67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0645 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0645  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  300  6.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1987  NUDIX hydrolase  64.14 
 
 		 155 aa  189  2e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1098  NUDIX hydrolase  63.16 
 
 		 155 aa  182  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.448476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4431  NUDIX hydrolase  61.33 
 
 		 164 aa  180  7e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0645  NUDIX hydrolase  61.9 
 
 		 155 aa  179  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5859  NUDIX hydrolase  50.33 
 
 		 153 aa  167  4e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315919  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2044  NUDIX hydrolase  54.9 
 
 		 160 aa  167  4e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4521  NUDIX hydrolase  60.54 
 
 		 156 aa  164  5e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.506364 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2262  NUDIX hydrolase  54.25 
 
 		 155 aa  164  5e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.997578  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3182  NUDIX hydrolase  58.06 
 
 		 163 aa  164  5e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.565463  normal  0.196576 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7253  NUDIX hydrolase  56.58 
 
 		 160 aa  163  6.9999999999999995e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0671  NUDIX hydrolase  60.67 
 
 		 153 aa  160  6e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.616571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3585  NUDIX hydrolase  53.33 
 
 		 162 aa  160  8.000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00428581  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2646  NUDIX hydrolase  52.35 
 
 		 155 aa  156  7e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5719  NUDIX hydrolase  55.7 
 
 		 154 aa  156  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.943651 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13765  hypothetical protein  54.05 
 
 		 166 aa  154  4e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.983203 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3428  NUDIX hydrolase  53.29 
 
 		 163 aa  153  6e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2817  NUDIX hydrolase  52.7 
 
 		 152 aa  152  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3663  NUDIX hydrolase  59.15 
 
 		 154 aa  152  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4185  NUDIX hydrolase  48.32 
 
 		 154 aa  152  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5357  NUDIX hydrolase  55.7 
 
 		 154 aa  151  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.737057 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2570  hypothetical protein  48.03 
 
 		 172 aa  149  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00072063  normal  0.0208228 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16970  predicted NTP pyrophosphohydrolase  54.05 
 
 		 154 aa  147  6e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.542075  normal  0.366756 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2923  NUDIX hydrolase  51.92 
 
 		 157 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.928534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2879  NUDIX hydrolase  51.92 
 
 		 157 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2909  NUDIX hydrolase  51.92 
 
 		 157 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188033  normal  0.899663 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3569  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 163 aa  141  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3404  NUDIX hydrolase  55.56 
 
 		 174 aa  141  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321528  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0358  NUDIX hydrolase  49.06 
 
 		 162 aa  139  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1389  NUDIX hydrolase  50.94 
 
 		 324 aa  138  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.524565  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0649  NUDIX hydrolase  47.02 
 
 		 154 aa  136  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2455  NUDIX hydrolase  48.39 
 
 		 162 aa  134  6.0000000000000005e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.490004  normal  0.610267 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0113  NUDIX hydrolase  50.96 
 
 		 165 aa  133  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0064  NUDIX hydrolase  56.82 
 
 		 168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2993  NUDIX hydrolase  53.69 
 
 		 154 aa  130  5e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0230  NUDIX hydrolase  46.01 
 
 		 166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2816  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 		 326 aa  53.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0490383 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0301  NUDIX hydrolase  35.25 
 
 		 324 aa  52.8  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.917756  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  33.56 
 
 		 229 aa  48.1  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  31.45 
 
 		 341 aa  47  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33510  NTP pyrophosphohydrolase  41.77 
 
 		 343 aa  46.6  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0185046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3015  NUDIX hydrolase  34.74 
 
 		 351 aa  47  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5221  NUDIX hydrolase  29.5 
 
 		 333 aa  47  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.239365  normal  0.144046 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  31.34 
 
 		 305 aa  45.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0260  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 		 303 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0324  putative MutT family protein  33.1 
 
 		 325 aa  43.9  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25640  ADP-ribose pyrophosphatase  46.03 
 
 		 314 aa  43.5  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194053  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0392  NUDIX family hydrolase  26.57 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000292752 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0901  NUDIX hydrolase  30.6 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0950786 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1810  NUDIX family hydrolase  34.88 
 
 		 160 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 139 aa  42  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5641  NUDIX hydrolase  31.85 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4563  NUDIX hydrolase  55.56 
 
 		 166 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4127  NUDIX hydrolase  39.06 
 
 		 167 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0317777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0460  NUDIX domain-containing protein  35.04 
 
 		 160 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.080692  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2275  NUDIX hydrolase  26.72 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.961182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1418  NUDIX domain-containing protein  35.04 
 
 		 160 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1632  NUDIX family hydrolase  33.33 
 
 		 160 aa  41.6  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081171  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  33.33 
 
 		 160 aa  41.6  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0700  NUDIX domain-containing protein  35.04 
 
 		 160 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0891  NUDIX domain-containing protein  33.62 
 
 		 157 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8612  hypothetical protein  30.94 
 
 		 292 aa  41.2  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1103  nudix hydrolase  36.62 
 
 		 524 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.426954 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1167  NUDIX hydrolase  31.07 
 
 		 164 aa  40.8  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2457  NUDIX hydrolase  34.21 
 
 		 168 aa  40.4  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.815124  normal  0.223342 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  32 
 
 		 303 aa  40.4  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2666  NUDIX domain-containing protein  37.08 
 
 		 158 aa  40  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.661502  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>