56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3198 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3198  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  277  3e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1129  NUDIX hydrolase  48.85 
 
 		 156 aa  122  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.701065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0444  NUDIX hydrolase  42.54 
 
 		 176 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0488  NUDIX hydrolase  43.94 
 
 		 176 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.950103 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0390  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 		 168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402427  normal  0.791613 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4258  NUDIX hydrolase  49.62 
 
 		 181 aa  110  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.638614 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5783  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  45.65 
 
 		 162 aa  110  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2388  hypothetical protein  42.03 
 
 		 166 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.398073  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1052  NUDIX hydrolase  44.8 
 
 		 166 aa  106  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.302122  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6066  NUDIX hydrolase  41.98 
 
 		 175 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0725439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1884  NUDIX hydrolase  44.19 
 
 		 165 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.391735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0220  NUDIX hydrolase  44.62 
 
 		 170 aa  104  5e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.120997 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9038  hypothetical protein  41.41 
 
 		 178 aa  97.1  8e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3606  hypothetical protein  39.39 
 
 		 390 aa  94.4  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.113159 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0901  NUDIX hydrolase  40.32 
 
 		 153 aa  92.8  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0950786 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1413  NUDIX hydrolase  45.11 
 
 		 190 aa  92  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3446  NUDIX hydrolase  44.27 
 
 		 464 aa  91.3  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23959  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1045  MutT/nudix family protein  37.4 
 
 		 162 aa  90.5  7e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1009  MutT/nudix family protein  37.4 
 
 		 162 aa  90.5  7e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2073  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 		 144 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.325877  normal  0.12084 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0668  NUDIX hydrolase  39.23 
 
 		 155 aa  88.6  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.980148  normal  0.537231 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5998  NUDIX hydrolase  42.19 
 
 		 175 aa  87.4  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.211306 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6062  NUDIX hydrolase  42.52 
 
 		 158 aa  87.4  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2451  NUDIX hydrolase  42.34 
 
 		 152 aa  87  7e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0559417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2173  NUDIX hydrolase  42.34 
 
 		 152 aa  87  7e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.259944 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0983  NUDIX hydrolase  36.72 
 
 		 138 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.246298 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5832  NUDIX hydrolase  41.54 
 
 		 164 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8019  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 246 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208881  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1334  NUDIX hydrolase  39.84 
 
 		 161 aa  84.7  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0310402  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2136  NUDIX hydrolase  43.65 
 
 		 152 aa  84  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.701538 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2132  NUDIX hydrolase  36.15 
 
 		 162 aa  84  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3272  NUDIX hydrolase  36.09 
 
 		 163 aa  82.4  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2056  hypothetical protein  39.53 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.334571 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1757  NUDIX hydrolase  40.15 
 
 		 177 aa  80.9  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.128298  normal  0.0562485 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2275  NUDIX hydrolase  34.85 
 
 		 149 aa  80.5  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.961182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0810  NUDIX hydrolase  41.32 
 
 		 136 aa  80.1  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2150  NUDIX hydrolase  38.85 
 
 		 163 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42149  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2006  NUDIX hydrolase  33.6 
 
 		 141 aa  77  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1112  NUDIX hydrolase  41.13 
 
 		 170 aa  77  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2189  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2031  NUDIX hydrolase  33.6 
 
 		 141 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.717245 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0635  NUDIX hydrolase  36.94 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00453948  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2100  NUDIX hydrolase  31.75 
 
 		 139 aa  73.6  0.0000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2007  hypothetical protein  38.69 
 
 		 155 aa  71.2  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0268517 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1638  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 		 138 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.611256 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1545  NUDIX/MutT family protein  37.17 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000014066  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1786  NUDIX hydrolase  38.21 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0655514  normal  0.470183 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0707  NUDIX/MutT family protein  34.82 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2092  NUDIX hydrolase  36.61 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000618105  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1639  NUDIX hydrolase  33.93 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000139733  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40358  predicted protein  25.38 
 
 		 170 aa  47  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4501  NUDIX hydrolase  31.65 
 
 		 322 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0924  NUDIX hydrolase  34.17 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000333933  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4051  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 315 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  29.91 
 
 		 150 aa  40.8  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>