106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1639 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1639  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 127 aa  260  4e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000139733  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2092  NUDIX hydrolase  77.24 
 
 		 156 aa  206  6e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000618105  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0707  NUDIX/MutT family protein  70.4 
 
 		 134 aa  192  2e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0924  NUDIX hydrolase  73.23 
 
 		 137 aa  179  8.000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000333933  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0810  NUDIX hydrolase  61.79 
 
 		 136 aa  170  5.999999999999999e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1545  NUDIX/MutT family protein  59.66 
 
 		 151 aa  158  3e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000014066  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1638  NUDIX hydrolase  55.28 
 
 		 138 aa  149  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.611256 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2275  NUDIX hydrolase  43.65 
 
 		 149 aa  107  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.961182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2006  NUDIX hydrolase  43.09 
 
 		 141 aa  100  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2031  NUDIX hydrolase  43.09 
 
 		 141 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.717245 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2100  NUDIX hydrolase  43.9 
 
 		 139 aa  98.6  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0983  NUDIX hydrolase  44.72 
 
 		 138 aa  93.6  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.246298 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2189  NUDIX hydrolase  38.02 
 
 		 201 aa  90.1  9e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0635  NUDIX hydrolase  39.09 
 
 		 156 aa  87.8  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00453948  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3606  hypothetical protein  38.05 
 
 		 390 aa  81.6  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.113159 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0220  NUDIX hydrolase  36.51 
 
 		 170 aa  82  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.120997 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1884  NUDIX hydrolase  40.71 
 
 		 165 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.391735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2388  hypothetical protein  38.6 
 
 		 166 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.398073  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1052  NUDIX hydrolase  38.6 
 
 		 166 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.302122  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3272  NUDIX hydrolase  37.17 
 
 		 163 aa  79.7  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1786  NUDIX hydrolase  42.45 
 
 		 137 aa  80.1  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0655514  normal  0.470183 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0668  NUDIX hydrolase  34.21 
 
 		 155 aa  75.1  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.980148  normal  0.537231 
 
 
-
 
NC_004310  BR1045  MutT/nudix family protein  36.13 
 
 		 162 aa  72.8  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2132  NUDIX hydrolase  36.13 
 
 		 162 aa  73.2  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1334  NUDIX hydrolase  38.14 
 
 		 161 aa  72.8  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0310402  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0901  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0950786 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1009  MutT/nudix family protein  36.13 
 
 		 162 aa  72  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4258  NUDIX hydrolase  40.46 
 
 		 181 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.638614 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2150  NUDIX hydrolase  38.93 
 
 		 163 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42149  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6066  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 		 175 aa  68.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0725439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0444  NUDIX hydrolase  36.8 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2007  hypothetical protein  39.47 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0268517 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2056  hypothetical protein  47.14 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.334571 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1112  NUDIX hydrolase  39.37 
 
 		 170 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0390  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 		 168 aa  63.2  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402427  normal  0.791613 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1129  NUDIX hydrolase  30.09 
 
 		 156 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.701065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3446  NUDIX hydrolase  47.62 
 
 		 464 aa  60.5  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3198  hypothetical protein  33.93 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2173  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.259944 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2073  NUDIX hydrolase  36.22 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.325877  normal  0.12084 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2451  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0559417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1413  NUDIX hydrolase  36.21 
 
 		 190 aa  57.8  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2136  NUDIX hydrolase  36.51 
 
 		 152 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.701538 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0488  NUDIX hydrolase  33.6 
 
 		 176 aa  57  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.950103 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5832  NUDIX hydrolase  38.94 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9038  hypothetical protein  33.93 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8019  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 		 246 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208881  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5783  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  31.67 
 
 		 162 aa  52.4  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06251  Nudix/MutT family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G13080)  31.3 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.987748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47297  predicted protein  36.62 
 
 		 416 aa  49.3  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1757  NUDIX hydrolase  36.28 
 
 		 177 aa  48.9  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.128298  normal  0.0562485 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  40.98 
 
 		 536 aa  48.5  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1448  ADP-ribose pyrophosphatase  44 
 
 		 430 aa  47.8  0.00005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3407  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.107532 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5998  NUDIX hydrolase  36.28 
 
 		 175 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.211306 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6062  NUDIX hydrolase  36.28 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3914  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.434564 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  45.65 
 
 		 258 aa  45.4  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4365  NUDIX hydrolase  35.19 
 
 		 141 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4001  NUDIX hydrolase  35.19 
 
 		 141 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3522  NUDIX hydrolase  35.19 
 
 		 141 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.478841 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5080  NUDIX hydrolase  42.59 
 
 		 158 aa  43.9  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4436  NUDIX hydrolase  32.43 
 
 		 180 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0213  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 		 178 aa  43.9  0.0008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0378357  normal  0.391369 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4548  NUDIX hydrolase  39.71 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2090  NUDIX hydrolase  41.46 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.147471  normal  0.280778 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2504  putative ADP-ribose pyrophosphatase, NUDIX hydrolase, nudF  40 
 
 		 181 aa  42.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1404  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 157 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567181  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1536  NUDIX hydrolase  39.02 
 
 		 205 aa  43.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.058172  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1733  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 181 aa  42.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.361555  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2017  NUDIX hydrolase  37.35 
 
 		 183 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1980  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 209 aa  42.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.280065 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1191  NUDIX hydrolase  32.35 
 
 		 211 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0922  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40358  predicted protein  26.61 
 
 		 170 aa  42.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6207  putative NUDIX hydrolase  41.3 
 
 		 322 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1661  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.753225  normal  0.0347123 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1483  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 		 210 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.163061 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60333  Diadenosine and Diphosphoinositol Polyphosphate Phosphohydrolase  27.03 
 
 		 179 aa  42  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.333376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5518  NUDIX hydrolase  38.64 
 
 		 183 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1250  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  42 
 
 		 181 aa  41.2  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1981  mutT/nudix family protein  42 
 
 		 181 aa  41.2  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2508  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  42 
 
 		 181 aa  41.2  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1733  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  42 
 
 		 181 aa  41.2  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0391  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  42 
 
 		 181 aa  41.2  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1812  nudix hydrolase  42 
 
 		 181 aa  41.2  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1828  nudix hydrolase  42 
 
 		 181 aa  41.2  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.54633  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0771  nudix hydrolase  42 
 
 		 181 aa  41.2  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.176902  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0453  NUDIX hydrolase  42.55 
 
 		 215 aa  41.6  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1281  NUDIX hydrolase  38.75 
 
 		 156 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1315  NUDIX hydrolase  38.75 
 
 		 156 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.511776  normal  0.0806389 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2830  NUDIX hydrolase  32.93 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282197  normal  0.0206964 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1197  NUDIX hydrolase  30.28 
 
 		 216 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4699  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 181 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.367881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4812  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 140 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1077  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 181 aa  41.2  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1557  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 181 aa  41.2  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338858  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1577  NUDIX hydrolase  33.8 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.479976  normal  0.0612307 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1382  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 		 156 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.162154 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1533  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 181 aa  41.2  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692629  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>