103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4521 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4521  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 156 aa  315  2e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.506364 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0645  NUDIX hydrolase  64.67 
 
 		 155 aa  188  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1987  NUDIX hydrolase  59.21 
 
 		 155 aa  183  7e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2262  NUDIX hydrolase  60.67 
 
 		 155 aa  176  9e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.997578  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7253  NUDIX hydrolase  59.21 
 
 		 160 aa  174  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1098  NUDIX hydrolase  58.06 
 
 		 155 aa  174  6e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.448476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0645  hypothetical protein  60.54 
 
 		 154 aa  164  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3585  NUDIX hydrolase  57.14 
 
 		 162 aa  164  2.9999999999999998e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00428581  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13765  hypothetical protein  53.33 
 
 		 166 aa  164  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.983203 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2044  NUDIX hydrolase  55.13 
 
 		 160 aa  163  9e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4185  NUDIX hydrolase  51.72 
 
 		 154 aa  160  5.0000000000000005e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5859  NUDIX hydrolase  56 
 
 		 153 aa  160  8.000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315919  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4431  NUDIX hydrolase  54.42 
 
 		 164 aa  159  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5719  NUDIX hydrolase  54.36 
 
 		 154 aa  158  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.943651 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2646  NUDIX hydrolase  54.55 
 
 		 155 aa  155  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16970  predicted NTP pyrophosphohydrolase  55.7 
 
 		 154 aa  155  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.542075  normal  0.366756 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2817  NUDIX hydrolase  52.03 
 
 		 152 aa  154  6e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5357  NUDIX hydrolase  51.68 
 
 		 154 aa  151  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.737057 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3428  NUDIX hydrolase  49.68 
 
 		 163 aa  150  5e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2879  NUDIX hydrolase  52.98 
 
 		 157 aa  149  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2923  NUDIX hydrolase  52.98 
 
 		 157 aa  149  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.928534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2909  NUDIX hydrolase  52.98 
 
 		 157 aa  149  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188033  normal  0.899663 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3182  NUDIX hydrolase  51.59 
 
 		 163 aa  149  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.565463  normal  0.196576 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3404  NUDIX hydrolase  54.48 
 
 		 174 aa  147  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321528  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2570  hypothetical protein  46 
 
 		 172 aa  143  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00072063  normal  0.0208228 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2455  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 162 aa  139  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.490004  normal  0.610267 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0671  NUDIX hydrolase  52.35 
 
 		 153 aa  140  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.616571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3663  NUDIX hydrolase  52.78 
 
 		 154 aa  138  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0113  NUDIX hydrolase  51.32 
 
 		 165 aa  137  6e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1389  NUDIX hydrolase  48.1 
 
 		 324 aa  135  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.524565  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0649  NUDIX hydrolase  46.62 
 
 		 154 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3569  NUDIX hydrolase  47.33 
 
 		 163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0358  NUDIX hydrolase  47.4 
 
 		 162 aa  128  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0064  NUDIX hydrolase  47.53 
 
 		 168 aa  124  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2993  NUDIX hydrolase  52.98 
 
 		 154 aa  124  5e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0230  NUDIX hydrolase  44.58 
 
 		 166 aa  115  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0301  NUDIX hydrolase  32.08 
 
 		 324 aa  55.1  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.917756  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5641  NUDIX hydrolase  32.59 
 
 		 146 aa  51.6  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1305  NUDIX family hydrolase  34.71 
 
 		 149 aa  50.4  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0905  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 		 152 aa  48.5  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.900036  normal  0.116186 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2816  NUDIX hydrolase  34.72 
 
 		 326 aa  48.5  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0490383 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  27.46 
 
 		 140 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2830  NUDIX hydrolase  31.4 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282197  normal  0.0206964 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4548  NUDIX hydrolase  32.76 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  31.06 
 
 		 229 aa  46.2  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0922  NUDIX hydrolase  32.48 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1404  NUDIX hydrolase  32.48 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567181  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4202  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204262 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  33.07 
 
 		 143 aa  45.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0891  NUDIX domain-containing protein  32.58 
 
 		 157 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1418  NUDIX domain-containing protein  32.58 
 
 		 160 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0460  NUDIX domain-containing protein  32.58 
 
 		 160 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.080692  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0700  NUDIX domain-containing protein  32.58 
 
 		 160 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1103  nudix hydrolase  41.27 
 
 		 524 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.426954 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5221  NUDIX hydrolase  28.68 
 
 		 333 aa  45.1  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.239365  normal  0.144046 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4127  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 		 167 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0317777  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  33.55 
 
 		 341 aa  44.3  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1632  NUDIX family hydrolase  32.33 
 
 		 160 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081171  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  32.33 
 
 		 160 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1382  NUDIX hydrolase  32.48 
 
 		 156 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.162154 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1810  NUDIX family hydrolase  33.33 
 
 		 160 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1592  NTP pyrophosphohydrolase for oxidative damage repair  30.3 
 
 		 395 aa  43.5  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.985327  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  34.07 
 
 		 231 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0324  putative MutT family protein  30.43 
 
 		 325 aa  43.1  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2360  putative mutator MutT protein  29.17 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1059  NUDIX hydrolase  31.37 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.891979  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2125  NUDIX hydrolase  41.54 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3773  NUDIX hydrolase  26.76 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000523575 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17440  ADP-ribose pyrophosphatase  29.25 
 
 		 336 aa  42.7  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303863  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0260  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 		 303 aa  43.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2666  NUDIX domain-containing protein  33.08 
 
 		 158 aa  42.4  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.661502  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  28.03 
 
 		 144 aa  42  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03520  ADP-ribose pyrophosphatase  31.54 
 
 		 308 aa  42.4  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.630054 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2189  NUDIX hydrolase  39.68 
 
 		 201 aa  42.4  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33510  NTP pyrophosphohydrolase  41.67 
 
 		 343 aa  42.4  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0185046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0673  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 141 aa  42  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.51908 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3830  NUDIX hydrolase  30.4 
 
 		 301 aa  41.6  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  36.92 
 
 		 229 aa  41.6  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  31.93 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0799  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.544133  normal  0.428384 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6207  putative NUDIX hydrolase  32.73 
 
 		 322 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1911  NUDIX hydrolase  32.17 
 
 		 167 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.389177 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25540  ADP-ribose pyrophosphatase  37.33 
 
 		 224 aa  41.2  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.237744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0861  NUDIX hydrolase  34.29 
 
 		 231 aa  41.2  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.314952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1009  MutT/nudix family protein  27.34 
 
 		 162 aa  41.2  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2466  hypothetical protein  37.88 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1197  NUDIX hydrolase  32.63 
 
 		 216 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2371  mutT/nudix family protein  40.74 
 
 		 149 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0511564  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25640  ADP-ribose pyrophosphatase  44.44 
 
 		 314 aa  41.2  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194053  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4501  NUDIX hydrolase  34.31 
 
 		 322 aa  40.8  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  39.68 
 
 		 146 aa  40.8  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4360  NUDIX hydrolase  38.03 
 
 		 153 aa  40.8  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.11563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2939  NUDIX hydrolase  29.35 
 
 		 130 aa  40.8  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3377  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.21 
 
 		 128 aa  40.8  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0382964  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1417  NUDIX hydrolase  37.31 
 
 		 139 aa  40.8  0.008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2908  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.21 
 
 		 128 aa  40.8  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0055236  normal  0.908985 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3508  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.21 
 
 		 128 aa  40.8  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116101  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1315  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 		 156 aa  40.8  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.511776  normal  0.0806389 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3081  mutT/nudix family protein  40.74 
 
 		 149 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000075135 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  40.32 
 
 		 289 aa  40.4  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>