80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2570 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2570  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  352  2e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00072063  normal  0.0208228 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5859  NUDIX hydrolase  53.29 
 
 		 153 aa  170  7.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315919  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2817  NUDIX hydrolase  52.03 
 
 		 152 aa  161  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13765  hypothetical protein  48.8 
 
 		 166 aa  157  9e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.983203 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2646  NUDIX hydrolase  52.38 
 
 		 155 aa  156  1e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1098  NUDIX hydrolase  49.02 
 
 		 155 aa  153  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.448476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2044  NUDIX hydrolase  49.67 
 
 		 160 aa  149  3e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3585  NUDIX hydrolase  48 
 
 		 162 aa  147  9e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00428581  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4185  NUDIX hydrolase  48.34 
 
 		 154 aa  144  8.000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7253  NUDIX hydrolase  44.59 
 
 		 160 aa  143  9e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5357  NUDIX hydrolase  48.67 
 
 		 154 aa  143  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.737057 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5719  NUDIX hydrolase  47.33 
 
 		 154 aa  141  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.943651 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1987  NUDIX hydrolase  47.59 
 
 		 155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4431  NUDIX hydrolase  44.9 
 
 		 164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3182  NUDIX hydrolase  48.65 
 
 		 163 aa  139  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.565463  normal  0.196576 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0649  NUDIX hydrolase  48.63 
 
 		 154 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0645  hypothetical protein  48.03 
 
 		 154 aa  135  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3404  NUDIX hydrolase  49.66 
 
 		 174 aa  135  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321528  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2879  NUDIX hydrolase  44.23 
 
 		 157 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2923  NUDIX hydrolase  44.23 
 
 		 157 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.928534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2909  NUDIX hydrolase  44.23 
 
 		 157 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188033  normal  0.899663 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2262  NUDIX hydrolase  47.62 
 
 		 155 aa  135  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.997578  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3428  NUDIX hydrolase  46.1 
 
 		 163 aa  134  5e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0645  NUDIX hydrolase  47.22 
 
 		 155 aa  134  6.0000000000000005e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3663  NUDIX hydrolase  47.55 
 
 		 154 aa  134  7.000000000000001e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0671  NUDIX hydrolase  43.24 
 
 		 153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.616571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16970  predicted NTP pyrophosphohydrolase  43.33 
 
 		 154 aa  132  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.542075  normal  0.366756 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0358  NUDIX hydrolase  42.58 
 
 		 162 aa  130  6e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4521  NUDIX hydrolase  46 
 
 		 156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.506364 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2455  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.490004  normal  0.610267 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3569  NUDIX hydrolase  44 
 
 		 163 aa  124  8.000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0113  NUDIX hydrolase  44.37 
 
 		 165 aa  122  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0064  NUDIX hydrolase  44.38 
 
 		 168 aa  120  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2993  NUDIX hydrolase  44.97 
 
 		 154 aa  114  7.999999999999999e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1389  NUDIX hydrolase  39.18 
 
 		 324 aa  106  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.524565  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0230  NUDIX hydrolase  39.75 
 
 		 166 aa  106  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 341 aa  49.7  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0697  NUDIX hydrolase  32.33 
 
 		 153 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.405136  normal  0.276525 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5641  NUDIX hydrolase  30.3 
 
 		 146 aa  49.3  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25640  ADP-ribose pyrophosphatase  31.91 
 
 		 314 aa  47.8  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194053  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  33.7 
 
 		 289 aa  47  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1911  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 167 aa  47.4  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.389177 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33510  NTP pyrophosphohydrolase  42.42 
 
 		 343 aa  46.6  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0185046  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2816  NUDIX hydrolase  28.78 
 
 		 326 aa  46.6  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0490383 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0747  hypothetical protein  30.16 
 
 		 153 aa  46.6  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1315  NUDIX hydrolase  33.64 
 
 		 156 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.511776  normal  0.0806389 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0905  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 		 152 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.900036  normal  0.116186 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1281  NUDIX hydrolase  33.64 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0763  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 		 153 aa  45.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0534462 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2275  NUDIX hydrolase  28.67 
 
 		 149 aa  44.7  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.961182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1152  NUDIX hydrolase  31.18 
 
 		 296 aa  44.7  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000396101 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6207  putative NUDIX hydrolase  36 
 
 		 322 aa  44.7  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109267  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0891  NUDIX domain-containing protein  31.09 
 
 		 157 aa  44.7  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0700  NUDIX domain-containing protein  31.09 
 
 		 160 aa  44.7  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0460  NUDIX domain-containing protein  31.09 
 
 		 160 aa  44.7  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.080692  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1418  NUDIX domain-containing protein  31.09 
 
 		 160 aa  44.7  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0301  NUDIX hydrolase  29.29 
 
 		 324 aa  43.9  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.917756  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1404  NUDIX hydrolase  33.63 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567181  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1481  NUDIX hydrolase  37.88 
 
 		 301 aa  43.9  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0468902  normal  0.959554 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0922  NUDIX hydrolase  33.63 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1810  NUDIX family hydrolase  31.09 
 
 		 160 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1382  NUDIX hydrolase  33.63 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.162154 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3015  NUDIX hydrolase  34.02 
 
 		 351 aa  43.5  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2236  NUDIX hydrolase  27.22 
 
 		 356 aa  43.1  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.592107  normal  0.569129 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3212  NUDIX hydrolase  37.88 
 
 		 302 aa  42.7  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2830  NUDIX hydrolase  34.44 
 
 		 149 aa  42.4  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282197  normal  0.0206964 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1632  NUDIX family hydrolase  29.84 
 
 		 160 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081171  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  29.84 
 
 		 160 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2845  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  41.54 
 
 		 315 aa  42.4  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4360  NUDIX hydrolase  36.62 
 
 		 153 aa  42  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.11563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4548  NUDIX hydrolase  32.73 
 
 		 156 aa  42  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  41.54 
 
 		 140 aa  42  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1305  NUDIX family hydrolase  33.33 
 
 		 149 aa  42  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000047  ADP-ribose pyrophosphatase  33.77 
 
 		 214 aa  41.6  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.911513  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1026  NUDIX hydrolase  33.82 
 
 		 183 aa  41.2  0.007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1828  NUDIX hydrolase  36.92 
 
 		 138 aa  41.2  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.714922 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0812  NUDIX hydrolase  25.17 
 
 		 140 aa  40.8  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00112519  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0392  NUDIX family hydrolase  24.26 
 
 		 149 aa  40.8  0.01  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000292752 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1033  NUDIX hydrolase  37.68 
 
 		 542 aa  40.8  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0906744 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3967  MutT/nudix family protein  29.17 
 
 		 146 aa  40.8  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  0.0696331 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>