135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2092 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2092  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 156 aa  326  6e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000618105  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1639  NUDIX hydrolase  77.24 
 
 		 127 aa  206  7e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000139733  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0707  NUDIX/MutT family protein  65.38 
 
 		 134 aa  188  2e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0924  NUDIX hydrolase  73.08 
 
 		 137 aa  183  9e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000333933  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0810  NUDIX hydrolase  60 
 
 		 136 aa  170  5.999999999999999e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1545  NUDIX/MutT family protein  58.14 
 
 		 151 aa  163  1.0000000000000001e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000014066  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1638  NUDIX hydrolase  57.38 
 
 		 138 aa  155  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.611256 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2275  NUDIX hydrolase  38.81 
 
 		 149 aa  105  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.961182  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2100  NUDIX hydrolase  41.54 
 
 		 139 aa  101  5e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2006  NUDIX hydrolase  42.4 
 
 		 141 aa  100  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2031  NUDIX hydrolase  42.4 
 
 		 141 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.717245 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0983  NUDIX hydrolase  44 
 
 		 138 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.246298 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0220  NUDIX hydrolase  39.68 
 
 		 170 aa  93.6  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.120997 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3606  hypothetical protein  37.59 
 
 		 390 aa  90.1  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.113159 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2189  NUDIX hydrolase  39.17 
 
 		 201 aa  89  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0635  NUDIX hydrolase  38.18 
 
 		 156 aa  87.4  7e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00453948  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1786  NUDIX hydrolase  43.81 
 
 		 137 aa  85.5  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0655514  normal  0.470183 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2388  hypothetical protein  40.35 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.398073  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1052  NUDIX hydrolase  40.35 
 
 		 166 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.302122  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1884  NUDIX hydrolase  40.71 
 
 		 165 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.391735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3272  NUDIX hydrolase  37.29 
 
 		 163 aa  81.3  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0668  NUDIX hydrolase  38.6 
 
 		 155 aa  78.6  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.980148  normal  0.537231 
 
 
-
 
NC_004310  BR1045  MutT/nudix family protein  35.83 
 
 		 162 aa  73.2  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0444  NUDIX hydrolase  39.06 
 
 		 176 aa  72.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1009  MutT/nudix family protein  35.46 
 
 		 162 aa  72.4  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1334  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 		 161 aa  72  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0310402  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2150  NUDIX hydrolase  42.06 
 
 		 163 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42149  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0901  NUDIX hydrolase  36.07 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0950786 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2056  hypothetical protein  39.06 
 
 		 159 aa  70.9  0.000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.334571 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6066  NUDIX hydrolase  36.28 
 
 		 175 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0725439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0390  NUDIX hydrolase  38.94 
 
 		 168 aa  68.2  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402427  normal  0.791613 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4258  NUDIX hydrolase  37.59 
 
 		 181 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.638614 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0488  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 176 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.950103 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3446  NUDIX hydrolase  42.48 
 
 		 464 aa  67  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2132  NUDIX hydrolase  33.91 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1112  NUDIX hydrolase  40.94 
 
 		 170 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2073  NUDIX hydrolase  40.16 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.325877  normal  0.12084 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2173  NUDIX hydrolase  40.48 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.259944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2451  NUDIX hydrolase  40.48 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0559417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2136  NUDIX hydrolase  40.48 
 
 		 152 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.701538 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3198  hypothetical protein  36.61 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2007  hypothetical protein  40.54 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0268517 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1129  NUDIX hydrolase  27.35 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.701065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1413  NUDIX hydrolase  39.82 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5832  NUDIX hydrolase  40.71 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8019  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 246 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208881  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9038  hypothetical protein  32.43 
 
 		 178 aa  53.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1757  NUDIX hydrolase  36.52 
 
 		 177 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.128298  normal  0.0562485 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5783  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  32.5 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06251  Nudix/MutT family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G13080)  31.25 
 
 		 159 aa  51.2  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.987748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  40 
 
 		 536 aa  47.8  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1980  NUDIX hydrolase  34.85 
 
 		 209 aa  47.8  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.280065 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47297  predicted protein  47.27 
 
 		 416 aa  47.8  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2472  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 		 182 aa  47  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0242513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2817  NUDIX hydrolase  30.83 
 
 		 201 aa  47  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  hitchhiker  0.00000248326 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40358  predicted protein  25 
 
 		 170 aa  47  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3823  NUDIX hydrolase  31.36 
 
 		 198 aa  45.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.721473  normal  0.0483324 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  53.12 
 
 		 258 aa  45.8  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1448  ADP-ribose pyrophosphatase  39.34 
 
 		 430 aa  45.8  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60333  Diadenosine and Diphosphoinositol Polyphosphate Phosphohydrolase  29.73 
 
 		 179 aa  45.4  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.333376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  36.78 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5998  NUDIX hydrolase  33.04 
 
 		 175 aa  45.8  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.211306 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6062  NUDIX hydrolase  33.04 
 
 		 158 aa  45.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3522  NUDIX hydrolase  29.31 
 
 		 141 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.478841 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2117  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 196 aa  44.7  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.018357 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1536  NUDIX hydrolase  41.46 
 
 		 205 aa  44.3  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.058172  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1059  NUDIX hydrolase  27.59 
 
 		 195 aa  44.3  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 150 aa  44.3  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3595  NUDIX hydrolase  29.66 
 
 		 187 aa  44.3  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00459276  normal  0.106205 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2504  putative ADP-ribose pyrophosphatase, NUDIX hydrolase, nudF  36.67 
 
 		 181 aa  43.9  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1676  NUDIX hydrolase  29.91 
 
 		 182 aa  43.9  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.564236  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2079  NUDIX hydrolase  29.91 
 
 		 182 aa  43.9  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.912784 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1661  NUDIX hydrolase  36.07 
 
 		 181 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.753225  normal  0.0347123 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1733  NUDIX hydrolase  36.07 
 
 		 181 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.361555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1191  NUDIX hydrolase  26.14 
 
 		 211 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2641  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4365  NUDIX hydrolase  43.18 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2017  NUDIX hydrolase  39.39 
 
 		 183 aa  43.9  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3407  NUDIX hydrolase  35.19 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.107532 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0946  ADP-ribose pyrophosphatase  41.86 
 
 		 207 aa  43.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000804497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4001  NUDIX hydrolase  43.18 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3914  NUDIX hydrolase  35.19 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.434564 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4548  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4436  NUDIX hydrolase  29.87 
 
 		 180 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0922  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1404  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567181  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1059  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.891979  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5518  NUDIX hydrolase  35.56 
 
 		 183 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1250  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  36.07 
 
 		 181 aa  42  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1981  mutT/nudix family protein  36.07 
 
 		 181 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5080  NUDIX hydrolase  42.31 
 
 		 158 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2090  NUDIX hydrolase  42.5 
 
 		 141 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.147471  normal  0.280778 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2508  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  36.07 
 
 		 181 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1483  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 210 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.163061 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1733  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  36.07 
 
 		 181 aa  42  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0391  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  36.07 
 
 		 181 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1812  nudix hydrolase  36.07 
 
 		 181 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1828  nudix hydrolase  36.07 
 
 		 181 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.54633  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0771  nudix hydrolase  36.07 
 
 		 181 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.176902  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0453  NUDIX hydrolase  40.43 
 
 		 215 aa  42  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>