197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2814 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2814  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  100 
 
 
164 aa  345  2e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2441  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  60.98 
 
 
164 aa  233  1.0000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2415  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  58.28 
 
 
164 aa  215  2.9999999999999998e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2579  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  57.32 
 
 
167 aa  211  2.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2173  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  53.99 
 
 
163 aa  205  2e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2027  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  45.12 
 
 
164 aa  173  9.999999999999999e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2056  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  45.68 
 
 
166 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1270  Phosphoglycerate mutase  39.63 
 
 
166 aa  144  4.0000000000000006e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3078  Phosphoglycerate mutase  41.88 
 
 
167 aa  142  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00800804 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3096  phosphoglycerate mutase domain-containing protein  39.88 
 
 
166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.897971  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2342  phosphohistidine phosphatase  38.75 
 
 
175 aa  137  8.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.542456  normal  0.567603 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0656  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.37 
 
 
166 aa  123  9e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.142438 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0881  phosphohistidine phosphatase SixA  36.81 
 
 
159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0915  phosphohistidine phosphatase SixA  34.97 
 
 
159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2799  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  34.36 
 
 
168 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545604  normal  0.205647 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1088  phosphoglycerate mutase family protein  34.55 
 
 
164 aa  100  7e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1261  phosphoglycerate mutase family protein  31.52 
 
 
165 aa  99  3e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.542103  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17830  phosphoglycerate mutase family protein  36.02 
 
 
160 aa  98.2  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4536  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.4 
 
 
161 aa  94.7  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11918  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  36.02 
 
 
161 aa  94.7  5e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.298677  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1082  phosphohistidine phosphatase SixA  32.72 
 
 
170 aa  94.4  6e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.396252  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0426  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.54 
 
 
185 aa  94  9e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.407898  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1113  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.73 
 
 
174 aa  93.6  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0787  phosphohistidine phosphatase SixA  33.54 
 
 
170 aa  93.2  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.107498  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1020  phosphohistidine phosphatase SixA  32.72 
 
 
170 aa  92  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0327299  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6214  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  34.12 
 
 
174 aa  91.3  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0488277  normal  0.901289 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7090  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  34.12 
 
 
174 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0609334  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0733  phosphohistidine phosphatase SixA, putative  27.95 
 
 
163 aa  88.6  3e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00220786  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2441  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.12 
 
 
167 aa  87.8  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.681319 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4118  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.59 
 
 
173 aa  87  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0361837  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5092  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.65 
 
 
176 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.454975  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4627  phosphoglycerate mutase  28.65 
 
 
176 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.026372 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3559  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.65 
 
 
188 aa  79.3  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.994671 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2363  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.41 
 
 
181 aa  78.6  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.822646  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3058  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30 
 
 
185 aa  79  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0468  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.06 
 
 
161 aa  78.6  0.00000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0659  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  26.74 
 
 
175 aa  77.8  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1415  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.1 
 
 
183 aa  77.4  0.00000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0420661  normal  0.240897 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1478  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.82 
 
 
179 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.924383  normal  0.612523 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0806  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.71 
 
 
175 aa  75.5  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0338  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.06 
 
 
445 aa  75.5  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.864147  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5166  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  26.32 
 
 
175 aa  75.1  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3823  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.31 
 
 
176 aa  73.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.347693  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1547  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.97 
 
 
177 aa  73.2  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.023949  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1661  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.55 
 
 
176 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0747644  normal  0.647229 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4823  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.19 
 
 
155 aa  70.5  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2162  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.89 
 
 
170 aa  68.6  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0881  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.94 
 
 
172 aa  68.6  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00451478  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0378  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.23 
 
 
158 aa  68.2  0.00000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.214112  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2469  hypothetical protein  30.83 
 
 
166 aa  67.8  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03579  putative phosphoglycerate mutase family protein  29.25 
 
 
158 aa  67.8  0.00000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4461  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30 
 
 
176 aa  67  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871822  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1480  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  27.5 
 
 
185 aa  66.6  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.474903  normal  0.555316 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0299  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.01 
 
 
165 aa  65.9  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3504  Phosphoglycerate mutase  28.28 
 
 
165 aa  65.9  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.107092  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0386  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  34.43 
 
 
170 aa  65.5  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.398558  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2177  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.5 
 
 
164 aa  65.5  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210616  hitchhiker  0.00370879 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0432  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.23 
 
 
158 aa  65.1  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1896  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.67 
 
 
168 aa  64.7  0.0000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2645  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.54 
 
 
167 aa  64.7  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4984  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.4 
 
 
183 aa  64.7  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0277019  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1035  hypothetical protein  32.2 
 
 
166 aa  64.3  0.0000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.247304  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0059  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.08 
 
 
185 aa  64.3  0.0000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0689048  hitchhiker  0.00895006 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0099  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.4 
 
 
158 aa  63.9  0.0000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.239035  normal  0.0377722 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0135  hypothetical protein  27.27 
 
 
157 aa  63.9  0.0000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.482904  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1965  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.5 
 
 
164 aa  63.9  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590219  normal  0.236004 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5335  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.93 
 
 
157 aa  63.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0226085 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1418  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  26.57 
 
 
171 aa  63.5  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.656098  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5540  hypothetical protein  27.22 
 
 
175 aa  63.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.191879 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21760  phosphohistidine phosphatase SixA  29.27 
 
 
174 aa  63.5  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0322  putative phosphatase  29.09 
 
 
166 aa  63.5  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.629623  normal  0.448063 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1094  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  29.14 
 
 
183 aa  62.8  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.175026 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2309  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  27.22 
 
 
168 aa  61.6  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1328  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.31 
 
 
179 aa  61.2  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2121  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.71 
 
 
180 aa  60.8  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.88488  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1730  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.95 
 
 
172 aa  60.8  0.000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1070  hypothetical protein  33.33 
 
 
168 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2731  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.33 
 
 
168 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.542354  normal  0.0377706 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1418  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  26.95 
 
 
166 aa  59.7  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0501  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  27.75 
 
 
181 aa  59.3  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4293  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.43 
 
 
169 aa  58.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0542365  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15890  phosphohistidine phosphatase SixA  27.5 
 
 
175 aa  58.2  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0507958  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1691  phosphohistidine phosphatase, SixA  28.33 
 
 
183 aa  58.2  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03360  phosphohistidine phosphatase SixA  30.33 
 
 
174 aa  57.8  0.00000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1166  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.33 
 
 
171 aa  58.2  0.00000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.773586 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2863  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.67 
 
 
168 aa  58.2  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0935  phosphoglycerate mutase family protein  29.17 
 
 
185 aa  57.4  0.00000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0224  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.72 
 
 
154 aa  57.4  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09860  phosphohistidine phosphatase SixA  27.27 
 
 
169 aa  57.4  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.48313  normal  0.0870397 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1528  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.58 
 
 
179 aa  57  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.66564  normal  0.569755 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0631  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28 
 
 
168 aa  56.2  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0590  phosphohistidine phosphatase, SixA  33.64 
 
 
170 aa  56.6  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3521  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  27.65 
 
 
175 aa  55.8  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000585332 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00790  phosphohistidine phosphatase SixA  29.01 
 
 
439 aa  55.1  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1207  phosphohistidine phosphatase, SixA  29.75 
 
 
162 aa  54.7  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.789381  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1955  phosphohistidine phosphatase, SixA  27.85 
 
 
160 aa  53.9  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.187267  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2314  phosphohistidine phosphatase SixA  27.85 
 
 
160 aa  53.9  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.889503  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0497  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  29.85 
 
 
162 aa  53.5  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.316739  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1295  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.88 
 
 
154 aa  53.5  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0498  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.9 
 
 
161 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>