98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4058 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4058  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  253  6e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.168022 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 155 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1807  mutator MutT-like  27.59 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.829238  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1718  NUDIX hydrolase  25.78 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  29.51 
 
 		 134 aa  47.4  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  31.15 
 
 		 155 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  31.15 
 
 		 155 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4056  mutator MutT protein  41.67 
 
 		 131 aa  47  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.640988  normal  0.0322443 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  31.15 
 
 		 155 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4759  NUDIX hydrolase  31.36 
 
 		 203 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.420324 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  32.11 
 
 		 155 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  31.19 
 
 		 155 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1243  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 141 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  31.19 
 
 		 155 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0963  NUDIX hydrolase  32.32 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  32.06 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2888  NUDIX hydrolase  30.16 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5170  NUDIX hydrolase  31.71 
 
 		 124 aa  45.1  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.140908  normal  0.555587 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1103  nudix hydrolase  42.86 
 
 		 524 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.426954 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3659  NUDIX hydrolase  31.63 
 
 		 151 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3713  NUDIX hydrolase  31.63 
 
 		 151 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.34435 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1486  NUDIX hydrolase  45.83 
 
 		 131 aa  44.7  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00282357  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1167  NUDIX hydrolase  26.53 
 
 		 164 aa  44.3  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2930  NUDIX hydrolase  29.84 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2108  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 		 157 aa  43.9  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000452555  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  48.84 
 
 		 363 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0214  NUDIX hydrolase  29.92 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0544  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 		 166 aa  43.9  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1128  NUDIX hydrolase  33.67 
 
 		 141 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0349929  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  44.19 
 
 		 360 aa  43.9  0.0008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2289  NUDIX hydrolase  46.55 
 
 		 132 aa  43.5  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.648467  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2201  NUDIX hydrolase  46.55 
 
 		 132 aa  43.5  0.0009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19205  hypothetical protein  27.73 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1185  ADP-ribose pyrophosphatase  26.47 
 
 		 164 aa  43.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.792217  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  25.77 
 
 		 352 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2944  NUDIX hydrolase  30.1 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.948773 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0574  mutator MutT protein  32.1 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.37378  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  25.77 
 
 		 352 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04292  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  34.58 
 
 		 351 aa  42.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  41.82 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2293  mutator MutT protein  38.18 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.192428  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2414  NUDIX hydrolase  38.18 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5518  NUDIX hydrolase  43.48 
 
 		 183 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1062  NUDIX hydrolase  27.42 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2716  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  30.11 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06372  hypothetical protein  25.2 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  28.18 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1657  hypothetical protein  27.59 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.745316  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2640  MutT/nudix family protein  28.83 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0434568  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1657  NUDIX hydrolase  46.55 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.809555  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1484  NUDIX hydrolase  53.66 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4549  NUDIX hydrolase  27.34 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0460835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1103  NUDIX hydrolase  27.42 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.440474 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1218  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 		 194 aa  41.6  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.843116 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2957  MutT/nudix family protein  28.83 
 
 		 159 aa  42  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1773  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 149 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.292364  normal  0.252484 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3074  mutT/nudix family protein  33.33 
 
 		 155 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  46.51 
 
 		 570 aa  42  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  48.08 
 
 		 152 aa  42  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3934  NUDIX hydrolase  28.95 
 
 		 139 aa  42  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1495  NUDIX hydrolase  28 
 
 		 149 aa  41.6  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0340127 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1033  NUDIX hydrolase  42.55 
 
 		 542 aa  41.6  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0906744 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1170  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 137 aa  41.2  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000110534  normal  0.0271169 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0784  NUDIX hydrolase  42 
 
 		 155 aa  41.2  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1196  mutator MutT protein  28.69 
 
 		 160 aa  41.6  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3611  MutT/nudix family protein  43.18 
 
 		 169 aa  41.2  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.454124  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3925  mutator MutT protein  38.46 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2082  NUDIX hydrolase  30.63 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.494024 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0363  mutator MutT protein  39.58 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3733  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  33.33 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0829824  normal  0.0242018 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2491  NUDIX hydrolase  40.98 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0324  NUDIX hydrolase  25.87 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1099  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  26.89 
 
 		 160 aa  41.2  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000230167  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4066  mutator MutT protein  38.98 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17440  ADP-ribose pyrophosphatase  27.08 
 
 		 336 aa  41.2  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303863  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  48.84 
 
 		 312 aa  40.8  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3081  mutT/nudix family protein  32.43 
 
 		 155 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.401788  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0299  mutator MutT protein  46.34 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2836  NUDIX hydrolase  46.51 
 
 		 158 aa  40.8  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927915  normal  0.666703 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3948  mutator MutT protein  38.46 
 
 		 130 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1890  Mutator MutT  45.24 
 
 		 142 aa  40.4  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.620209 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4350  NUDIX hydrolase  27.42 
 
 		 137 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2939  NUDIX hydrolase  43.48 
 
 		 130 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0473  protein of unknown function DUF1152  29.41 
 
 		 530 aa  40.8  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4650  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 163 aa  40.4  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3223  NUDIX hydrolase  43.18 
 
 		 170 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1092  NUDIX hydrolase  28.91 
 
 		 137 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0617  hypothetical protein  33.33 
 
 		 133 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0831  NUDIX hydrolase  32.81 
 
 		 166 aa  40.4  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.556383  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3518  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 		 170 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1102  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 		 136 aa  40.4  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.142351  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2984  NUDIX hydrolase  46.67 
 
 		 136 aa  40.4  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000021571  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51490  hypothetical protein  30.68 
 
 		 212 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  hitchhiker  0.000162281 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2885  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 175 aa  40.4  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000755007  normal  0.649673 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1287  NUDIX hydrolase  46.51 
 
 		 154 aa  40.4  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0960276  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 		 143 aa  40  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1282  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 136 aa  40  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.838379  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1029  NUDIX hydrolase  43.18 
 
 		 127 aa  40  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>