65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0113 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0113  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 165 aa  323  6e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3663  NUDIX hydrolase  60.42 
 
 		 154 aa  161  4.0000000000000004e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3569  NUDIX hydrolase  53.21 
 
 		 163 aa  160  6e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3585  NUDIX hydrolase  57.52 
 
 		 162 aa  155  3e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00428581  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2044  NUDIX hydrolase  51.92 
 
 		 160 aa  154  6e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0671  NUDIX hydrolase  55.13 
 
 		 153 aa  149  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.616571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16970  predicted NTP pyrophosphohydrolase  55.62 
 
 		 154 aa  148  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.542075  normal  0.366756 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0358  NUDIX hydrolase  50.31 
 
 		 162 aa  147  8e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1098  NUDIX hydrolase  51.63 
 
 		 155 aa  142  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.448476  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5357  NUDIX hydrolase  53.21 
 
 		 154 aa  140  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.737057 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0064  NUDIX hydrolase  51.48 
 
 		 168 aa  140  8e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1389  NUDIX hydrolase  51.27 
 
 		 324 aa  139  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.524565  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3404  NUDIX hydrolase  53.59 
 
 		 174 aa  139  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321528  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3182  NUDIX hydrolase  51.55 
 
 		 163 aa  137  4.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.565463  normal  0.196576 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2993  NUDIX hydrolase  52.23 
 
 		 154 aa  136  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2909  NUDIX hydrolase  50.3 
 
 		 157 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188033  normal  0.899663 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2923  NUDIX hydrolase  50.3 
 
 		 157 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.928534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2879  NUDIX hydrolase  50.3 
 
 		 157 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5859  NUDIX hydrolase  47.1 
 
 		 153 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315919  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7253  NUDIX hydrolase  49.01 
 
 		 160 aa  134  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5719  NUDIX hydrolase  50.33 
 
 		 154 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.943651 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13765  hypothetical protein  47.8 
 
 		 166 aa  132  3e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.983203 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4521  NUDIX hydrolase  51.32 
 
 		 156 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.506364 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1987  NUDIX hydrolase  47.4 
 
 		 155 aa  128  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2817  NUDIX hydrolase  48.37 
 
 		 152 aa  127  6e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0645  NUDIX hydrolase  48.7 
 
 		 155 aa  125  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3428  NUDIX hydrolase  47.83 
 
 		 163 aa  124  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0230  NUDIX hydrolase  50.63 
 
 		 166 aa  124  7e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2262  NUDIX hydrolase  47.71 
 
 		 155 aa  122  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.997578  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2570  hypothetical protein  44.37 
 
 		 172 aa  122  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00072063  normal  0.0208228 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0645  hypothetical protein  50.32 
 
 		 154 aa  120  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4431  NUDIX hydrolase  43.21 
 
 		 164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2646  NUDIX hydrolase  44.3 
 
 		 155 aa  112  3e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4185  NUDIX hydrolase  36.71 
 
 		 154 aa  107  6e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0649  NUDIX hydrolase  39.74 
 
 		 154 aa  102  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2455  NUDIX hydrolase  38.12 
 
 		 162 aa  83.6  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.490004  normal  0.610267 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0891  NUDIX domain-containing protein  35.88 
 
 		 157 aa  52.4  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1418  NUDIX domain-containing protein  35.88 
 
 		 160 aa  52.4  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0700  NUDIX domain-containing protein  35.88 
 
 		 160 aa  52.4  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0460  NUDIX domain-containing protein  35.88 
 
 		 160 aa  52.4  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.080692  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  35.88 
 
 		 160 aa  51.2  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1632  NUDIX family hydrolase  35.88 
 
 		 160 aa  51.2  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081171  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4051  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 315 aa  50.8  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2666  NUDIX domain-containing protein  35.11 
 
 		 158 aa  50.4  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.661502  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1810  NUDIX family hydrolase  35.61 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0747  hypothetical protein  34.42 
 
 		 153 aa  47.8  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1315  NUDIX hydrolase  32.33 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.511776  normal  0.0806389 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2830  NUDIX hydrolase  35.82 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282197  normal  0.0206964 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1281  NUDIX hydrolase  32.33 
 
 		 156 aa  45.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0922  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1305  NUDIX family hydrolase  35.82 
 
 		 149 aa  45.4  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1404  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 		 157 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567181  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1911  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 		 167 aa  44.7  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.389177 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0697  NUDIX hydrolase  34.33 
 
 		 153 aa  44.3  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.405136  normal  0.276525 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5221  NUDIX hydrolase  32.28 
 
 		 333 aa  43.9  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.239365  normal  0.144046 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  36.63 
 
 		 289 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1382  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.162154 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0763  NUDIX hydrolase  33.58 
 
 		 153 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0534462 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1639  NUDIX hydrolase  26.42 
 
 		 136 aa  43.1  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000053664  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0905  NUDIX hydrolase  35.34 
 
 		 152 aa  42  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.900036  normal  0.116186 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1152  NUDIX hydrolase  39.33 
 
 		 296 aa  41.6  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000396101 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3212  NUDIX hydrolase  45.9 
 
 		 302 aa  41.2  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4548  NUDIX hydrolase  32.06 
 
 		 156 aa  41.2  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3015  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 351 aa  41.2  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25640  ADP-ribose pyrophosphatase  37.25 
 
 		 314 aa  40.8  0.009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194053  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>