67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0668 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0668  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 155 aa  320  7e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.980148  normal  0.537231 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0635  NUDIX hydrolase  55.3 
 
 		 156 aa  142  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00453948  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0444  NUDIX hydrolase  51.66 
 
 		 176 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0390  NUDIX hydrolase  46.41 
 
 		 168 aa  134  5e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402427  normal  0.791613 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5783  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  49.67 
 
 		 162 aa  133  7.000000000000001e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0488  NUDIX hydrolase  51.77 
 
 		 176 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.950103 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1884  NUDIX hydrolase  50.38 
 
 		 165 aa  127  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.391735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2388  hypothetical protein  48.51 
 
 		 166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.398073  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1052  NUDIX hydrolase  48.85 
 
 		 166 aa  122  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.302122  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5832  NUDIX hydrolase  50.71 
 
 		 164 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6066  NUDIX hydrolase  48.12 
 
 		 175 aa  121  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0725439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3272  NUDIX hydrolase  47.06 
 
 		 163 aa  114  5e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2056  hypothetical protein  47.45 
 
 		 159 aa  113  7.999999999999999e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.334571 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9038  hypothetical protein  43.75 
 
 		 178 aa  113  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2132  NUDIX hydrolase  44.85 
 
 		 162 aa  112  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1045  MutT/nudix family protein  44.12 
 
 		 162 aa  110  6e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1757  NUDIX hydrolase  48.2 
 
 		 177 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.128298  normal  0.0562485 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4258  NUDIX hydrolase  47.33 
 
 		 181 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.638614 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1009  MutT/nudix family protein  42.55 
 
 		 162 aa  107  6e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1334  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 		 161 aa  102  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0310402  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0220  NUDIX hydrolase  42.22 
 
 		 170 aa  102  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.120997 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3606  hypothetical protein  42.42 
 
 		 390 aa  101  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.113159 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5998  NUDIX hydrolase  46.46 
 
 		 175 aa  100  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.211306 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6062  NUDIX hydrolase  46.46 
 
 		 158 aa  100  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1413  NUDIX hydrolase  48.2 
 
 		 190 aa  99.4  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2073  NUDIX hydrolase  46.67 
 
 		 144 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.325877  normal  0.12084 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2136  NUDIX hydrolase  46.27 
 
 		 152 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.701538 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2451  NUDIX hydrolase  47.76 
 
 		 152 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0559417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2173  NUDIX hydrolase  47.76 
 
 		 152 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.259944 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2150  NUDIX hydrolase  48.09 
 
 		 163 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42149  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8019  NUDIX hydrolase  45.8 
 
 		 246 aa  94  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208881  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2275  NUDIX hydrolase  35.66 
 
 		 149 aa  92.4  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.961182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2189  NUDIX hydrolase  38.35 
 
 		 201 aa  90.1  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2007  hypothetical protein  48.06 
 
 		 155 aa  89.7  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0268517 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3198  hypothetical protein  39.23 
 
 		 141 aa  88.6  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3446  NUDIX hydrolase  43.61 
 
 		 464 aa  85.9  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1129  NUDIX hydrolase  36.92 
 
 		 156 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.701065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1545  NUDIX/MutT family protein  39.83 
 
 		 151 aa  84.3  5e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000014066  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1112  NUDIX hydrolase  42.96 
 
 		 170 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0901  NUDIX hydrolase  37.6 
 
 		 153 aa  81.3  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0950786 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2092  NUDIX hydrolase  38.6 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000618105  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1639  NUDIX hydrolase  34.21 
 
 		 127 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000139733  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2006  NUDIX hydrolase  34.13 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2031  NUDIX hydrolase  34.13 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.717245 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0810  NUDIX hydrolase  35.96 
 
 		 136 aa  74.7  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2100  NUDIX hydrolase  33.86 
 
 		 139 aa  73.9  0.0000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0707  NUDIX/MutT family protein  35.09 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1638  NUDIX hydrolase  37.72 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.611256 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0983  NUDIX hydrolase  33.86 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.246298 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1786  NUDIX hydrolase  38.35 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0655514  normal  0.470183 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0924  NUDIX hydrolase  41.23 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000333933  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06251  Nudix/MutT family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G13080)  30.6 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.987748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60333  Diadenosine and Diphosphoinositol Polyphosphate Phosphohydrolase  27.59 
 
 		 179 aa  52.4  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.333376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40358  predicted protein  29.05 
 
 		 170 aa  48.9  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  38.81 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21220  uridine kinase  37.14 
 
 		 354 aa  45.4  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5357  NUDIX hydrolase  31.94 
 
 		 154 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.737057 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  29.13 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  31.76 
 
 		 153 aa  43.9  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2148  mutT/nudix family protein  27.78 
 
 		 205 aa  43.9  0.0009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.992633  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0791  NUDIX family hydrolase  28.12 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000502884  hitchhiker  6.80479e-24 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1718  NUDIX hydrolase  29.93 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0152  ADP-ribose pyrophosphatase with uncharacterized conserved domain  29.52 
 
 		 312 aa  41.6  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2037  mutT/nudix family protein  26.67 
 
 		 205 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2116  mutT/nudix family protein  26.67 
 
 		 205 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.610477  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5350  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 205 aa  40.8  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.46762  normal  0.101192 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1987  NUDIX hydrolase  37.35 
 
 		 155 aa  40.4  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>