55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6066 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012852  Rleg_6066  NUDIX hydrolase  100 
 
 
175 aa  357  4e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0725439  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1757  NUDIX hydrolase  66.87 
 
 
177 aa  208  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.128298  normal  0.0562485 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5832  NUDIX hydrolase  64 
 
 
164 aa  181  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0444  NUDIX hydrolase  49.33 
 
 
176 aa  142  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0488  NUDIX hydrolase  48.67 
 
 
176 aa  140  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.950103 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9038  hypothetical protein  47.26 
 
 
178 aa  139  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6062  NUDIX hydrolase  49.32 
 
 
158 aa  128  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5998  NUDIX hydrolase  49.32 
 
 
175 aa  127  7.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.211306 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0390  NUDIX hydrolase  42 
 
 
168 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402427  normal  0.791613 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0668  NUDIX hydrolase  48.12 
 
 
155 aa  121  6e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.980148  normal  0.537231 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5783  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  45.26 
 
 
162 aa  120  7e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2388  hypothetical protein  44.2 
 
 
166 aa  114  5e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.398073  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1052  NUDIX hydrolase  45.38 
 
 
166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.302122  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1884  NUDIX hydrolase  45.99 
 
 
165 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.391735  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4258  NUDIX hydrolase  43.94 
 
 
181 aa  106  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.638614 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3198  hypothetical protein  41.98 
 
 
141 aa  106  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2132  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 
162 aa  104  7e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2073  NUDIX hydrolase  50.78 
 
 
144 aa  103  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.325877  normal  0.12084 
 
 
-
 
NC_004310  BR1045  MutT/nudix family protein  40.6 
 
 
162 aa  102  4e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0635  NUDIX hydrolase  43.07 
 
 
156 aa  99  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00453948  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1009  MutT/nudix family protein  39.85 
 
 
162 aa  97.8  6e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3272  NUDIX hydrolase  40.58 
 
 
163 aa  98.2  6e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2451  NUDIX hydrolase  53.04 
 
 
152 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0559417  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2173  NUDIX hydrolase  53.04 
 
 
152 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.259944 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2136  NUDIX hydrolase  51.3 
 
 
152 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.701538 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1413  NUDIX hydrolase  50.43 
 
 
190 aa  95.1  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0220  NUDIX hydrolase  39.39 
 
 
170 aa  94.4  8e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.120997 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3446  NUDIX hydrolase  46.92 
 
 
464 aa  92.8  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23959  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2056  hypothetical protein  42.42 
 
 
159 aa  92.4  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.334571 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1334  NUDIX hydrolase  43.48 
 
 
161 aa  90.9  8e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0310402  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1129  NUDIX hydrolase  39.39 
 
 
156 aa  90.5  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.701065  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3606  hypothetical protein  40.68 
 
 
390 aa  89.7  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.113159 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8019  NUDIX hydrolase  42.55 
 
 
246 aa  88.2  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208881  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2006  NUDIX hydrolase  40.3 
 
 
141 aa  87.4  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1638  NUDIX hydrolase  44.25 
 
 
138 aa  86.7  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.611256 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2031  NUDIX hydrolase  39.55 
 
 
141 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.717245 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2100  NUDIX hydrolase  37.69 
 
 
139 aa  81.6  0.000000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2150  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 
163 aa  81.3  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42149  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2007  hypothetical protein  44.09 
 
 
155 aa  81.6  0.000000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0268517 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1112  NUDIX hydrolase  42.19 
 
 
170 aa  80.9  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2275  NUDIX hydrolase  34.09 
 
 
149 aa  76.3  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.961182  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0983  NUDIX hydrolase  35.66 
 
 
138 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.246298 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2189  NUDIX hydrolase  37.17 
 
 
201 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0901  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 
153 aa  73.9  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0950786 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0810  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 
136 aa  70.5  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2092  NUDIX hydrolase  36.28 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000618105  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1545  NUDIX/MutT family protein  38.69 
 
 
151 aa  69.7  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000014066  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1639  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 
127 aa  68.2  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000139733  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0707  NUDIX/MutT family protein  31.86 
 
 
134 aa  58.2  0.00000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40358  predicted protein  29.41 
 
 
170 aa  53.1  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1786  NUDIX hydrolase  33.96 
 
 
137 aa  50.8  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0655514  normal  0.470183 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0924  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 
137 aa  44.7  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000333933  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60333  Diadenosine and Diphosphoinositol Polyphosphate Phosphohydrolase  31.71 
 
 
179 aa  43.1  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.333376  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06251  Nudix/MutT family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G13080)  28.35 
 
 
159 aa  42.4  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.987748  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  35.23 
 
 
150 aa  41.2  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>