57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2173 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2173  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 152 aa  305  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.259944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2451  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 152 aa  305  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0559417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2136  NUDIX hydrolase  92.76 
 
 		 152 aa  268  1e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.701538 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2073  NUDIX hydrolase  72.66 
 
 		 144 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.325877  normal  0.12084 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1112  NUDIX hydrolase  64.43 
 
 		 170 aa  176  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2150  NUDIX hydrolase  65.54 
 
 		 163 aa  175  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42149  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0220  NUDIX hydrolase  45 
 
 		 170 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.120997 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3446  NUDIX hydrolase  55.64 
 
 		 464 aa  122  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3606  hypothetical protein  50 
 
 		 390 aa  121  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.113159 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0390  NUDIX hydrolase  47.52 
 
 		 168 aa  120  7e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402427  normal  0.791613 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2388  hypothetical protein  49.62 
 
 		 166 aa  120  7e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.398073  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1052  NUDIX hydrolase  49.62 
 
 		 166 aa  120  7e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.302122  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0635  NUDIX hydrolase  51.97 
 
 		 156 aa  118  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00453948  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1884  NUDIX hydrolase  48.87 
 
 		 165 aa  118  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.391735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4258  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 181 aa  117  7e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.638614 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8019  NUDIX hydrolase  53.54 
 
 		 246 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208881  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0444  NUDIX hydrolase  48.85 
 
 		 176 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6066  NUDIX hydrolase  53.04 
 
 		 175 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0725439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0668  NUDIX hydrolase  47.76 
 
 		 155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.980148  normal  0.537231 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1129  NUDIX hydrolase  46.09 
 
 		 156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.701065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1334  NUDIX hydrolase  48.09 
 
 		 161 aa  110  7.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0310402  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5783  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  44.7 
 
 		 162 aa  109  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0488  NUDIX hydrolase  47.33 
 
 		 176 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.950103 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3272  NUDIX hydrolase  46.72 
 
 		 163 aa  108  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5832  NUDIX hydrolase  49.22 
 
 		 164 aa  107  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1757  NUDIX hydrolase  51.94 
 
 		 177 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.128298  normal  0.0562485 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3198  hypothetical protein  42.34 
 
 		 141 aa  104  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2007  hypothetical protein  47.45 
 
 		 155 aa  101  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0268517 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2056  hypothetical protein  45.45 
 
 		 159 aa  100  8e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.334571 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1413  NUDIX hydrolase  54.62 
 
 		 190 aa  99  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9038  hypothetical protein  40.16 
 
 		 178 aa  98.2  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6062  NUDIX hydrolase  43.41 
 
 		 158 aa  95.5  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5998  NUDIX hydrolase  43.41 
 
 		 175 aa  94.7  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.211306 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2189  NUDIX hydrolase  42.06 
 
 		 201 aa  94  6e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2132  NUDIX hydrolase  42.34 
 
 		 162 aa  92.4  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1045  MutT/nudix family protein  44.09 
 
 		 162 aa  92.4  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1009  MutT/nudix family protein  43.31 
 
 		 162 aa  89  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1638  NUDIX hydrolase  40.88 
 
 		 138 aa  86.7  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.611256 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2092  NUDIX hydrolase  40.48 
 
 		 156 aa  85.9  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000618105  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2100  NUDIX hydrolase  38.64 
 
 		 139 aa  84.7  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0983  NUDIX hydrolase  37.88 
 
 		 138 aa  84.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.246298 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2275  NUDIX hydrolase  37.01 
 
 		 149 aa  83.6  9e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.961182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1545  NUDIX/MutT family protein  36.72 
 
 		 151 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000014066  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1639  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 127 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000139733  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2031  NUDIX hydrolase  39.5 
 
 		 141 aa  77.8  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.717245 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0707  NUDIX/MutT family protein  35.71 
 
 		 134 aa  77.4  0.00000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2006  NUDIX hydrolase  39.5 
 
 		 141 aa  77.4  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0901  NUDIX hydrolase  41.6 
 
 		 153 aa  75.5  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0950786 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0810  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1786  NUDIX hydrolase  36.07 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0655514  normal  0.470183 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0924  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000333933  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40358  predicted protein  31.2 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2044  NUDIX hydrolase  32.89 
 
 		 160 aa  53.1  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60333  Diadenosine and Diphosphoinositol Polyphosphate Phosphohydrolase  30.16 
 
 		 179 aa  42  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.333376  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0747  hypothetical protein  36.25 
 
 		 153 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1483  NUDIX hydrolase  41.46 
 
 		 210 aa  40.8  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.163061 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06251  Nudix/MutT family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G13080)  26.83 
 
 		 159 aa  40.8  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.987748  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>