72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2899 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2899  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 153 aa  319  9.999999999999999e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2453  dATP pyrophosphohydrolase  39.04 
 
 		 145 aa  104  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.401359  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2488  dATP pyrophosphohydrolase  38.36 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000650379  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3131  NUDIX hydrolase  36.99 
 
 		 145 aa  100  8e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.278733  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0885  NUDIX hydrolase  36.99 
 
 		 145 aa  100  8e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2741  mutT/nudix family protein  36.99 
 
 		 146 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191847  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2727  mutT/nudix family protein  37.67 
 
 		 145 aa  99  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000208593 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2528  mutT/nudix family protein  37.67 
 
 		 145 aa  98.2  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0638585  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2713  mutT/nudix family protein  37.67 
 
 		 145 aa  98.2  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2776  mutT/nudix family protein  36.99 
 
 		 146 aa  97.8  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2570  mutT/nudix family protein  36.99 
 
 		 146 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0593331 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2731  mutT/nudix family protein  36.3 
 
 		 146 aa  94  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2342  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 154 aa  85.9  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.34625  normal  0.325701 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2425  dATP pyrophosphohydrolase  28.23 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.135739  normal  0.252272 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2147  dATP pyrophosphohydrolase  28.23 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2034  dATP pyrophosphohydrolase  28.23 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0350059  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1816  dATP pyrophosphohydrolase  29.2 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.825247  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2100  dATP pyrophosphohydrolase  28.47 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0561  dATP pyrophosphohydrolase  32.45 
 
 		 158 aa  50.4  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2780  NUDIX hydrolase  27.12 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0389222  normal  0.0318131 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  33.33 
 
 		 365 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  31.58 
 
 		 365 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4065  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  31.58 
 
 		 365 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2261  dATP pyrophosphohydrolase  27.01 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.995735  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2433  dATP pyrophosphohydrolase  26.81 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0218705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2065  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  31.72 
 
 		 156 aa  48.1  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2059  dATP pyrophosphohydrolase  26.28 
 
 		 146 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0369752 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1223  dATP pyrophosphohydrolase  26.24 
 
 		 150 aa  47.4  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.315157  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2054  dATP pyrophosphohydrolase  26.24 
 
 		 150 aa  47.4  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.830611 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2114  dATP pyrophosphohydrolase  26.24 
 
 		 150 aa  47.4  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00720061 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1000  NUDIX hydrolase  46.3 
 
 		 165 aa  47.4  0.00008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000136038  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1347  dATP pyrophosphohydrolase  27.46 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00224987 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0444  dATP pyrophosphohydrolase  30.7 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.847222 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1298  dATP pyrophosphohydrolase  31.01 
 
 		 170 aa  45.4  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2601  dATP pyrophosphohydrolase  41.07 
 
 		 169 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.110942  normal  0.760647 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1107  dATP pyrophosphohydrolase  41.07 
 
 		 150 aa  45.1  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1321  dATP pyrophosphohydrolase  41.07 
 
 		 147 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.832088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1767  dATP pyrophosphohydrolase  41.07 
 
 		 169 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.502024  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1775  NUDIX hydrolase  41.07 
 
 		 169 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00597986  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01824  hypothetical protein  41.07 
 
 		 150 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.452157  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2095  dATP pyrophosphohydrolase  41.07 
 
 		 150 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0764827  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1958  dATP pyrophosphohydrolase  41.07 
 
 		 150 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.683601  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01836  dATP pyrophosphohydrolase  41.07 
 
 		 150 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.618356  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2278  NUDIX hydrolase  31.9 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.369324  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2239  dATP pyrophosphohydrolase  25.68 
 
 		 148 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0878  NUDIX hydrolase  31.39 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2159  dATP pyrophosphohydrolase  25.55 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0542  (di)nucleoside polyphosphate hydrolase  37.74 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.411915  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1622  dinucleoside polyphosphate hydrolase  32.84 
 
 		 192 aa  43.1  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2017  dinucleoside polyphosphate hydrolase  51.02 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00712308  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  42 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0684  dinucleoside polyphosphate hydrolase  45.24 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0507  dATP pyrophosphohydrolase  30 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0814  dinucleoside polyphosphate hydrolase  42.31 
 
 		 176 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0198094  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0609  dinucleoside polyphosphate hydrolase  45.24 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1891  NUDIX hydrolase  32.84 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000678046  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0668  dinucleoside polyphosphate hydrolase  47.62 
 
 		 156 aa  42.4  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0578  mutT/nudix family protein  30.67 
 
 		 153 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000245736  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2448  NUDIX hydrolase  38.98 
 
 		 137 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0479485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0631  dATP pyrophosphohydrolase  29.14 
 
 		 150 aa  42  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.12041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004431  adenosine (5')-pentaphospho-(5'')-adenosine pyrophosphohydrolase  38.89 
 
 		 173 aa  42  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000169211  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00967  dinucleoside polyphosphate hydrolase  38.89 
 
 		 172 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  37.5 
 
 		 159 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2636  mutator MutT protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  37.93 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0203  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.04 
 
 		 193 aa  41.2  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2382  dATP pyrophosphohydrolase  29.01 
 
 		 159 aa  41.2  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.830787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1088  dinucleoside polyphosphate hydrolase  45.24 
 
 		 156 aa  40.8  0.006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3015  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 		 351 aa  40.8  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 		 171 aa  40.8  0.007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03710  dinucleoside polyphosphate hydrolase  35.85 
 
 		 162 aa  40.8  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.626729  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>