276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2836 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2836  NUDIX hydrolase  100 
 
 
158 aa  327  4e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927915  normal  0.666703 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3244  NUDIX hydrolase  41.06 
 
 
158 aa  114  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2037  NUDIX hydrolase  34.9 
 
 
155 aa  112  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0645  NUDIX hydrolase  35.95 
 
 
153 aa  111  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0664584 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3074  mutT/nudix family protein  32.21 
 
 
155 aa  110  9e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3056  mutT/nudix family protein  32.21 
 
 
157 aa  108  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2802  MutT/Nudix family protein  31.54 
 
 
157 aa  107  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187325  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2765  MutT/Nudix family protein  32.21 
 
 
157 aa  107  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2831  NUDIX hydrolase  32.21 
 
 
155 aa  105  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00779282  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3048  MutT/Nudix family protein  31.54 
 
 
155 aa  105  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3611  MutT/nudix family protein  36.65 
 
 
169 aa  105  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.454124  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2202  phosphohydrolase  32.14 
 
 
155 aa  104  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.784536  hitchhiker  0.000000000000369619 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3081  mutT/nudix family protein  30.87 
 
 
155 aa  103  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.401788  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3223  NUDIX hydrolase  36.42 
 
 
170 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2108  NUDIX hydrolase  36.73 
 
 
157 aa  102  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000452555  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3518  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 
170 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2830  mutT/nudix family protein  31.08 
 
 
155 aa  100  7e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.582109  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3044  mutT/nudix family protein  31.08 
 
 
155 aa  100  7e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3612  MutT/nudix family protein  35.48 
 
 
169 aa  94.4  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.463705  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0614  NUDIX hydrolase  35.33 
 
 
169 aa  87  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.287275  normal  0.48295 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0073  MutT/nudix family protein  33.1 
 
 
162 aa  84.3  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0227  hypothetical protein  31.88 
 
 
167 aa  75.5  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0598  NUDIX hydrolase  28.37 
 
 
163 aa  68.9  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0490  NUDIX/MutT family protein  31.37 
 
 
168 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000225283  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0717  NUDIX hydrolase  34 
 
 
168 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1790  NUDIX hydrolase  31.69 
 
 
168 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000145412  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1043  NUDIX family hydrolase  27.86 
 
 
159 aa  63.9  0.0000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1195  MutT/nudix family protein  31.58 
 
 
153 aa  63.2  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1648  NUDIX hydrolase  29.73 
 
 
172 aa  60.5  0.000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000051086  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2839  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
140 aa  59.7  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00261887  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2535  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 
140 aa  58.5  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.240977  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2057  NUDIX hydrolase  32.64 
 
 
168 aa  58.5  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000169928  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2742  mutT/nudix family protein  29.32 
 
 
148 aa  57.4  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000947125  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2714  mutT/nudix family protein  30.58 
 
 
148 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0283427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2453  MutT/Nudix family protein  29.32 
 
 
148 aa  57  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0206727  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0536  NUDIX hydrolase  36 
 
 
140 aa  57  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4321  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
181 aa  56.6  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00183396  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1505  MutT/nudix family protein  35.14 
 
 
158 aa  55.8  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000663569  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1929  NUDIX hydrolase  32.28 
 
 
195 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.347104  normal  0.0451011 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0659  mutT/nudix family protein  38.67 
 
 
140 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2545  MutT/Nudix family protein  26.52 
 
 
146 aa  55.5  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103897  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0589  mutT/nudix family protein  38.67 
 
 
140 aa  55.1  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0533  MutT/NUDIX family protein  38.67 
 
 
140 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.133702  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0622  mutT/nudix family protein  38.67 
 
 
140 aa  55.1  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2593  mutT/nudix family protein  27.08 
 
 
146 aa  54.7  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00926746  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2424  MutT/Nudix family protein  30.58 
 
 
148 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.919203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2781  mutT/nudix family protein  27.08 
 
 
144 aa  54.7  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0324228  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2691  mutT/nudix family protein  30.58 
 
 
148 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000651612 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4678  mutT/nudix family protein  37.33 
 
 
140 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.1477999999999999e-21 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2463  NUDIX hydrolase  28.46 
 
 
148 aa  54.3  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.101073  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0691  mutT/nudix family protein  37.33 
 
 
140 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0234  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
163 aa  53.9  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.425088  normal  0.397447 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2492  mutT/nudix family protein  29.75 
 
 
148 aa  53.9  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.802073  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2810  mutT/nudix family protein  26.03 
 
 
146 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00396019  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0533  MutT/NUDIX family protein  37.33 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2511  MutT/Nudix family protein  26.92 
 
 
146 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0343264  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0677  mutT/nudix family protein  37.33 
 
 
140 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000877041 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2832  MutT/nudix family protein  25.37 
 
 
146 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0990574  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2554  NUDIX hydrolase  32.35 
 
 
160 aa  53.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2699  mutT/nudix family protein  28.89 
 
 
148 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3311  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 
147 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3377  MutT/Nudix family protein  40.3 
 
 
147 aa  52  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2676  mutT/nudix family protein  31.58 
 
 
136 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.870264  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1999  mutT/nudix family protein  38.82 
 
 
153 aa  52  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00120864  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3416  mutT/nudix family protein  40.3 
 
 
147 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2595  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 
148 aa  52  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3685  mutT/nudix family protein  40.3 
 
 
147 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293788  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1584  mutT/nudix family protein  38.24 
 
 
147 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0325451 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3636  mutT/nudix family protein  40.3 
 
 
147 aa  52  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3327  MutT/Nudix family protein  40.3 
 
 
147 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1601  NUDIX hydrolase  32.03 
 
 
195 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0469554  normal  0.381093 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3653  mutT/nudix family protein  40.3 
 
 
147 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  38.82 
 
 
229 aa  51.2  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2094  mutT/nudix family protein  38.82 
 
 
153 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1854  mutT/nudix family protein  38.82 
 
 
153 aa  50.8  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1825  MutT/Nudix family protein  38.82 
 
 
153 aa  50.8  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200422  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2030  mutT/nudix family protein  38.82 
 
 
153 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.83484e-43 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1809  MutT/Nudix family protein  38.82 
 
 
153 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00380434  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2503  phosphohydrolase  27.78 
 
 
145 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.792116 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3330  mutT/nudix family protein  38.82 
 
 
153 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371651  unclonable  1.49498e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1997  mutT/nudix family protein  38.82 
 
 
153 aa  50.8  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000428877  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3733  mutT/nudix family protein  38.81 
 
 
147 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.412613  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 
136 aa  50.8  0.000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1618  hypothetical protein  29.69 
 
 
195 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2611  mutT/nudix family protein  28.15 
 
 
148 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000504287 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1463  NUDIX hydrolase  35.53 
 
 
165 aa  49.7  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.116619  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1860  NUDIX hydrolase  36.47 
 
 
153 aa  49.7  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00730748  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0598  NUDIX hydrolase  31.2 
 
 
162 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1217  NUDIX hydrolase  29.03 
 
 
194 aa  49.7  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0420645  normal  0.0231273 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5820  hypothetical protein  36.9 
 
 
158 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67120  hypothetical protein  36.9 
 
 
158 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0317  ADP-ribose pyrophosphatase  27.12 
 
 
156 aa  48.9  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 
153 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4949  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 
152 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.626782  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3644  mutT/nudix family protein  35.82 
 
 
147 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00160  ADP-ribose pyrophosphatase  30.16 
 
 
143 aa  48.5  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.119195 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  43.33 
 
 
473 aa  48.9  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2683  mutT/nudix family protein  30.58 
 
 
147 aa  48.5  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  30.21 
 
 
143 aa  48.5  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51490  hypothetical protein  46 
 
 
212 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  hitchhiker  0.000162281 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>