65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1257 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1257  phosphohistidine phosphatase, SixA  100 
 
 
153 aa  316  6e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.204304  normal  0.125105 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0940  phosphohistidine phosphatase, SixA  48.68 
 
 
153 aa  154  6e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1968  hypothetical protein  35.95 
 
 
155 aa  111  3e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1962  hypothetical protein  35.95 
 
 
155 aa  110  5e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0393  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.58 
 
 
154 aa  89  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0246884  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2007  phosphohistidine phosphatase SixA homolog  35.1 
 
 
159 aa  85.1  3e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0188  phosphohistidine phosphatase SixA  34.44 
 
 
157 aa  84.7  4e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0156  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.1 
 
 
148 aa  80.5  0.000000000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0582  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.77 
 
 
146 aa  77.4  0.00000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.016347  normal  0.230765 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0142  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.93 
 
 
155 aa  67  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.124831  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1554  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.79 
 
 
146 aa  58.5  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1196  phosphohistidine phosphatase SixA  30.14 
 
 
157 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3490  phosphohistidine phosphatase, SixA  26.38 
 
 
168 aa  55.5  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.397365  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03117  hypothetical protein  22.93 
 
 
154 aa  52.4  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2719  phosphohistidine phosphatase  25 
 
 
161 aa  51.6  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1317  phosphohistidine phosphatase, SixA  25 
 
 
161 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2498  phosphohistidine phosphatase  25 
 
 
161 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.826923  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2491  phosphohistidine phosphatase  25 
 
 
161 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2636  phosphohistidine phosphatase  25 
 
 
161 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.710371  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1313  phosphohistidine phosphatase  25 
 
 
161 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.144029  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3482  phosphohistidine phosphatase  25 
 
 
161 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02225  hypothetical protein  25 
 
 
161 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002860  phosphohistidine phosphatase SixA  23.42 
 
 
154 aa  51.6  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02264  phosphohistidine phosphatase  25 
 
 
161 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0423  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  26.54 
 
 
168 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.762465 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2814  phosphohistidine phosphatase  26.58 
 
 
160 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2576  phosphohistidine phosphatase  24.36 
 
 
161 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2629  phosphohistidine phosphatase  24.36 
 
 
161 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000296858 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2616  phosphohistidine phosphatase  24.36 
 
 
161 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6448  normal  0.510591 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2741  phosphohistidine phosphatase  24.36 
 
 
161 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.191818  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2880  phosphohistidine phosphatase  23.72 
 
 
161 aa  48.5  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00688568  normal  0.224606 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4088  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.39 
 
 
165 aa  48.5  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1244  phosphohistidine phosphatase, SixA  27.75 
 
 
161 aa  48.1  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.136053 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1476  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.51 
 
 
149 aa  47.4  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.327874  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2123  phosphohistidine phosphatase, SixA  27.21 
 
 
159 aa  45.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263513 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2527  phosphohistidine phosphatase  23.72 
 
 
161 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2596  phosphohistidine phosphatase, SixA  25.48 
 
 
162 aa  45.1  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2177  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.21 
 
 
164 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210616  hitchhiker  0.00370879 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1402  phosphohistidine phosphatase  22.44 
 
 
163 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1965  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.95 
 
 
164 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590219  normal  0.236004 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0380  phosphohistidine phosphatase  22.44 
 
 
163 aa  44.7  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1450  phosphohistidine phosphatase  23.08 
 
 
160 aa  44.7  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2131  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.75 
 
 
159 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1740  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.75 
 
 
159 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.407781  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2755  phosphohistidine phosphatase, SixA  25.32 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2772  phosphohistidine phosphatase, SixA  25.32 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1604  phosphohistidine phosphatase, SixA  25.32 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0959361 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2849  phosphohistidine phosphatase, SixA  25.32 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000875019 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2579  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  26.71 
 
 
167 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2415  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.05 
 
 
164 aa  42.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2454  phosphohistidine phosphatase, SixA  25.32 
 
 
156 aa  42.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1872  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.82 
 
 
169 aa  42.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.322395  normal  0.942928 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1413  phosphohistidine phosphatase, SixA  25.32 
 
 
156 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575562  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1658  phosphohistidine phosphatase  25.62 
 
 
157 aa  42.4  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1342  phosphohistidine phosphatase, SixA  24.36 
 
 
161 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1478  phosphohistidine phosphatase, SixA  25.32 
 
 
156 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.49019  normal  0.309785 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1466  phosphohistidine phosphatase, SixA  25.32 
 
 
156 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00970455 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2165  phosphohistidine phosphatase SixA  22.64 
 
 
156 aa  41.6  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1407  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.08 
 
 
165 aa  41.2  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1376  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.08 
 
 
165 aa  41.2  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2712  phosphohistidine phosphatase, SixA  27.59 
 
 
164 aa  40.8  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.409858  normal  0.601311 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3082  phosphohistidine phosphatase SixA  24.05 
 
 
156 aa  40.8  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3377  phosphohistidine phosphatase  25.32 
 
 
160 aa  40.8  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1511  phosphohistidine phosphatase  22.79 
 
 
158 aa  40.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1528  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.01 
 
 
179 aa  40.4  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.66564  normal  0.569755 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>