76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2817 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2817  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 152 aa  305  2.0000000000000002e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5859  NUDIX hydrolase  55.33 
 
 		 153 aa  180  5.0000000000000004e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315919  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1098  NUDIX hydrolase  56.58 
 
 		 155 aa  174  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.448476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1987  NUDIX hydrolase  56.46 
 
 		 155 aa  167  3e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2923  NUDIX hydrolase  55.26 
 
 		 157 aa  166  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.928534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2909  NUDIX hydrolase  55.26 
 
 		 157 aa  166  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188033  normal  0.899663 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2879  NUDIX hydrolase  55.26 
 
 		 157 aa  166  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3182  NUDIX hydrolase  59.59 
 
 		 163 aa  165  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.565463  normal  0.196576 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5357  NUDIX hydrolase  55.78 
 
 		 154 aa  164  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.737057 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0645  NUDIX hydrolase  53.69 
 
 		 155 aa  164  5e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3428  NUDIX hydrolase  58.9 
 
 		 163 aa  164  5e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2570  hypothetical protein  52.03 
 
 		 172 aa  161  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00072063  normal  0.0208228 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5719  NUDIX hydrolase  55.1 
 
 		 154 aa  160  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.943651 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4185  NUDIX hydrolase  48.68 
 
 		 154 aa  156  9e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2646  NUDIX hydrolase  52.32 
 
 		 155 aa  155  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2262  NUDIX hydrolase  53.69 
 
 		 155 aa  155  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.997578  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3663  NUDIX hydrolase  54.93 
 
 		 154 aa  154  6e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2044  NUDIX hydrolase  51.97 
 
 		 160 aa  150  5e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7253  NUDIX hydrolase  51.02 
 
 		 160 aa  150  7e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13765  hypothetical protein  50.68 
 
 		 166 aa  148  3e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.983203 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4431  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 164 aa  148  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3585  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 162 aa  146  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00428581  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0064  NUDIX hydrolase  51.53 
 
 		 168 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0671  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 153 aa  145  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.616571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16970  predicted NTP pyrophosphohydrolase  48.34 
 
 		 154 aa  144  5e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.542075  normal  0.366756 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0649  NUDIX hydrolase  49.01 
 
 		 154 aa  142  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0645  hypothetical protein  52.7 
 
 		 154 aa  139  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0358  NUDIX hydrolase  49.34 
 
 		 162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4521  NUDIX hydrolase  52.03 
 
 		 156 aa  138  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.506364 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3569  NUDIX hydrolase  47.33 
 
 		 163 aa  136  7.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3404  NUDIX hydrolase  50.34 
 
 		 174 aa  134  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321528  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2455  NUDIX hydrolase  46.31 
 
 		 162 aa  133  9e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.490004  normal  0.610267 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0113  NUDIX hydrolase  48.37 
 
 		 165 aa  127  5.0000000000000004e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1389  NUDIX hydrolase  45.81 
 
 		 324 aa  123  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.524565  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0230  NUDIX hydrolase  42.77 
 
 		 166 aa  114  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2993  NUDIX hydrolase  46.9 
 
 		 154 aa  104  4e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4548  NUDIX hydrolase  30.2 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0922  NUDIX hydrolase  31.54 
 
 		 156 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1404  NUDIX hydrolase  31.54 
 
 		 157 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567181  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1382  NUDIX hydrolase  31.54 
 
 		 156 aa  47.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.162154 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2492  NUDIX hydrolase  47.73 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5641  NUDIX hydrolase  29.2 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  44.44 
 
 		 473 aa  46.2  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3268  MutT/nudix family protein  47.73 
 
 		 132 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33510  NTP pyrophosphohydrolase  39.33 
 
 		 343 aa  45.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0185046  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0747  hypothetical protein  33.33 
 
 		 153 aa  44.7  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3967  MutT/nudix family protein  32.86 
 
 		 146 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  0.0696331 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1911  NUDIX hydrolase  28.86 
 
 		 167 aa  43.9  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.389177 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  33.71 
 
 		 229 aa  43.5  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03520  ADP-ribose pyrophosphatase  33.61 
 
 		 308 aa  43.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.630054 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0697  NUDIX hydrolase  32.54 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.405136  normal  0.276525 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1047  NUDIX hydrolase  30.39 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  36.47 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3935  NUDIX hydrolase  40.79 
 
 		 180 aa  43.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445815  hitchhiker  0.00928201 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2275  NUDIX hydrolase  23.08 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.961182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0480  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 184 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.227834  hitchhiker  0.00765199 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0575  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2666  NUDIX domain-containing protein  30.47 
 
 		 158 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.661502  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1152  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 		 296 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000396101 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  34.83 
 
 		 289 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25540  ADP-ribose pyrophosphatase  33.7 
 
 		 224 aa  41.6  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.237744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  34.12 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1315  NUDIX hydrolase  30.95 
 
 		 156 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.511776  normal  0.0806389 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1678  hypothetical protein  50 
 
 		 306 aa  41.2  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.552334  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  30 
 
 		 305 aa  40.8  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2834  NUDIX hydrolase  36.08 
 
 		 169 aa  40.8  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4727  dinucleoside polyphosphate hydrolase  43.14 
 
 		 170 aa  40.8  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.78787  normal  0.0128864 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1424  NUDIX hydrolase  32.53 
 
 		 188 aa  40.8  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.884669  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0754  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  38.18 
 
 		 203 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0370949  hitchhiker  0.0055541 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2031  NUDIX hydrolase  25.71 
 
 		 141 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.717245 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1281  NUDIX hydrolase  30.95 
 
 		 156 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3577  NUDIX hydrolase  38.18 
 
 		 200 aa  40.4  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00368158  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0782  NUDIX hydrolase  38.18 
 
 		 200 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000245239  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0814  NUDIX hydrolase  38.18 
 
 		 200 aa  40.4  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00725628  normal  0.399443 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2006  NUDIX hydrolase  25.71 
 
 		 141 aa  40.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0807  NUDIX hydrolase  38.18 
 
 		 200 aa  40.4  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000627891  hitchhiker  0.0000000000549987 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>