65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_16970 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_16970  predicted NTP pyrophosphohydrolase  100 
 
 
154 aa  305  2.0000000000000002e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.542075  normal  0.366756 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2923  NUDIX hydrolase  63.09 
 
 
157 aa  192  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.928534  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2909  NUDIX hydrolase  63.09 
 
 
157 aa  192  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188033  normal  0.899663 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2879  NUDIX hydrolase  63.09 
 
 
157 aa  192  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3182  NUDIX hydrolase  60.26 
 
 
163 aa  180  7e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.565463  normal  0.196576 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3404  NUDIX hydrolase  65.31 
 
 
174 aa  180  7e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321528  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3428  NUDIX hydrolase  59.6 
 
 
163 aa  175  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13765  hypothetical protein  56 
 
 
166 aa  169  1e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.983203 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1098  NUDIX hydrolase  58.94 
 
 
155 aa  169  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.448476  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3663  NUDIX hydrolase  60.99 
 
 
154 aa  165  2.9999999999999998e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0645  NUDIX hydrolase  56.46 
 
 
155 aa  158  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2993  NUDIX hydrolase  59.06 
 
 
154 aa  156  8e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0358  NUDIX hydrolase  50.96 
 
 
162 aa  153  7e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0671  NUDIX hydrolase  54.36 
 
 
153 aa  153  7e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.616571  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2262  NUDIX hydrolase  54.11 
 
 
155 aa  153  7e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.997578  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2044  NUDIX hydrolase  51.59 
 
 
160 aa  149  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3569  NUDIX hydrolase  52.74 
 
 
163 aa  149  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0113  NUDIX hydrolase  55.62 
 
 
165 aa  148  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5859  NUDIX hydrolase  48 
 
 
153 aa  148  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315919  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7253  NUDIX hydrolase  52 
 
 
160 aa  145  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3585  NUDIX hydrolase  51.02 
 
 
162 aa  144  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00428581  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0064  NUDIX hydrolase  52.17 
 
 
168 aa  144  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2817  NUDIX hydrolase  48.34 
 
 
152 aa  144  5e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1987  NUDIX hydrolase  51.02 
 
 
155 aa  142  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4521  NUDIX hydrolase  55.7 
 
 
156 aa  135  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.506364 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2570  hypothetical protein  43.33 
 
 
172 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00072063  normal  0.0208228 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4431  NUDIX hydrolase  46.26 
 
 
164 aa  131  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0645  hypothetical protein  54.05 
 
 
154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5719  NUDIX hydrolase  48 
 
 
154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.943651 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2646  NUDIX hydrolase  45.33 
 
 
155 aa  128  3e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5357  NUDIX hydrolase  48.68 
 
 
154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.737057 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0230  NUDIX hydrolase  48.15 
 
 
166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1389  NUDIX hydrolase  49.07 
 
 
324 aa  125  3e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.524565  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4185  NUDIX hydrolase  40.67 
 
 
154 aa  123  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0649  NUDIX hydrolase  41.5 
 
 
154 aa  118  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2455  NUDIX hydrolase  43.57 
 
 
162 aa  103  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.490004  normal  0.610267 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  33.81 
 
 
229 aa  51.6  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1481  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
301 aa  45.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0468902  normal  0.959554 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3748  dinucleoside polyphosphate hydrolase  31.4 
 
 
161 aa  44.7  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0251963 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1911  NUDIX hydrolase  33.93 
 
 
167 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.389177 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0392  NUDIX family hydrolase  24.11 
 
 
149 aa  43.9  0.0007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000292752 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48240  dinucleoside polyphosphate hydrolase  36.07 
 
 
159 aa  43.9  0.0009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0992  NUDIX hydrolase  39.34 
 
 
180 aa  43.5  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0922  NUDIX hydrolase  30.53 
 
 
156 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1404  NUDIX hydrolase  30.53 
 
 
157 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567181  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1315  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 
156 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.511776  normal  0.0806389 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2428  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 
147 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00549514  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1382  NUDIX hydrolase  30.53 
 
 
156 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.162154 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1281  NUDIX hydrolase  30.53 
 
 
156 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2666  NUDIX domain-containing protein  30.16 
 
 
158 aa  41.2  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.661502  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0324  putative MutT family protein  31.61 
 
 
325 aa  40.8  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  32.82 
 
 
289 aa  40.8  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0845  dinucleoside polyphosphate hydrolase  35.71 
 
 
229 aa  40.4  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.206164  normal  0.713637 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0774  dinucleoside polyphosphate hydrolase  35.71 
 
 
229 aa  40.8  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1103  nudix hydrolase  46.81 
 
 
524 aa  40.8  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.426954 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4218  dinucleoside polyphosphate hydrolase  32.79 
 
 
159 aa  40.4  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0542  (di)nucleoside polyphosphate hydrolase  36.84 
 
 
159 aa  40.4  0.009  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.411915  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0319  dinucleoside polyphosphate hydrolase  41.18 
 
 
159 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.263917 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5199  dinucleoside polyphosphate hydrolase  41.18 
 
 
159 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5146  dinucleoside polyphosphate hydrolase  41.18 
 
 
159 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.834479 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5053  dinucleoside polyphosphate hydrolase  41.18 
 
 
159 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.483238  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4548  NUDIX hydrolase  30.53 
 
 
156 aa  40.4  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0905  NUDIX hydrolase  29.27 
 
 
152 aa  40  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.900036  normal  0.116186 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1839  dinucleoside polyphosphate hydrolase  40.68 
 
 
190 aa  40.4  0.01  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3625  dinucleoside polyphosphate hydrolase  35.71 
 
 
171 aa  40.4  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.635767  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>