50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2646 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2646  NUDIX hydrolase  100 
 
 
155 aa  313  6e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5859  NUDIX hydrolase  52.63 
 
 
153 aa  170  5e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315919  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0645  NUDIX hydrolase  55.1 
 
 
155 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2262  NUDIX hydrolase  54.42 
 
 
155 aa  157  4e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.997578  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2570  hypothetical protein  52.38 
 
 
172 aa  156  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00072063  normal  0.0208228 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1098  NUDIX hydrolase  50.97 
 
 
155 aa  156  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.448476  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2817  NUDIX hydrolase  52.32 
 
 
152 aa  155  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4185  NUDIX hydrolase  50.33 
 
 
154 aa  155  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0649  NUDIX hydrolase  50.68 
 
 
154 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7253  NUDIX hydrolase  50.65 
 
 
160 aa  150  7e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3428  NUDIX hydrolase  49.67 
 
 
163 aa  150  8e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1987  NUDIX hydrolase  51.05 
 
 
155 aa  148  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4431  NUDIX hydrolase  48.37 
 
 
164 aa  148  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3182  NUDIX hydrolase  49.67 
 
 
163 aa  146  8e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.565463  normal  0.196576 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2044  NUDIX hydrolase  49.68 
 
 
160 aa  144  5e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3404  NUDIX hydrolase  53.38 
 
 
174 aa  143  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321528  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2909  NUDIX hydrolase  48.05 
 
 
157 aa  142  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188033  normal  0.899663 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2923  NUDIX hydrolase  48.05 
 
 
157 aa  142  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.928534  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2879  NUDIX hydrolase  48.05 
 
 
157 aa  142  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4521  NUDIX hydrolase  54.55 
 
 
156 aa  142  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.506364 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0645  hypothetical protein  52.35 
 
 
154 aa  141  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13765  hypothetical protein  48.65 
 
 
166 aa  140  5e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.983203 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3663  NUDIX hydrolase  50 
 
 
154 aa  135  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3585  NUDIX hydrolase  51.33 
 
 
162 aa  135  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00428581  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5719  NUDIX hydrolase  48.99 
 
 
154 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.943651 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0358  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 
162 aa  132  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5357  NUDIX hydrolase  47.71 
 
 
154 aa  131  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.737057 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3569  NUDIX hydrolase  44.87 
 
 
163 aa  128  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16970  predicted NTP pyrophosphohydrolase  45.33 
 
 
154 aa  128  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.542075  normal  0.366756 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2455  NUDIX hydrolase  44.74 
 
 
162 aa  127  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.490004  normal  0.610267 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0671  NUDIX hydrolase  46.41 
 
 
153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.616571  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2993  NUDIX hydrolase  50.97 
 
 
154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0064  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 
168 aa  123  9e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0113  NUDIX hydrolase  44.3 
 
 
165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1389  NUDIX hydrolase  41.1 
 
 
324 aa  100  5e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.524565  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0230  NUDIX hydrolase  39.52 
 
 
166 aa  89.7  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  31.85 
 
 
289 aa  50.8  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5221  NUDIX hydrolase  27.61 
 
 
333 aa  49.7  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.239365  normal  0.144046 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2189  NUDIX hydrolase  24.84 
 
 
201 aa  49.7  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0392  NUDIX family hydrolase  26.85 
 
 
149 aa  45.8  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000292752 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2275  NUDIX hydrolase  26.17 
 
 
149 aa  45.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.961182  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1152  NUDIX hydrolase  29.69 
 
 
296 aa  43.9  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000396101 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0301  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 
324 aa  43.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.917756  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  30 
 
 
229 aa  42.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0324  putative MutT family protein  30.37 
 
 
325 aa  42.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4127  NUDIX hydrolase  27.56 
 
 
167 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0317777  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1103  nudix hydrolase  42.11 
 
 
524 aa  41.2  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.426954 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0325  NUDIX hydrolase  28.95 
 
 
138 aa  40.8  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414078  normal  0.0748688 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03520  ADP-ribose pyrophosphatase  28.68 
 
 
308 aa  40.8  0.008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.630054 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3015  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 
351 aa  40.8  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>