196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1659 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1659  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 194 aa  373  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.074052  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6699  NUDIX hydrolase  46.77 
 
 		 215 aa  137  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.121967 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0978  NUDIX hydrolase  45.56 
 
 		 189 aa  121  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2209  NUDIX hydrolase  34.1 
 
 		 184 aa  82.4  0.000000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.022301  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2029  NUDIX hydrolase  33.7 
 
 		 184 aa  81.3  0.000000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.40025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0157  NUDIX hydrolase  36.25 
 
 		 180 aa  74.3  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0179624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  34.91 
 
 		 177 aa  73.2  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2467  NUDIX hydrolase  37.59 
 
 		 181 aa  72.4  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5410  NUDIX hydrolase  37.8 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  31.95 
 
 		 180 aa  70.9  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0471  NUDIX hydrolase  28.07 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  28.07 
 
 		 178 aa  69.3  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1662  NUDIX hydrolase  28.06 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0963  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 		 180 aa  67.8  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000383094  normal  0.278011 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  27.87 
 
 		 177 aa  67.8  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2928  NUDIX hydrolase  29.31 
 
 		 189 aa  67  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0219  NUDIX hydrolase  24.42 
 
 		 184 aa  67  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0600  NUDIX hydrolase  27.71 
 
 		 183 aa  66.2  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0232  hypothetical protein  29.59 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.714493 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 		 178 aa  65.5  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15030  NTP pyrophosphohydrolase  35.07 
 
 		 181 aa  64.7  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.202896  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3495  NUDIX hydrolase  32.64 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  24.14 
 
 		 176 aa  64.3  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2771  NUDIX hydrolase  29.93 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2826  pyrophosphohydrolase related protein  26.74 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1424  NUDIX hydrolase  32.39 
 
 		 188 aa  62  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.884669  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  27.71 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1488  NUDIX hydrolase  29.53 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.587819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1757  NUDIX hydrolase  33.79 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335075  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3140  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.511935  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  28.23 
 
 		 180 aa  60.5  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1242  NUDIX hydrolase  30.65 
 
 		 182 aa  60.5  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2474  MutT/nudix family protein  29.31 
 
 		 182 aa  59.3  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.131904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3000  NUDIX hydrolase  28.65 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02241  hypothetical protein  33.08 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0727099  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1439  NUDIX hydrolase  32.52 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  25.28 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1194  NUDIX family hydrolase  25.41 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13740  NTP pyrophosphohydrolase  33.14 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2006  NUDIX hydrolase  31.4 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00276085  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4146  NUDIX hydrolase  29.11 
 
 		 180 aa  58.2  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1912  NUDIX hydrolase  31.18 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255381  hitchhiker  0.000304952 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  27.56 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0180  NUDIX hydrolase  31.29 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195159 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  29.03 
 
 		 184 aa  57  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11715  hypothetical protein  29.09 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.191182 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0333  MutT/nudix family protein  26.97 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0452702  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2439  NUDIX hydrolase  36 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000635517  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  34.75 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  26.75 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3156  NUDIX hydrolase  31.49 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.38817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2486  NUDIX hydrolase  36.05 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.253943  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2672  NUDIX hydrolase  30.3 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.687973  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3069  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 188 aa  53.9  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  26.51 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0039  NUDIX hydrolase  30.71 
 
 		 183 aa  53.9  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 		 182 aa  54.3  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1444  NUDIX hydrolase  30.72 
 
 		 181 aa  53.9  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.9766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1921  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 		 201 aa  53.9  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.137486 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0835  NUDIX hydrolase  34.19 
 
 		 199 aa  53.9  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.773833  normal  0.937872 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  27.22 
 
 		 186 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1754  NUDIX hydrolase  31.54 
 
 		 175 aa  53.1  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3241  NUDIX hydrolase  29.51 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.021012  normal  0.962326 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2943  NUDIX hydrolase  28.11 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4021  NUDIX hydrolase  32.03 
 
 		 181 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2991  NUDIX hydrolase  34.09 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2987  NUDIX hydrolase  28.11 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4096  NUDIX hydrolase  32.03 
 
 		 181 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.196207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3282  NUDIX hydrolase  32.31 
 
 		 211 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4523  NUDIX hydrolase  33.87 
 
 		 178 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4251  NUDIX hydrolase  32.03 
 
 		 181 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.833226  normal  0.0489284 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  28.19 
 
 		 179 aa  53.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  30.56 
 
 		 186 aa  52.8  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2272  NUDIX hydrolase  31.97 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6067  NUDIX hydrolase  34.55 
 
 		 193 aa  52.8  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0114891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2199  NUDIX hydrolase  25.98 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.404575 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2822  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 210 aa  52.8  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1876  NUDIX hydrolase  25 
 
 		 203 aa  52.4  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.765348  normal  0.48572 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0942  NUDIX hydrolase  27.97 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2151  NUDIX hydrolase  31.97 
 
 		 196 aa  52.4  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0499113  normal  0.401781 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3049  NUDIX hydrolase  26.86 
 
 		 182 aa  52.4  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1024  NUDIX hydrolase  33.6 
 
 		 180 aa  52.4  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00585419  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2047  hypothetical protein  28.23 
 
 		 205 aa  52  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440129  normal  0.12393 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  27.43 
 
 		 179 aa  52  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1418  ADP-ribose pyrophosphatase  30.77 
 
 		 207 aa  52  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.656759  normal  0.0166929 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  27.33 
 
 		 179 aa  52  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3605  NUDIX hydrolase  24.63 
 
 		 181 aa  51.6  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1066  NUDIX hydrolase  34.75 
 
 		 201 aa  51.6  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.133388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0722  NUDIX hydrolase  28.79 
 
 		 184 aa  51.6  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  28.4 
 
 		 177 aa  51.2  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1994  NUDIX hydrolase  30.33 
 
 		 196 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0156913  normal  0.284552 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1507  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.694951  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2958  NUDIX hydrolase  27.57 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.682992  normal  0.58041 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2174  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0334323  normal  0.0698698 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3501  NUDIX hydrolase  32.8 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.368602  normal  0.313364 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1037  NUDIX hydrolase  29.51 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0271  NUDIX hydrolase  27.13 
 
 		 180 aa  50.4  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.443042  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0976  NUDIX hydrolase  29.66 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.82021  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5562  NUDIX hydrolase  30.33 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.531481 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>