72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0358 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0358  NUDIX hydrolase  100 
 
 
162 aa  328  3e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3569  NUDIX hydrolase  69.38 
 
 
163 aa  221  3e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3663  NUDIX hydrolase  60.4 
 
 
154 aa  177  5.999999999999999e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2923  NUDIX hydrolase  55 
 
 
157 aa  166  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.928534  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2909  NUDIX hydrolase  55 
 
 
157 aa  166  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188033  normal  0.899663 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2879  NUDIX hydrolase  55 
 
 
157 aa  166  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3182  NUDIX hydrolase  55.35 
 
 
163 aa  159  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.565463  normal  0.196576 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3428  NUDIX hydrolase  55.19 
 
 
163 aa  157  5e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2993  NUDIX hydrolase  57.5 
 
 
154 aa  155  3e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1098  NUDIX hydrolase  51.88 
 
 
155 aa  155  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.448476  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16970  predicted NTP pyrophosphohydrolase  50.96 
 
 
154 aa  153  9e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.542075  normal  0.366756 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0671  NUDIX hydrolase  51.27 
 
 
153 aa  153  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.616571  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2044  NUDIX hydrolase  50.97 
 
 
160 aa  150  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13765  hypothetical protein  50.32 
 
 
166 aa  148  3e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.983203 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0113  NUDIX hydrolase  50.31 
 
 
165 aa  147  7e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3404  NUDIX hydrolase  51.33 
 
 
174 aa  145  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321528  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0645  NUDIX hydrolase  51.66 
 
 
155 aa  144  7.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2262  NUDIX hydrolase  49.36 
 
 
155 aa  142  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.997578  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3585  NUDIX hydrolase  50.63 
 
 
162 aa  141  4e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00428581  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0064  NUDIX hydrolase  51.25 
 
 
168 aa  141  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5357  NUDIX hydrolase  49.38 
 
 
154 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.737057 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2817  NUDIX hydrolase  49.34 
 
 
152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5859  NUDIX hydrolase  44.72 
 
 
153 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315919  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5719  NUDIX hydrolase  48.41 
 
 
154 aa  134  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.943651 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2646  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 
155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0230  NUDIX hydrolase  50.3 
 
 
166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2570  hypothetical protein  42.58 
 
 
172 aa  130  5e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00072063  normal  0.0208228 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1987  NUDIX hydrolase  46.36 
 
 
155 aa  130  7.999999999999999e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4431  NUDIX hydrolase  43.51 
 
 
164 aa  127  6e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7253  NUDIX hydrolase  42.77 
 
 
160 aa  127  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0645  hypothetical protein  49.06 
 
 
154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1389  NUDIX hydrolase  42.26 
 
 
324 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.524565  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4521  NUDIX hydrolase  47.4 
 
 
156 aa  115  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.506364 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4185  NUDIX hydrolase  35.44 
 
 
154 aa  105  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0649  NUDIX hydrolase  39.74 
 
 
154 aa  102  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2455  NUDIX hydrolase  40.52 
 
 
162 aa  98.6  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.490004  normal  0.610267 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  28.67 
 
 
305 aa  45.8  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0487  MutT/nudix family protein  28.57 
 
 
151 aa  44.7  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.450276  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1281  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 
156 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0905  NUDIX hydrolase  32.2 
 
 
152 aa  44.7  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.900036  normal  0.116186 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1305  NUDIX family hydrolase  32.74 
 
 
149 aa  44.3  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1382  NUDIX hydrolase  32.74 
 
 
156 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.162154 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2830  NUDIX hydrolase  31.86 
 
 
149 aa  43.9  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282197  normal  0.0206964 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1404  NUDIX hydrolase  32.74 
 
 
157 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567181  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1810  NUDIX family hydrolase  32.73 
 
 
160 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4548  NUDIX hydrolase  32.77 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0922  NUDIX hydrolase  32.74 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  30.07 
 
 
164 aa  43.5  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25640  ADP-ribose pyrophosphatase  32.89 
 
 
314 aa  43.1  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194053  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4995  putative phosphohistidine phosphatase SixA  55 
 
 
301 aa  43.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5298  NUDIX hydrolase  44.62 
 
 
170 aa  43.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1315  NUDIX hydrolase  31.86 
 
 
156 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.511776  normal  0.0806389 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1152  NUDIX hydrolase  27.74 
 
 
296 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000396101 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4436  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 
180 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  31.54 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1632  NUDIX family hydrolase  31.54 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081171  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  31.68 
 
 
341 aa  41.6  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0569  dinucleoside polyphosphate hydrolase  26.62 
 
 
170 aa  42  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0412118  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1227  dinucleoside polyphosphate hydrolase  26.14 
 
 
173 aa  42  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000249848  hitchhiker  0.00278569 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5641  NUDIX hydrolase  27.59 
 
 
146 aa  41.6  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13740  NTP pyrophosphohydrolase  35.78 
 
 
215 aa  41.6  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1059  NUDIX hydrolase  28.81 
 
 
195 aa  41.2  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1418  NUDIX domain-containing protein  33.68 
 
 
160 aa  41.2  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0700  NUDIX domain-containing protein  33.68 
 
 
160 aa  41.2  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0460  NUDIX domain-containing protein  33.68 
 
 
160 aa  41.2  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.080692  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0891  NUDIX domain-containing protein  33.68 
 
 
157 aa  41.2  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04390  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.7 
 
 
159 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.164877  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0429  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.7 
 
 
159 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.741123  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  27.74 
 
 
289 aa  40.8  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0992  NUDIX hydrolase  39.66 
 
 
180 aa  40.8  0.009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0203  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.93 
 
 
193 aa  40.4  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1132  dinucleoside polyphosphate hydrolase  25.49 
 
 
172 aa  40.4  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000912913  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>