein  28.1 
 
 
145 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2488  dATP pyrophosphohydrolase  28.1 
 
 
145 aa  43.9  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000650379  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2528  mutT/nudix family protein  28.1 
 
 
145 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0638585  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2727  mutT/nudix family protein  28.1 
 
 
145 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000208593 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2741  mutT/nudix family protein  25.97 
 
 
146 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191847  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2453  dATP pyrophosphohydrolase  28.1 
 
 
145 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.401359  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  42.62 
 
 
158 aa  42  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1399  NUDIX hydrolase  25.83 
 
 
138 aa  42  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.373251  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  31.01 
 
 
365 aa  41.2  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  31.01 
 
 
365 aa  41.2  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>