34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0371 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0371  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  100 
 
 		 446 aa  902    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15010  phosphohistidine phosphatase SixA  29.74 
 
 		 462 aa  167  2.9999999999999998e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000021868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00790  phosphohistidine phosphatase SixA  28.37 
 
 		 439 aa  165  2.0000000000000002e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2314  phosphohistidine phosphatase SixA  37.5 
 
 		 160 aa  73.2  0.000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.889503  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1955  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.5 
 
 		 160 aa  73.2  0.000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.187267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2108  phosphohistidine phosphatase, SixA  37.4 
 
 		 156 aa  67  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2164  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.24 
 
 		 161 aa  65.1  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0982  phosphohistidine phosphatase, SixA  31.69 
 
 		 156 aa  62  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.123547 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1476  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  36.52 
 
 		 149 aa  60.8  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.327874  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0468  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  27.43 
 
 		 161 aa  57.4  0.0000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2342  phosphohistidine phosphatase  32.03 
 
 		 175 aa  55.1  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.542456  normal  0.567603 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0582  phosphohistidine phosphatase, SixA  38.52 
 
 		 146 aa  52.8  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.016347  normal  0.230765 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0733  phosphohistidine phosphatase SixA, putative  22.73 
 
 		 163 aa  52.4  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00220786  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4293  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.6 
 
 		 169 aa  51.2  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0542365  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2799  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  34.48 
 
 		 168 aa  50.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545604  normal  0.205647 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0915  phosphohistidine phosphatase SixA  29.17 
 
 		 159 aa  48.9  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0892  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.54 
 
 		 152 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0509974 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0878  phosphohistidine phosphatase, SixA  35.46 
 
 		 182 aa  48.5  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000348757 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2468  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.29 
 
 		 174 aa  48.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0142  phosphohistidine phosphatase, SixA  34.19 
 
 		 155 aa  47.8  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.124831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2848  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.35 
 
 		 152 aa  47.4  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.846739 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2173  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  32.89 
 
 		 163 aa  47.8  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1276  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.35 
 
 		 152 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal  0.178305 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1658  phosphohistidine phosphatase  27.14 
 
 		 157 aa  45.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2758  phosphohistidine phosphatase SixA  35.43 
 
 		 216 aa  45.8  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0235368  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3078  Phosphoglycerate mutase  32.54 
 
 		 167 aa  44.3  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800804 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2441  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  30.77 
 
 		 167 aa  43.9  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.681319 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0942  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.33 
 
 		 170 aa  43.9  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.574003  normal  0.218126 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2645  phosphohistidine phosphatase, SixA  35 
 
 		 167 aa  43.9  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6214  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  33.33 
 
 		 174 aa  43.5  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0488277  normal  0.901289 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1207  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.61 
 
 		 162 aa  43.9  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.789381  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1270  Phosphoglycerate mutase  27.78 
 
 		 166 aa  43.5  0.008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1996  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  39.53 
 
 		 173 aa  43.1  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.03624e-17 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2419  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.47 
 
 		 156 aa  43.1  0.01  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.758987 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>