73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4121 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4121  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 157 aa  321  2e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1298  dATP pyrophosphohydrolase  69.8 
 
 		 170 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4015  NUDIX hydrolase  70.06 
 
 		 163 aa  212  9.999999999999999e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000561567 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1071  putative dATP pyrophosphohydrolase  69.03 
 
 		 160 aa  208  2e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.284114  normal  0.221269 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0575  dATP pyrophosphohydrolase  69.8 
 
 		 164 aa  205  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.725095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0867  dATP pyrophosphohydrolase  69.59 
 
 		 148 aa  204  4e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.198511 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2724  dATP pyrophosphohydrolase  70.47 
 
 		 164 aa  201  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0331777  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2112  dATP pyrophosphohydrolase  70.47 
 
 		 164 aa  201  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2751  dATP pyrophosphohydrolase  70.47 
 
 		 164 aa  201  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6051  dATP pyrophosphohydrolase  69.13 
 
 		 164 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2775  dATP pyrophosphohydrolase  67.11 
 
 		 170 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0910  dATP pyrophosphohydrolase  65.13 
 
 		 154 aa  197  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.429333  normal  0.400014 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2642  dATP pyrophosphohydrolase  67.79 
 
 		 164 aa  197  5e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.187691 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0561  dATP pyrophosphohydrolase  68 
 
 		 158 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0876  NUDIX hydrolase  65.77 
 
 		 156 aa  193  8.000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0246946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0677  dATP pyrophosphohydrolase  67.33 
 
 		 158 aa  192  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22126  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0853  dATP pyrophosphohydrolase  67.33 
 
 		 158 aa  192  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2407  dATP pyrophosphohydrolase  67.33 
 
 		 158 aa  192  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0692  dATP pyrophosphohydrolase  67.33 
 
 		 158 aa  192  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2751  dATP pyrophosphohydrolase  67.33 
 
 		 158 aa  192  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0194  dATP pyrophosphohydrolase  67.33 
 
 		 158 aa  192  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2327  dATP pyrophosphohydrolase  67.33 
 
 		 158 aa  192  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0805  NUDIX hydrolase  65.77 
 
 		 156 aa  191  3e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.826654  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4042  dATP pyrophosphohydrolase  66.23 
 
 		 192 aa  189  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.258324  normal  0.25029 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0657  dATP pyrophosphohydrolase  67.57 
 
 		 171 aa  187  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0441  dATP pyrophosphohydrolase  64.43 
 
 		 163 aa  177  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0380  dATP pyrophosphohydrolase  63.45 
 
 		 173 aa  173  7e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.1829 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0382  NUDIX hydrolase  63.09 
 
 		 158 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120045  normal  0.571576 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0358  dATP pyrophosphohydrolase  62.16 
 
 		 161 aa  170  5.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0343  dATP pyrophosphohydrolase  60.81 
 
 		 161 aa  169  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3635  NUDIX hydrolase  62 
 
 		 174 aa  168  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0468  dATP pyrophosphohydrolase  60.78 
 
 		 162 aa  166  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.379603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0631  dATP pyrophosphohydrolase  56.85 
 
 		 150 aa  163  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.12041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0444  dATP pyrophosphohydrolase  57.82 
 
 		 146 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.847222 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0604  dATP pyrophosphohydrolase  56.94 
 
 		 157 aa  153  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1891  NUDIX hydrolase  54.79 
 
 		 152 aa  148  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000678046  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5451  NUDIX hydrolase  53.59 
 
 		 161 aa  142  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1596  NUDIX hydrolase  61.11 
 
 		 147 aa  140  5e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.159893  normal  0.642184 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2382  dATP pyrophosphohydrolase  47.8 
 
 		 159 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.830787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2239  dATP pyrophosphohydrolase  46.81 
 
 		 148 aa  113  8.999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01728  dATP pyrophosphohydrolase  42.07 
 
 		 146 aa  100  6e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00223975  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0507  dATP pyrophosphohydrolase  40.28 
 
 		 150 aa  95.9  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2425  dATP pyrophosphohydrolase  45.45 
 
 		 147 aa  95.1  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.135739  normal  0.252272 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2147  dATP pyrophosphohydrolase  45.45 
 
 		 147 aa  95.1  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2034  dATP pyrophosphohydrolase  45.45 
 
 		 147 aa  95.1  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0350059  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2261  dATP pyrophosphohydrolase  45.14 
 
 		 149 aa  88.2  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.995735  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2780  NUDIX hydrolase  42.36 
 
 		 148 aa  85.9  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0389222  normal  0.0318131 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1816  dATP pyrophosphohydrolase  43.36 
 
 		 147 aa  84.3  7e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.825247  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1223  dATP pyrophosphohydrolase  42.28 
 
 		 150 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.315157  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2100  dATP pyrophosphohydrolase  42.66 
 
 		 147 aa  82.8  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1347  dATP pyrophosphohydrolase  42.28 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00224987 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2114  dATP pyrophosphohydrolase  42.28 
 
 		 150 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00720061 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2054  dATP pyrophosphohydrolase  42.28 
 
 		 150 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.830611 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2059  dATP pyrophosphohydrolase  42.86 
 
 		 146 aa  82  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0369752 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2159  dATP pyrophosphohydrolase  43.45 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1321  dATP pyrophosphohydrolase  43.54 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.832088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1767  dATP pyrophosphohydrolase  41.83 
 
 		 169 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.502024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2601  dATP pyrophosphohydrolase  41.18 
 
 		 169 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.110942  normal  0.760647 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1775  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 		 169 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00597986  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01824  hypothetical protein  42.28 
 
 		 150 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.452157  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1958  dATP pyrophosphohydrolase  42.28 
 
 		 150 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.683601  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1107  dATP pyrophosphohydrolase  42.28 
 
 		 150 aa  80.1  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2095  dATP pyrophosphohydrolase  42.28 
 
 		 150 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0764827  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01836  dATP pyrophosphohydrolase  42.28 
 
 		 150 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.618356  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2433  dATP pyrophosphohydrolase  39.86 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0218705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2947  dATP pyrophosphohydrolase  39.02 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.214504  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2065  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  33.09 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0730  NUDIX hydrolase  33.9 
 
 		 153 aa  47.4  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.189359  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4065  NUDIX hydrolase  28.47 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  49.09 
 
 		 158 aa  44.7  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  42.62 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15360  ADP-ribose pyrophosphatase  43.1 
 
 		 152 aa  41.6  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.314217  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  34.11 
 
 		 365 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>