102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4278 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4278  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  100 
 
 		 175 aa  334  3.9999999999999995e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1740  phosphohistidine phosphatase, SixA  38.36 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.407781  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2131  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.11 
 
 		 159 aa  74.3  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2645  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.48 
 
 		 167 aa  70.9  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2564  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.48 
 
 		 167 aa  67.8  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000228315  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2164  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.86 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0982  phosphohistidine phosphatase, SixA  32 
 
 		 156 aa  60.5  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.123547 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1034  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.38 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.691963 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1070  hypothetical protein  31.36 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0216  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.26 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2731  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.77 
 
 		 168 aa  58.2  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.542354  normal  0.0377706 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2758  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.36 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.908873 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1207  phosphohistidine phosphatase, SixA  39.02 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.789381  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2712  phosphohistidine phosphatase, SixA  29.27 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.409858  normal  0.601311 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3007  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.04 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2441  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  27.89 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.681319 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26931  phosphohistidine phosphatase SixA  35.48 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2799  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  27.92 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545604  normal  0.205647 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1295  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.69 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0539  phosphohistidine phosphatase  33.33 
 
 		 185 aa  53.5  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1581  phosphohistidine phosphatase, SixA  27.38 
 
 		 166 aa  52.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.511675 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1002  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.4 
 
 		 164 aa  53.1  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0697056 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2067  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.56 
 
 		 150 aa  52.4  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0590  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.16 
 
 		 170 aa  52.4  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1872  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.5 
 
 		 169 aa  52  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.322395  normal  0.942928 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0878  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.4 
 
 		 182 aa  51.6  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000348757 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03117  hypothetical protein  25.62 
 
 		 154 aa  51.6  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0198  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.33 
 
 		 155 aa  51.2  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.581488  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0468  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  22.22 
 
 		 161 aa  51.2  0.000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1166  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.26 
 
 		 171 aa  51.2  0.000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.773586 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0305  phosphohistidine phosphatase, SixA  29.69 
 
 		 164 aa  51.2  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02694  Phosphohistidine phosphatase SixA (RX6)  28.86 
 
 		 175 aa  50.8  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0471403  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0613  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.59 
 
 		 162 aa  50.4  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.639252  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3096  phosphoglycerate mutase domain-containing protein  30.71 
 
 		 166 aa  49.7  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.897971  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2863  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.21 
 
 		 168 aa  49.7  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1896  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.46 
 
 		 168 aa  48.5  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1661  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.76 
 
 		 176 aa  48.9  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0747644  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1261  phosphoglycerate mutase family protein  25.76 
 
 		 165 aa  48.9  0.00004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.542103  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2231  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  34.01 
 
 		 173 aa  48.5  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.571995  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1478  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  27.78 
 
 		 179 aa  48.5  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.924383  normal  0.612523 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09860  phosphohistidine phosphatase SixA  31.1 
 
 		 169 aa  48.5  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.48313  normal  0.0870397 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0881  phosphohistidine phosphatase SixA  23.58 
 
 		 159 aa  48.1  0.00006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2414  phosphohistidine phosphatase, SixA  39.31 
 
 		 162 aa  48.1  0.00007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2468  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.57 
 
 		 174 aa  47.8  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4293  phosphohistidine phosphatase, SixA  27.67 
 
 		 169 aa  47.8  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0542365  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3491  phosphohistidine phosphatase, SixA  36.05 
 
 		 152 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0915  phosphohistidine phosphatase SixA  22.94 
 
 		 159 aa  47.4  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0942  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  36.97 
 
 		 170 aa  47  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.574003  normal  0.218126 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4167  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.01 
 
 		 152 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2018  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.86 
 
 		 153 aa  46.6  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1700  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.01 
 
 		 152 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.047664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002860  phosphohistidine phosphatase SixA  25.62 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2562  phosphohistidine phosphatase SixA  31.21 
 
 		 161 aa  45.8  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3154  phosphohistidine phosphatase SixA  24.18 
 
 		 166 aa  46.2  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0131638  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2016  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.25 
 
 		 157 aa  45.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.492708  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1996  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  34.69 
 
 		 173 aa  45.8  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.03624e-17 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4206  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.87 
 
 		 150 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.550023 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1113  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  34.11 
 
 		 174 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1418  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  39.37 
 
 		 171 aa  45.4  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.656098  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0935  phosphoglycerate mutase family protein  30.25 
 
 		 185 aa  45.4  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0135  hypothetical protein  33.59 
 
 		 157 aa  45.1  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.482904  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1376  phosphohistidine phosphatase, SixA  39.06 
 
 		 165 aa  45.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1407  phosphohistidine phosphatase, SixA  39.06 
 
 		 165 aa  45.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1691  phosphohistidine phosphatase, SixA  42.65 
 
 		 183 aa  45.1  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1539  hydrolase protein  31.25 
 
 		 157 aa  44.7  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0861211 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29020  phosphohistidine phosphatase SixA  34.88 
 
 		 156 aa  44.7  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1955  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.81 
 
 		 160 aa  44.7  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.187267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2314  phosphohistidine phosphatase SixA  30.81 
 
 		 160 aa  44.7  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.889503  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1708  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.41 
 
 		 163 aa  44.3  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.113004  normal  0.92031 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2363  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.37 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.822646  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0881  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.01 
 
 		 172 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00451478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2465  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.48 
 
 		 152 aa  43.9  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.101249  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1088  phosphoglycerate mutase family protein  34.29 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4984  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.82 
 
 		 183 aa  43.9  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0277019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1288  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  26.67 
 
 		 165 aa  43.9  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2307  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  37.5 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152569  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2215  phosphohistidine phosphatase SixA  34.4 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3823  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.52 
 
 		 176 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.347693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2623  phosphohistidine phosphatase, SixA  44.44 
 
 		 153 aa  43.1  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.734244  normal  0.742312 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3739  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.46 
 
 		 152 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2108  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.16 
 
 		 156 aa  43.5  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7090  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.97 
 
 		 174 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0609334  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0433  phosphohistidine phosphatase, SixA  39.68 
 
 		 160 aa  42.7  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00255278 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2123  phosphohistidine phosphatase, SixA  27.67 
 
 		 159 aa  42.4  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00263513 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0378  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.23 
 
 		 158 aa  42.4  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.214112  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0659  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.8 
 
 		 175 aa  42.4  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2211  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.09 
 
 		 157 aa  42  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5092  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.33 
 
 		 176 aa  42  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.454975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1097  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  34.25 
 
 		 152 aa  42  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.832383  normal  0.23476 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1547  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  27.63 
 
 		 177 aa  42  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.023949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3058  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.33 
 
 		 185 aa  42  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0142  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.36 
 
 		 155 aa  41.6  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.124831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2024  phosphohistidine phosphatase SixA  31.37 
 
 		 151 aa  41.6  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.469683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2489  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.31 
 
 		 161 aa  41.6  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1195  phosphohistidine phosphatase, SixA  26.77 
 
 		 152 aa  41.6  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0186359  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1285  phospho-histidine phosphatase  35.29 
 
 		 152 aa  41.2  0.008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.849607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4627  phosphoglycerate mutase  30.33 
 
 		 176 aa  41.2  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.026372 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0432  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.01 
 
 		 158 aa  41.2  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2848  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.21 
 
 		 152 aa  41.2  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.846739 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1502  phosphohistidine phosphatase SixA  30.43 
 
 		 152 aa  40.8  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.358356  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>