46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47297 on replicon NC_011681
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011681  PHATRDRAFT_47297  predicted protein  100 
 
 
416 aa  850    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06251  Nudix/MutT family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G13080)  41.38 
 
 
159 aa  60.8  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.987748  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60333  Diadenosine and Diphosphoinositol Polyphosphate Phosphohydrolase  43.02 
 
 
179 aa  57.8  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.333376  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40358  predicted protein  38.61 
 
 
170 aa  58.2  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6003  NUDIX hydrolase  42.37 
 
 
314 aa  52.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.45495  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0810  NUDIX hydrolase  42.31 
 
 
136 aa  50.4  0.00006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0707  NUDIX/MutT family protein  40 
 
 
134 aa  49.7  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1639  NUDIX hydrolase  36.62 
 
 
127 aa  49.3  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000139733  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1638  NUDIX hydrolase  40.38 
 
 
138 aa  48.5  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.611256 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3823  NUDIX hydrolase  45 
 
 
198 aa  48.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.721473  normal  0.0483324 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2092  NUDIX hydrolase  47.27 
 
 
156 aa  47.8  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000618105  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  35.53 
 
 
155 aa  47.8  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2100  NUDIX hydrolase  41.82 
 
 
139 aa  47  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2543  NUDIX hydrolase  37.33 
 
 
206 aa  46.2  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2971  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 
153 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000073091  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  40 
 
 
341 aa  46.2  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2727  NUDIX hydrolase  41.82 
 
 
322 aa  45.8  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00813927 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  36.49 
 
 
258 aa  45.8  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1545  NUDIX/MutT family protein  34.38 
 
 
151 aa  45.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000014066  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0901  NUDIX hydrolase  43.33 
 
 
153 aa  44.7  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0950786 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1148  NUDIX hydrolase  41.51 
 
 
109 aa  44.7  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.180064  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4650  NUDIX hydrolase  36.07 
 
 
163 aa  44.7  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3212  NUDIX hydrolase  44.23 
 
 
302 aa  45.1  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0983  NUDIX hydrolase  44.23 
 
 
138 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.246298 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2036  NUDIX hydrolase  42.59 
 
 
228 aa  44.7  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3942  putative NUDIX-like hydrolase  37.7 
 
 
167 aa  45.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180458  normal  0.438057 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1448  ADP-ribose pyrophosphatase  37.04 
 
 
430 aa  44.7  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3015  NUDIX hydrolase  40 
 
 
351 aa  44.3  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2275  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 
149 aa  44.3  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.961182  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3713  NUDIX hydrolase  41.79 
 
 
182 aa  44.3  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.639484  normal  0.0437167 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  41.82 
 
 
160 aa  44.3  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2236  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 
356 aa  44.3  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.592107  normal  0.569129 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1632  NUDIX family hydrolase  41.82 
 
 
160 aa  44.3  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081171  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0301  NUDIX hydrolase  36.62 
 
 
324 aa  43.9  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.917756  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1770  dinucleoside polyphosphate hydrolase  39.22 
 
 
190 aa  43.9  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33510  NTP pyrophosphohydrolase  35.94 
 
 
343 aa  43.5  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0185046  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37900  ADP-ribose pyrophosphatase  36.71 
 
 
205 aa  43.5  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.525356  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3363  NUDIX hydrolase  39.68 
 
 
219 aa  43.9  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1676  NUDIX hydrolase  43.33 
 
 
182 aa  43.5  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.564236  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2079  NUDIX hydrolase  43.33 
 
 
182 aa  43.5  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.912784 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  44 
 
 
305 aa  43.5  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3148  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
155 aa  43.1  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23350  ADP-ribose pyrophosphatase  33.68 
 
 
203 aa  43.1  0.009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7322  NUDIX hydrolase  56.1 
 
 
141 aa  43.1  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
140 aa  43.1  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4495  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
158 aa  43.1  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.031023  normal  0.122165 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>