60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5783 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5783  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  100 
 
 		 162 aa  335  1.9999999999999998e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0390  NUDIX hydrolase  60.81 
 
 		 168 aa  186  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402427  normal  0.791613 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0488  NUDIX hydrolase  56.76 
 
 		 176 aa  184  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.950103 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0444  NUDIX hydrolase  55.13 
 
 		 176 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9038  hypothetical protein  44.14 
 
 		 178 aa  136  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0668  NUDIX hydrolase  49.67 
 
 		 155 aa  133  8e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.980148  normal  0.537231 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5832  NUDIX hydrolase  49.25 
 
 		 164 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0635  NUDIX hydrolase  45.21 
 
 		 156 aa  121  5e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00453948  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6066  NUDIX hydrolase  45.26 
 
 		 175 aa  120  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0725439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1757  NUDIX hydrolase  50.39 
 
 		 177 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.128298  normal  0.0562485 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6062  NUDIX hydrolase  46.53 
 
 		 158 aa  118  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5998  NUDIX hydrolase  45.89 
 
 		 175 aa  117  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.211306 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1334  NUDIX hydrolase  48.55 
 
 		 161 aa  115  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0310402  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8019  NUDIX hydrolase  49.62 
 
 		 246 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208881  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4258  NUDIX hydrolase  49.61 
 
 		 181 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.638614 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1884  NUDIX hydrolase  45.31 
 
 		 165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.391735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3198  hypothetical protein  45.65 
 
 		 141 aa  110  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3272  NUDIX hydrolase  42.36 
 
 		 163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2056  hypothetical protein  42.86 
 
 		 159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.334571 
 
 
-
 
NC_004310  BR1045  MutT/nudix family protein  43.17 
 
 		 162 aa  108  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1009  MutT/nudix family protein  44.96 
 
 		 162 aa  108  4.0000000000000004e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2132  NUDIX hydrolase  44.96 
 
 		 162 aa  106  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1052  NUDIX hydrolase  44.53 
 
 		 166 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.302122  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2388  hypothetical protein  44.53 
 
 		 166 aa  106  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.398073  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1413  NUDIX hydrolase  47.69 
 
 		 190 aa  100  8e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3606  hypothetical protein  42.52 
 
 		 390 aa  100  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.113159 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2073  NUDIX hydrolase  43.61 
 
 		 144 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.325877  normal  0.12084 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1112  NUDIX hydrolase  43.61 
 
 		 170 aa  98.2  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0220  NUDIX hydrolase  39.68 
 
 		 170 aa  98.2  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.120997 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2173  NUDIX hydrolase  44.96 
 
 		 152 aa  94.4  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.259944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2451  NUDIX hydrolase  44.96 
 
 		 152 aa  94.4  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0559417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2150  NUDIX hydrolase  47.29 
 
 		 163 aa  94.4  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42149  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2136  NUDIX hydrolase  44.96 
 
 		 152 aa  93.6  9e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.701538 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2007  hypothetical protein  44.96 
 
 		 155 aa  85.1  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0268517 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3446  NUDIX hydrolase  44.88 
 
 		 464 aa  84.7  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2189  NUDIX hydrolase  38.93 
 
 		 201 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2031  NUDIX hydrolase  37.69 
 
 		 141 aa  81.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.717245 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2006  NUDIX hydrolase  37.69 
 
 		 141 aa  81.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1129  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.701065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2275  NUDIX hydrolase  37.01 
 
 		 149 aa  78.2  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.961182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0983  NUDIX hydrolase  37.69 
 
 		 138 aa  77  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.246298 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0901  NUDIX hydrolase  34.21 
 
 		 153 aa  72  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0950786 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2100  NUDIX hydrolase  34.31 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1786  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 		 137 aa  63.5  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0655514  normal  0.470183 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1638  NUDIX hydrolase  35.85 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.611256 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0810  NUDIX hydrolase  33.94 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1545  NUDIX/MutT family protein  35.14 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000014066  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1639  NUDIX hydrolase  31.67 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000139733  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2092  NUDIX hydrolase  32.5 
 
 		 156 aa  52  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000618105  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0707  NUDIX/MutT family protein  34.48 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40358  predicted protein  27.27 
 
 		 170 aa  49.3  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5518  NUDIX hydrolase  24.83 
 
 		 183 aa  45.8  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4158  NUDIX hydrolase  29.37 
 
 		 166 aa  44.3  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60333  Diadenosine and Diphosphoinositol Polyphosphate Phosphohydrolase  29.14 
 
 		 179 aa  43.9  0.0009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.333376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2543  NUDIX hydrolase  30.28 
 
 		 206 aa  43.5  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.339179 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06251  Nudix/MutT family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G13080)  29.75 
 
 		 159 aa  43.9  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.987748  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0589  NUDIX hydrolase  31.62 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000226266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2044  NUDIX hydrolase  27.1 
 
 		 160 aa  40.8  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3925  NUDIX hydrolase  27.78 
 
 		 182 aa  40.8  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4563  NUDIX hydrolase  40.68 
 
 		 166 aa  40.8  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>