64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2388 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2388  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  334  2.9999999999999997e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.398073  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1052  NUDIX hydrolase  99.4 
 
 		 166 aa  331  3e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.302122  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1884  NUDIX hydrolase  70.3 
 
 		 165 aa  225  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.391735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0444  NUDIX hydrolase  47.73 
 
 		 176 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0668  NUDIX hydrolase  48.51 
 
 		 155 aa  125  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.980148  normal  0.537231 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0488  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 		 176 aa  121  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.950103 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2056  hypothetical protein  47.22 
 
 		 159 aa  119  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.334571 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0635  NUDIX hydrolase  47.83 
 
 		 156 aa  120  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00453948  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0390  NUDIX hydrolase  42.07 
 
 		 168 aa  117  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402427  normal  0.791613 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6066  NUDIX hydrolase  44.2 
 
 		 175 aa  114  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0725439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3606  hypothetical protein  45.04 
 
 		 390 aa  114  5e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.113159 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0220  NUDIX hydrolase  42.64 
 
 		 170 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.120997 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3272  NUDIX hydrolase  40.14 
 
 		 163 aa  107  6e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3198  hypothetical protein  42.03 
 
 		 141 aa  107  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5783  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  44.53 
 
 		 162 aa  106  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1334  NUDIX hydrolase  44.53 
 
 		 161 aa  105  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0310402  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4258  NUDIX hydrolase  44.68 
 
 		 181 aa  103  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.638614 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5832  NUDIX hydrolase  45.26 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9038  hypothetical protein  42.11 
 
 		 178 aa  102  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2173  NUDIX hydrolase  49.62 
 
 		 152 aa  101  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.259944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2451  NUDIX hydrolase  49.62 
 
 		 152 aa  101  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0559417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2073  NUDIX hydrolase  45.8 
 
 		 144 aa  100  8e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.325877  normal  0.12084 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2136  NUDIX hydrolase  48.84 
 
 		 152 aa  100  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.701538 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2275  NUDIX hydrolase  39.06 
 
 		 149 aa  100  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.961182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6062  NUDIX hydrolase  46.62 
 
 		 158 aa  100  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5998  NUDIX hydrolase  46.62 
 
 		 175 aa  99.8  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.211306 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1757  NUDIX hydrolase  45.26 
 
 		 177 aa  99.4  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.128298  normal  0.0562485 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2132  NUDIX hydrolase  42.64 
 
 		 162 aa  96.3  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0901  NUDIX hydrolase  42.4 
 
 		 153 aa  94.7  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0950786 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2031  NUDIX hydrolase  39.55 
 
 		 141 aa  94  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.717245 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3446  NUDIX hydrolase  44.37 
 
 		 464 aa  94  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2189  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 		 201 aa  92.4  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0983  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 138 aa  92.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.246298 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1129  NUDIX hydrolase  37.6 
 
 		 156 aa  93.2  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.701065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2006  NUDIX hydrolase  39.84 
 
 		 141 aa  92.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2100  NUDIX hydrolase  38.81 
 
 		 139 aa  91.3  5e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2150  NUDIX hydrolase  44.09 
 
 		 163 aa  91.3  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42149  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2007  hypothetical protein  41.86 
 
 		 155 aa  90.5  9e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0268517 
 
 
-
 
NC_004310  BR1045  MutT/nudix family protein  42.11 
 
 		 162 aa  89.7  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1009  MutT/nudix family protein  41.35 
 
 		 162 aa  86.3  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1545  NUDIX/MutT family protein  43.27 
 
 		 151 aa  85.5  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000014066  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1413  NUDIX hydrolase  42.34 
 
 		 190 aa  85.5  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2092  NUDIX hydrolase  40.35 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000618105  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1112  NUDIX hydrolase  41.6 
 
 		 170 aa  82.4  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1639  NUDIX hydrolase  38.6 
 
 		 127 aa  80.9  0.000000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000139733  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0707  NUDIX/MutT family protein  37.84 
 
 		 134 aa  76.3  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1638  NUDIX hydrolase  37.72 
 
 		 138 aa  74.7  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.611256 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0810  NUDIX hydrolase  38.94 
 
 		 136 aa  73.6  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8019  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 		 246 aa  72  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208881  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1786  NUDIX hydrolase  42.73 
 
 		 137 aa  70.1  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0655514  normal  0.470183 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60333  Diadenosine and Diphosphoinositol Polyphosphate Phosphohydrolase  29.37 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.333376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40358  predicted protein  27.74 
 
 		 170 aa  54.7  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0924  NUDIX hydrolase  37.84 
 
 		 137 aa  53.9  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000333933  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  28.91 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3773  NUDIX hydrolase  29.66 
 
 		 161 aa  49.7  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000523575 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06251  Nudix/MutT family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G13080)  32.76 
 
 		 159 aa  48.1  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.987748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4202  NUDIX hydrolase  32.81 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204262 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1111  NUDIX hydrolase  29.71 
 
 		 161 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.508433  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  32 
 
 		 153 aa  44.3  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1402  NUDIX hydrolase  32.43 
 
 		 148 aa  43.9  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7253  NUDIX hydrolase  39.68 
 
 		 160 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  29.03 
 
 		 155 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3237  NUDIX hydrolase  29.52 
 
 		 187 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.653435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0392  NUDIX family hydrolase  23.62 
 
 		 149 aa  40.8  0.008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000292752 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>