More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_11430 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_11430  ADP-ribose pyrophosphatase  100 
 
 
129 aa  266  5.9999999999999995e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.250404  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1617  NUDIX hydrolase  58.4 
 
 
132 aa  153  8e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267139  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11810  ADP-ribose pyrophosphatase  48.03 
 
 
131 aa  122  2e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  47.66 
 
 
139 aa  118  3e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0634  NUDIX hydrolase  48.41 
 
 
143 aa  113  8.999999999999998e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2984  NUDIX hydrolase  39.67 
 
 
136 aa  102  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000021571  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1486  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 
131 aa  101  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00282357  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0428  NUDIX hydrolase  43.65 
 
 
138 aa  100  8e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.834318  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1921  NUDIX hydrolase  39.69 
 
 
133 aa  98.2  3e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.11755  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0910  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 
141 aa  97.1  8e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1790  NUDIX hydrolase  37.8 
 
 
154 aa  96.7  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2482  NUDIX hydrolase  36.22 
 
 
138 aa  93.2  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2053  MutT/nudix family protein  39.67 
 
 
132 aa  92.4  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.381111  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0863  NUDIX hydrolase  42.4 
 
 
153 aa  92.8  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.522755 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1931  NUDIX hydrolase  35.94 
 
 
133 aa  91.7  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000285208  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3078  NUDIX hydrolase  38.93 
 
 
134 aa  88.6  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2684  CTP pyrophosphohydrolase  36.15 
 
 
134 aa  86.7  9e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00235226  normal  0.16537 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  40.8 
 
 
151 aa  85.9  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2293  mutator MutT protein  40.52 
 
 
129 aa  84.3  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.192428  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3866  NUDIX hydrolase  39.2 
 
 
167 aa  83.6  8e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.190486  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4056  mutator MutT protein  39.17 
 
 
131 aa  82.8  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.640988  normal  0.0322443 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1077  NUDIX hydrolase  34.81 
 
 
244 aa  82.4  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0643191  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  39.53 
 
 
132 aa  82.8  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3270  NUDIX hydrolase  37.19 
 
 
139 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196596  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0979  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
147 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.353962 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  39.67 
 
 
138 aa  80.9  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3691  NUDIX hydrolase  34.17 
 
 
141 aa  81.3  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.27613 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2414  NUDIX hydrolase  36.8 
 
 
126 aa  80.9  0.000000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143725  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  40.5 
 
 
137 aa  80.1  0.000000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0356  mutator MutT protein  35.66 
 
 
136 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  37.21 
 
 
132 aa  80.1  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  39.84 
 
 
142 aa  79.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0787  NUDIX hydrolase  38.66 
 
 
128 aa  79  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.585292  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  39.02 
 
 
314 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1687  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.43 
 
 
140 aa  78.6  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  39.34 
 
 
128 aa  79.3  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 
150 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  39.84 
 
 
137 aa  79.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  38.84 
 
 
135 aa  79  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2457  putative mutT-like protein  36.15 
 
 
147 aa  78.2  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  36 
 
 
138 aa  78.2  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  37.98 
 
 
132 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  39.06 
 
 
347 aa  78.2  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1775  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 
129 aa  77.8  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.296323  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3053  NUDIX hydrolase  38.21 
 
 
128 aa  77.4  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0321786  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  37.98 
 
 
132 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  37.98 
 
 
132 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4152  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 
128 aa  77.4  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0641206  decreased coverage  0.0000968848 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 
334 aa  77  0.00000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  37.3 
 
 
138 aa  77  0.00000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2204  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
141 aa  77  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  37.7 
 
 
138 aa  76.3  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3770  NUDIX hydrolase  40 
 
 
200 aa  76.3  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.288059 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0212  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  34.38 
 
 
368 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1657  NUDIX hydrolase  44.94 
 
 
132 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.809555  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  37.01 
 
 
134 aa  76.3  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  37.7 
 
 
138 aa  76.3  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1031  putative mutator mutT protein  36.72 
 
 
131 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0898  mutator MutT protein, putative  36.72 
 
 
131 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0730911  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2519  NUDIX hydrolase  36.89 
 
 
133 aa  76.3  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  34.96 
 
 
352 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2201  NUDIX hydrolase  35.11 
 
 
132 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  37.29 
 
 
136 aa  75.5  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  38.21 
 
 
129 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2065  NUDIX hydrolase  35.83 
 
 
129 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2716  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.15 
 
 
133 aa  75.9  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2157  NUDIX hydrolase  35.83 
 
 
129 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  36.51 
 
 
318 aa  75.9  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1863  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 
132 aa  75.5  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.477977  normal  0.665179 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2289  NUDIX hydrolase  35.11 
 
 
132 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.648467  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8468  NUDIX hydrolase  37.69 
 
 
130 aa  75.1  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410235  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  38.64 
 
 
570 aa  75.1  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0325  NUDIX hydrolase  36.07 
 
 
129 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.849393  normal  0.626146 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  37.4 
 
 
314 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  37.4 
 
 
314 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2568  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 
130 aa  74.3  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3508  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.33 
 
 
128 aa  74.3  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116101  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3377  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.33 
 
 
128 aa  74.3  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0382964  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0991  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  35.43 
 
 
132 aa  74.3  0.0000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2908  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.33 
 
 
128 aa  74.3  0.0000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0055236  normal  0.908985 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2516  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 
130 aa  74.3  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5494  NUDIX hydrolase  40.2 
 
 
172 aa  74.3  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.202592 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  34.15 
 
 
352 aa  73.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  38.89 
 
 
138 aa  73.6  0.0000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  37.4 
 
 
314 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2042  NUDIX hydrolase  36.44 
 
 
129 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000547499 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  35.38 
 
 
137 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  37.82 
 
 
133 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  36.07 
 
 
133 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1430  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.62 
 
 
135 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.166534  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1712  NUDIX hydrolase  37.17 
 
 
138 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148507  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1977  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.22 
 
 
128 aa  72.4  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000101182  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  36.52 
 
 
138 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2380  NUDIX hydrolase  34.4 
 
 
169 aa  72  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1983  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.62 
 
 
135 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000136061  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2341  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.22 
 
 
128 aa  72.4  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000814495  normal  0.025223 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2086  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.22 
 
 
128 aa  72.4  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.16532  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4940  NUDIX hydrolase  37.17 
 
 
146 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000317059 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1873  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.62 
 
 
135 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.440168  hitchhiker  0.000083786 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01716  hypothetical protein  34.62 
 
 
135 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.15744  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>