236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0412 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_0412  dinucleoside polyphosphate hydrolase  100 
 
 
168 aa  344  4e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.309928 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0166  dinucleoside polyphosphate hydrolase  86.23 
 
 
168 aa  298  2e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0168  dinucleoside polyphosphate hydrolase  86.75 
 
 
175 aa  298  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0527  dinucleoside polyphosphate hydrolase  85.03 
 
 
179 aa  295  1e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.741334  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0564  dinucleoside polyphosphate hydrolase  84.94 
 
 
167 aa  292  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0260  dinucleoside polyphosphate hydrolase  83.73 
 
 
167 aa  289  1e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0451  dinucleoside polyphosphate hydrolase  79.64 
 
 
170 aa  277  5e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.446656  normal  0.65944 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2145  dinucleoside polyphosphate hydrolase  61.82 
 
 
172 aa  224  4e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.69652 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0096  NUDIX hydrolase  66.26 
 
 
184 aa  216  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4735  NUDIX hydrolase  63.03 
 
 
182 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000037989  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4225  NUDIX hydrolase  65.19 
 
 
186 aa  209  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.827405  normal  0.0214287 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2241  NUDIX hydrolase  58.01 
 
 
202 aa  197  7e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0585336  normal  0.241237 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2559  NUDIX hydrolase  60.61 
 
 
195 aa  194  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.599331  normal  0.115662 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2284  NUDIX hydrolase  59.39 
 
 
195 aa  192  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.151549  normal  0.0451993 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2930  NUDIX hydrolase  58.49 
 
 
167 aa  189  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.36611  normal  0.994412 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3887  dinucleoside polyphosphate hydrolase  53.89 
 
 
177 aa  189  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.144161  normal  0.0314277 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0642  NUDIX hydrolase  55.03 
 
 
179 aa  186  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0138031 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3449  dinucleoside polyphosphate hydrolase  55.69 
 
 
171 aa  184  4e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.96666  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3018  dinucleoside polyphosphate hydrolase  52.69 
 
 
175 aa  184  6e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1836  dinucleoside polyphosphate hydrolase  55.36 
 
 
182 aa  182  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.466201  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4211  dinucleoside polyphosphate hydrolase  52.69 
 
 
177 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.165705 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1769  dinucleoside polyphosphate hydrolase  55.36 
 
 
178 aa  181  3e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.492248  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4302  dinucleoside polyphosphate hydrolase  52.1 
 
 
175 aa  178  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1064  dinucleoside polyphosphate hydrolase  55.15 
 
 
174 aa  178  4e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.772748  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1470  NUDIX hydrolase  53.66 
 
 
175 aa  161  4.0000000000000004e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0325  dinucleoside polyphosphate hydrolase  46.95 
 
 
170 aa  159  2e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1230  NUDIX hydrolase  51.25 
 
 
165 aa  156  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0411  dinucleoside polyphosphate hydrolase  51.83 
 
 
173 aa  154  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.229765 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0931  dinucleoside polyphosphate hydrolase  52.53 
 
 
162 aa  153  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.906348  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2590  dinucleoside polyphosphate hydrolase  52.53 
 
 
162 aa  153  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2984  dinucleoside polyphosphate hydrolase  51.25 
 
 
162 aa  151  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.848091  normal  0.14985 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1755  NUDIX hydrolase  50 
 
 
161 aa  147  6e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0638574  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2457  NUDIX hydrolase  49.38 
 
 
168 aa  144  4.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.815124  normal  0.223342 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0901  dinucleoside polyphosphate hydrolase  47.59 
 
 
164 aa  142  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2509  dinucleoside polyphosphate hydrolase  48.73 
 
 
163 aa  141  4e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.815631  normal  0.83484 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1550  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
158 aa  140  7e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.979768  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0092  NUDIX hydrolase  46.54 
 
 
160 aa  137  4.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0201302  normal  0.41925 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4727  dinucleoside polyphosphate hydrolase  45.57 
 
 
170 aa  137  7.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.78787  normal  0.0128864 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0382  NUDIX hydrolase  46.58 
 
 
153 aa  136  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3020  dinucleoside polyphosphate hydrolase  45.24 
 
 
167 aa  135  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.614658  normal  0.0272519 
 
 
-
 
NC_002978  WD1119  dinucleoside polyphosphate hydrolase  40.76 
 
 
162 aa  134  5e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0263  dinucleoside polyphosphate hydrolase  49.06 
 
 
164 aa  134  5e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0510399  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0561  dinucleoside polyphosphate hydrolase  49.69 
 
 
169 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.655956 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0169  dinucleoside polyphosphate hydrolase  48.45 
 
 
173 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.459872  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0170  dinucleoside polyphosphate hydrolase  47.53 
 
 
178 aa  131  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3917  NUDIX hydrolase  45.91 
 
 
158 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2798  dinucleoside polyphosphate hydrolase  43.21 
 
 
167 aa  124  4.0000000000000003e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.779042  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0449  dinucleoside polyphosphate hydrolase  39.51 
 
 
187 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0852291  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3824  dinucleoside polyphosphate hydrolase  40.12 
 
 
175 aa  107  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000167151  normal  0.427646 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0199  dinucleoside polyphosphate hydrolase  39.51 
 
 
199 aa  107  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02678  dinucleoside polyphosphate hydrolase  39.63 
 
 
176 aa  105  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000336855  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0861  NUDIX hydrolase  39.63 
 
 
176 aa  105  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117938  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3168  dinucleoside polyphosphate hydrolase  39.63 
 
 
176 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000367916  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4096  dinucleoside polyphosphate hydrolase  39.63 
 
 
176 aa  105  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000580084  hitchhiker  0.00923204 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3331  dinucleoside polyphosphate hydrolase  39.63 
 
 
176 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000146788  hitchhiker  0.005493 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2976  dinucleoside polyphosphate hydrolase  39.63 
 
 
176 aa  105  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.85852e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2123  dinucleoside polyphosphate hydrolase  39.49 
 
 
172 aa  105  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0183314  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02639  hypothetical protein  39.63 
 
 
176 aa  105  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000320087  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2977  dinucleoside polyphosphate hydrolase  39.63 
 
 
176 aa  105  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000801466  hitchhiker  0.0062852 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3217  dinucleoside polyphosphate hydrolase  39.63 
 
 
176 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000360016  hitchhiker  0.00252549 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3150  dinucleoside polyphosphate hydrolase  39.63 
 
 
176 aa  105  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000288941  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3151  dinucleoside polyphosphate hydrolase  39.63 
 
 
176 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000021359  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3232  dinucleoside polyphosphate hydrolase  39.63 
 
 
176 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000155637  hitchhiker  0.0000853193 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3032  dinucleoside polyphosphate hydrolase  39.63 
 
 
176 aa  105  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  9.33004e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0885  dinucleoside polyphosphate hydrolase  39.63 
 
 
176 aa  105  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000193658  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1142  dinucleoside polyphosphate hydrolase  41.25 
 
 
174 aa  105  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000333704  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0217  dinucleoside polyphosphate hydrolase  38.27 
 
 
197 aa  105  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.269428 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3272  dinucleoside polyphosphate hydrolase  39.02 
 
 
176 aa  105  4e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000105899  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0904  dinucleoside polyphosphate hydrolase  39.38 
 
 
177 aa  104  7e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000367518  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3846  dinucleoside polyphosphate hydrolase  39.38 
 
 
174 aa  103  8e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3625  dinucleoside polyphosphate hydrolase  39.38 
 
 
171 aa  103  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.635767  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1331  dinucleoside polyphosphate hydrolase  40.62 
 
 
174 aa  103  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0645  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.74 
 
 
182 aa  103  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000308205  normal  0.147139 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3129  dinucleoside polyphosphate hydrolase  40.62 
 
 
174 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000022986  normal  0.998128 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1261  dinucleoside polyphosphate hydrolase  40.62 
 
 
174 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000399476  normal  0.124645 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2945  dinucleoside polyphosphate hydrolase  39.87 
 
 
172 aa  103  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.019417  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1184  dinucleoside polyphosphate hydrolase  40.62 
 
 
174 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000515571  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1228  dinucleoside polyphosphate hydrolase  40.62 
 
 
174 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000133704  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3017  dinucleoside polyphosphate hydrolase  38.27 
 
 
175 aa  103  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000442704  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3198  dinucleoside polyphosphate hydrolase  38.27 
 
 
175 aa  102  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00084868  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2865  dinucleoside polyphosphate hydrolase  40.62 
 
 
174 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000404837  normal  0.876176 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2947  dinucleoside polyphosphate hydrolase  40.62 
 
 
174 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000622219  normal  0.254979 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0981  dinucleoside polyphosphate hydrolase  38.89 
 
 
175 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.12815e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0203  dinucleoside polyphosphate hydrolase  38.75 
 
 
193 aa  102  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3043  dinucleoside polyphosphate hydrolase  40.62 
 
 
174 aa  103  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000556575  normal  0.544281 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3241  dinucleoside polyphosphate hydrolase  38.89 
 
 
175 aa  102  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000341046  normal  0.0858473 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1033  dinucleoside polyphosphate hydrolase  38.89 
 
 
175 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000236129  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3399  dinucleoside polyphosphate hydrolase  38.75 
 
 
178 aa  102  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000267349  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1021  dinucleoside polyphosphate hydrolase  40.51 
 
 
173 aa  102  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000480643  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004431  adenosine (5')-pentaphospho-(5'')-adenosine pyrophosphohydrolase  39.38 
 
 
173 aa  102  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000169211  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00967  dinucleoside polyphosphate hydrolase  39.38 
 
 
172 aa  102  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0569  dinucleoside polyphosphate hydrolase  39.38 
 
 
170 aa  102  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0412118  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1038  dinucleoside polyphosphate hydrolase  40 
 
 
174 aa  101  6e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000156815  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0516  dinucleoside polyphosphate hydrolase  36.94 
 
 
199 aa  100  7e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.108203 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0746  dinucleoside polyphosphate hydrolase  36.94 
 
 
235 aa  100  8e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00235884 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0834  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.58 
 
 
239 aa  100  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.496439  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1132  dinucleoside polyphosphate hydrolase  40 
 
 
172 aa  99.8  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000912913  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0863  dinucleoside polyphosphate hydrolase  38.12 
 
 
178 aa  99.4  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.0591325 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2817  dinucleoside polyphosphate hydrolase  35.8 
 
 
238 aa  98.6  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0131722  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1227  dinucleoside polyphosphate hydrolase  39.38 
 
 
173 aa  98.6  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000249848  hitchhiker  0.00278569 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>