57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0488 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0488  NUDIX hydrolase  100 
 
 
176 aa  363  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.950103 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0444  NUDIX hydrolase  89.77 
 
 
176 aa  325  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0390  NUDIX hydrolase  58.71 
 
 
168 aa  192  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402427  normal  0.791613 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5783  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  56.76 
 
 
162 aa  184  4e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9038  hypothetical protein  45.16 
 
 
178 aa  146  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5832  NUDIX hydrolase  48.73 
 
 
164 aa  140  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6066  NUDIX hydrolase  48.67 
 
 
175 aa  140  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0725439  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1757  NUDIX hydrolase  48.99 
 
 
177 aa  131  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.128298  normal  0.0562485 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0668  NUDIX hydrolase  51.77 
 
 
155 aa  129  3e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.980148  normal  0.537231 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1884  NUDIX hydrolase  50 
 
 
165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.391735  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2388  hypothetical protein  45.45 
 
 
166 aa  121  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.398073  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1052  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 
166 aa  120  9e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.302122  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6062  NUDIX hydrolase  45.27 
 
 
158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1334  NUDIX hydrolase  46.85 
 
 
161 aa  118  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0310402  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5998  NUDIX hydrolase  45.27 
 
 
175 aa  118  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.211306 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3198  hypothetical protein  43.94 
 
 
141 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2056  hypothetical protein  44.29 
 
 
159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.334571 
 
 
-
 
NC_004310  BR1045  MutT/nudix family protein  43.94 
 
 
162 aa  107  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1009  MutT/nudix family protein  43.94 
 
 
162 aa  107  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3272  NUDIX hydrolase  42.47 
 
 
163 aa  105  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0635  NUDIX hydrolase  41.61 
 
 
156 aa  102  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00453948  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2132  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
162 aa  102  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2073  NUDIX hydrolase  46.21 
 
 
144 aa  102  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.325877  normal  0.12084 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4258  NUDIX hydrolase  44.36 
 
 
181 aa  102  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.638614 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8019  NUDIX hydrolase  46.09 
 
 
246 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208881  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0220  NUDIX hydrolase  38.19 
 
 
170 aa  99  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.120997 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3446  NUDIX hydrolase  44.76 
 
 
464 aa  97.8  7e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23959  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1413  NUDIX hydrolase  48.12 
 
 
190 aa  97.4  8e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2007  hypothetical protein  45.14 
 
 
155 aa  97.1  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0268517 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1112  NUDIX hydrolase  45.65 
 
 
170 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3606  hypothetical protein  39.69 
 
 
390 aa  93.2  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.113159 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2136  NUDIX hydrolase  46.56 
 
 
152 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.701538 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2150  NUDIX hydrolase  47.73 
 
 
163 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42149  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2173  NUDIX hydrolase  47.33 
 
 
152 aa  91.7  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.259944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2451  NUDIX hydrolase  47.33 
 
 
152 aa  91.7  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0559417  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2031  NUDIX hydrolase  36.72 
 
 
141 aa  87.8  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.717245 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0901  NUDIX hydrolase  39.62 
 
 
153 aa  87.4  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0950786 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2006  NUDIX hydrolase  36.72 
 
 
141 aa  87  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0983  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
138 aa  85.9  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.246298 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2189  NUDIX hydrolase  34.97 
 
 
201 aa  84.3  8e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1129  NUDIX hydrolase  35.86 
 
 
156 aa  84  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.701065  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2275  NUDIX hydrolase  31.91 
 
 
149 aa  81.3  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.961182  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2100  NUDIX hydrolase  35.94 
 
 
139 aa  77.8  0.00000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1638  NUDIX hydrolase  35.77 
 
 
138 aa  68.2  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.611256 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2092  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
156 aa  67.8  0.00000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000618105  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0810  NUDIX hydrolase  35.34 
 
 
136 aa  59.7  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1545  NUDIX/MutT family protein  33.83 
 
 
151 aa  59.7  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000014066  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1786  NUDIX hydrolase  36.89 
 
 
137 aa  59.3  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0655514  normal  0.470183 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0707  NUDIX/MutT family protein  37.29 
 
 
134 aa  58.5  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40358  predicted protein  31.1 
 
 
170 aa  57.4  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1639  NUDIX hydrolase  33.6 
 
 
127 aa  57  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000139733  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0924  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 
137 aa  45.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000333933  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4495  NUDIX hydrolase  30.28 
 
 
158 aa  43.5  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.031023  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5350  NUDIX hydrolase  45.1 
 
 
205 aa  42.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.46762  normal  0.101192 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06251  Nudix/MutT family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G13080)  31.82 
 
 
159 aa  42  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.987748  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0392  NUDIX family hydrolase  25 
 
 
149 aa  41.6  0.007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000292752 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  39.34 
 
 
155 aa  40.8  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>