70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_6062 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_6062  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 158 aa  321  3e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5998  NUDIX hydrolase  99.37 
 
 		 175 aa  319  7e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.211306 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9038  hypothetical protein  60 
 
 		 178 aa  176  9e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6066  NUDIX hydrolase  49.32 
 
 		 175 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0725439  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5832  NUDIX hydrolase  52.45 
 
 		 164 aa  138  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0444  NUDIX hydrolase  47.3 
 
 		 176 aa  137  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5783  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  46.53 
 
 		 162 aa  135  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0390  NUDIX hydrolase  43.24 
 
 		 168 aa  132  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402427  normal  0.791613 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0488  NUDIX hydrolase  45.27 
 
 		 176 aa  131  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.950103 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1757  NUDIX hydrolase  49.32 
 
 		 177 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.128298  normal  0.0562485 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1884  NUDIX hydrolase  51.16 
 
 		 165 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.391735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0668  NUDIX hydrolase  46.46 
 
 		 155 aa  116  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.980148  normal  0.537231 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2388  hypothetical protein  46.62 
 
 		 166 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.398073  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1052  NUDIX hydrolase  47.29 
 
 		 166 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.302122  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3606  hypothetical protein  43.31 
 
 		 390 aa  106  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.113159 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2056  hypothetical protein  45.21 
 
 		 159 aa  105  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.334571 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0635  NUDIX hydrolase  44.96 
 
 		 156 aa  103  8e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00453948  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4258  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 181 aa  103  8e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.638614 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2132  NUDIX hydrolase  41.55 
 
 		 162 aa  101  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1045  MutT/nudix family protein  41.55 
 
 		 162 aa  100  6e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1009  MutT/nudix family protein  41.55 
 
 		 162 aa  100  7e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3198  hypothetical protein  42.52 
 
 		 141 aa  100  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0220  NUDIX hydrolase  41.09 
 
 		 170 aa  98.6  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.120997 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2136  NUDIX hydrolase  46.51 
 
 		 152 aa  98.2  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.701538 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3272  NUDIX hydrolase  41.32 
 
 		 163 aa  97.8  6e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1413  NUDIX hydrolase  43.94 
 
 		 190 aa  97.1  9e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2451  NUDIX hydrolase  43.41 
 
 		 152 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0559417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2173  NUDIX hydrolase  43.41 
 
 		 152 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.259944 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8019  NUDIX hydrolase  42.52 
 
 		 246 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208881  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2073  NUDIX hydrolase  42.75 
 
 		 144 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.325877  normal  0.12084 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1129  NUDIX hydrolase  39.55 
 
 		 156 aa  92  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.701065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2150  NUDIX hydrolase  46.46 
 
 		 163 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42149  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2031  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 141 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.717245 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2006  NUDIX hydrolase  39.23 
 
 		 141 aa  86.3  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1112  NUDIX hydrolase  43.31 
 
 		 170 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0983  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 138 aa  83.6  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.246298 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3446  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 464 aa  79  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1334  NUDIX hydrolase  41.27 
 
 		 161 aa  79.7  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0310402  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2007  hypothetical protein  42.06 
 
 		 155 aa  78.6  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0268517 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2275  NUDIX hydrolase  35.43 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.961182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0901  NUDIX hydrolase  39.1 
 
 		 153 aa  74.3  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0950786 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2100  NUDIX hydrolase  36.72 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2189  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1638  NUDIX hydrolase  33.57 
 
 		 138 aa  68.2  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.611256 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1639  NUDIX hydrolase  36.28 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000139733  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2092  NUDIX hydrolase  33.04 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000618105  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0810  NUDIX hydrolase  35.45 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40358  predicted protein  30.99 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1786  NUDIX hydrolase  35.56 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0655514  normal  0.470183 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1545  NUDIX/MutT family protein  35.59 
 
 		 151 aa  53.1  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000014066  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0707  NUDIX/MutT family protein  33.64 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0325  NUDIX hydrolase  28.91 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414078  normal  0.0748688 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06251  Nudix/MutT family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G13080)  31.68 
 
 		 159 aa  48.5  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.987748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4202  NUDIX hydrolase  32.31 
 
 		 145 aa  48.1  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204262 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3773  NUDIX hydrolase  27.97 
 
 		 161 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000523575 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1111  NUDIX hydrolase  27.13 
 
 		 161 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.508433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 		 229 aa  44.3  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60333  Diadenosine and Diphosphoinositol Polyphosphate Phosphohydrolase  30.5 
 
 		 179 aa  43.9  0.0009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.333376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2044  NUDIX hydrolase  30.72 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0924  NUDIX hydrolase  33.04 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000333933  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3404  NUDIX hydrolase  31.51 
 
 		 174 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321528  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3713  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 		 182 aa  42  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.639484  normal  0.0437167 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1799  NUDIX hydrolase  37.88 
 
 		 205 aa  41.6  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000483875  normal  0.809218 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2428  NUDIX hydrolase  42.03 
 
 		 147 aa  40.8  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00549514  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4431  NUDIX hydrolase  28.29 
 
 		 164 aa  40.4  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2923  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 		 157 aa  40.4  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.928534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4158  NUDIX hydrolase  31.45 
 
 		 166 aa  40.4  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2879  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 		 157 aa  40.4  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2909  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 		 157 aa  40.4  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188033  normal  0.899663 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>