59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0444 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0444  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 176 aa  358  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0488  NUDIX hydrolase  89.77 
 
 		 176 aa  325  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.950103 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0390  NUDIX hydrolase  60 
 
 		 168 aa  199  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402427  normal  0.791613 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5783  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  55.13 
 
 		 162 aa  182  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9038  hypothetical protein  47.62 
 
 		 178 aa  146  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6066  NUDIX hydrolase  49.33 
 
 		 175 aa  142  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0725439  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5832  NUDIX hydrolase  48.1 
 
 		 164 aa  137  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1757  NUDIX hydrolase  51.68 
 
 		 177 aa  137  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.128298  normal  0.0562485 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0668  NUDIX hydrolase  51.66 
 
 		 155 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.980148  normal  0.537231 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1884  NUDIX hydrolase  51.52 
 
 		 165 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.391735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2388  hypothetical protein  47.73 
 
 		 166 aa  127  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.398073  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1052  NUDIX hydrolase  47.73 
 
 		 166 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.302122  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6062  NUDIX hydrolase  47.3 
 
 		 158 aa  124  8.000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5998  NUDIX hydrolase  47.3 
 
 		 175 aa  123  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.211306 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3198  hypothetical protein  42.54 
 
 		 141 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2056  hypothetical protein  46.32 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.334571 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1334  NUDIX hydrolase  42.33 
 
 		 161 aa  111  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0310402  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1009  MutT/nudix family protein  44.7 
 
 		 162 aa  108  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1045  MutT/nudix family protein  44.7 
 
 		 162 aa  108  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3272  NUDIX hydrolase  43.48 
 
 		 163 aa  108  4.0000000000000004e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0635  NUDIX hydrolase  43.07 
 
 		 156 aa  107  6e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00453948  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4258  NUDIX hydrolase  43.88 
 
 		 181 aa  106  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.638614 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2132  NUDIX hydrolase  42.42 
 
 		 162 aa  105  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2073  NUDIX hydrolase  46.67 
 
 		 144 aa  103  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.325877  normal  0.12084 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0220  NUDIX hydrolase  38.19 
 
 		 170 aa  102  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.120997 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8019  NUDIX hydrolase  44.85 
 
 		 246 aa  101  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208881  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1413  NUDIX hydrolase  48.87 
 
 		 190 aa  100  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2007  hypothetical protein  47.01 
 
 		 155 aa  99.4  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0268517 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2136  NUDIX hydrolase  48.09 
 
 		 152 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.701538 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1112  NUDIX hydrolase  46.04 
 
 		 170 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0901  NUDIX hydrolase  42.77 
 
 		 153 aa  95.9  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0950786 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3606  hypothetical protein  39.26 
 
 		 390 aa  96.3  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.113159 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2173  NUDIX hydrolase  48.85 
 
 		 152 aa  95.9  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.259944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2451  NUDIX hydrolase  48.85 
 
 		 152 aa  95.9  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0559417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2150  NUDIX hydrolase  48.48 
 
 		 163 aa  94.7  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42149  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3446  NUDIX hydrolase  45.11 
 
 		 464 aa  94  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2031  NUDIX hydrolase  38.28 
 
 		 141 aa  90.1  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.717245 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2006  NUDIX hydrolase  38.28 
 
 		 141 aa  89.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0983  NUDIX hydrolase  39.06 
 
 		 138 aa  87.4  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.246298 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2275  NUDIX hydrolase  37.4 
 
 		 149 aa  84.7  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.961182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1129  NUDIX hydrolase  35.17 
 
 		 156 aa  84.3  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.701065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2189  NUDIX hydrolase  38.76 
 
 		 201 aa  84.3  9e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2100  NUDIX hydrolase  37.78 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2092  NUDIX hydrolase  39.06 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000618105  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1638  NUDIX hydrolase  39.82 
 
 		 138 aa  73.2  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.611256 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0810  NUDIX hydrolase  37.61 
 
 		 136 aa  67.4  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0707  NUDIX/MutT family protein  35.34 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1639  NUDIX hydrolase  36.8 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000139733  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1545  NUDIX/MutT family protein  37.01 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000014066  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1786  NUDIX hydrolase  38.52 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0655514  normal  0.470183 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40358  predicted protein  32.69 
 
 		 170 aa  60.5  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0924  NUDIX hydrolase  37.07 
 
 		 137 aa  50.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000333933  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0392  NUDIX family hydrolase  26.98 
 
 		 149 aa  46.6  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000292752 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5350  NUDIX hydrolase  47.06 
 
 		 205 aa  44.7  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.46762  normal  0.101192 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0791  NUDIX family hydrolase  28.57 
 
 		 142 aa  43.5  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000502884  hitchhiker  6.80479e-24 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06251  Nudix/MutT family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G13080)  31.45 
 
 		 159 aa  43.5  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.987748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  42.62 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4431  NUDIX hydrolase  29.34 
 
 		 164 aa  42.7  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1483  NUDIX hydrolase  51.52 
 
 		 210 aa  42  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.163061 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>