56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0707 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0707  NUDIX/MutT family protein  100 
 
 
134 aa  270  5.000000000000001e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1639  NUDIX hydrolase  70.4 
 
 
127 aa  192  2e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000139733  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2092  NUDIX hydrolase  65.38 
 
 
156 aa  188  2e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000618105  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0924  NUDIX hydrolase  68.18 
 
 
137 aa  176  7e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000333933  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1545  NUDIX/MutT family protein  57.14 
 
 
151 aa  165  2e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000014066  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0810  NUDIX hydrolase  55.38 
 
 
136 aa  159  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1638  NUDIX hydrolase  53.17 
 
 
138 aa  147  4e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.611256 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2275  NUDIX hydrolase  39.55 
 
 
149 aa  105  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.961182  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2100  NUDIX hydrolase  41.54 
 
 
139 aa  104  4e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2189  NUDIX hydrolase  40.8 
 
 
201 aa  90.5  8e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2006  NUDIX hydrolase  36.64 
 
 
141 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2031  NUDIX hydrolase  36.64 
 
 
141 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.717245 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3606  hypothetical protein  35.34 
 
 
390 aa  84.3  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.113159 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0220  NUDIX hydrolase  37.17 
 
 
170 aa  82.8  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.120997 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1884  NUDIX hydrolase  41.44 
 
 
165 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.391735  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1786  NUDIX hydrolase  42.99 
 
 
137 aa  80.9  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0655514  normal  0.470183 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0983  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
138 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.246298 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0635  NUDIX hydrolase  37.27 
 
 
156 aa  78.6  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00453948  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1052  NUDIX hydrolase  37.84 
 
 
166 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.302122  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0901  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 
153 aa  76.3  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0950786 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2388  hypothetical protein  37.84 
 
 
166 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.398073  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1045  MutT/nudix family protein  39.13 
 
 
162 aa  74.7  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1009  MutT/nudix family protein  39.13 
 
 
162 aa  73.9  0.0000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0668  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 
155 aa  72.8  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.980148  normal  0.537231 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4258  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 
181 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.638614 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2007  hypothetical protein  42.34 
 
 
155 aa  70.1  0.000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0268517 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3272  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 
163 aa  70.1  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2150  NUDIX hydrolase  36.64 
 
 
163 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42149  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2132  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 
162 aa  65.5  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1334  NUDIX hydrolase  35.65 
 
 
161 aa  65.1  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0310402  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0444  NUDIX hydrolase  35.34 
 
 
176 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1112  NUDIX hydrolase  36.22 
 
 
170 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3198  hypothetical protein  34.82 
 
 
141 aa  63.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2056  hypothetical protein  49.33 
 
 
159 aa  61.6  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.334571 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1413  NUDIX hydrolase  36.21 
 
 
190 aa  61.6  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2451  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
152 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0559417  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2173  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
152 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.259944 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2136  NUDIX hydrolase  36.51 
 
 
152 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.701538 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8019  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 
246 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208881  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1129  NUDIX hydrolase  31.19 
 
 
156 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.701065  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3446  NUDIX hydrolase  44.83 
 
 
464 aa  58.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23959  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2073  NUDIX hydrolase  36.22 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.325877  normal  0.12084 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0390  NUDIX hydrolase  32.74 
 
 
168 aa  58.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402427  normal  0.791613 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0488  NUDIX hydrolase  37.29 
 
 
176 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.950103 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6066  NUDIX hydrolase  31.86 
 
 
175 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0725439  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47297  predicted protein  40 
 
 
416 aa  49.7  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5783  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  34.48 
 
 
162 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9038  hypothetical protein  34.88 
 
 
178 aa  47.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5832  NUDIX hydrolase  36.28 
 
 
164 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 
536 aa  43.5  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6003  NUDIX hydrolase  26.47 
 
 
314 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.45495  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06251  Nudix/MutT family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G13080)  29.57 
 
 
159 aa  42.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.987748  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5518  NUDIX hydrolase  40 
 
 
183 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2915  hypothetical protein  36.62 
 
 
148 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.13474  normal  0.624718 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1757  NUDIX hydrolase  32.74 
 
 
177 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.128298  normal  0.0562485 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1661  NUDIX hydrolase  30.23 
 
 
181 aa  40.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.753225  normal  0.0347123 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>