28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3698 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_3698  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
205 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.495695  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0807  phosphoglycerate mutase  97.56 
 
 
205 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3822  phosphoglycerate mutase  96.1 
 
 
205 aa  400  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.579932 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3640  Phosphoglycerate mutase  95.61 
 
 
205 aa  393  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0749  hypothetical protein  66.84 
 
 
197 aa  258  4e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3232  phosphoglycerate mutase  64.88 
 
 
201 aa  256  2e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3352  phosphoglycerate mutase  73.62 
 
 
197 aa  246  2e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3522  phosphoglycerate mutase  73.01 
 
 
197 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0601  phosphoglycerate mutase  73.01 
 
 
197 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0941  hypothetical protein  51.7 
 
 
181 aa  159  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0856  phosphoglycerate mutase  48.17 
 
 
178 aa  155  3e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0991  phosphoglycerate mutase  45.39 
 
 
179 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0170558 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0842  phosphoglycerate mutase  47.65 
 
 
197 aa  132  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.166737  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0187  Phosphoglycerate mutase  39.04 
 
 
179 aa  84.3  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4770  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
168 aa  82  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.12947  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2302  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  31.29 
 
 
185 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2105  phosphoglycerate mutase  30 
 
 
191 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3107  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  35.88 
 
 
175 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0257357 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0333  hypothetical protein  29.52 
 
 
164 aa  69.7  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4259  phosphoglycerate mutase  31.25 
 
 
179 aa  67.4  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08861  hypothetical protein  28.75 
 
 
167 aa  61.6  0.000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2914  phosphoglycerate mutase  29.33 
 
 
212 aa  47.4  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5583  Ais protein, putative  26.84 
 
 
228 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0564  phosphoglycerate mutase  34.67 
 
 
205 aa  46.6  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3246  hypothetical protein  26.63 
 
 
232 aa  42.7  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.139433  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5604  phosphoglycerate mutase  34.29 
 
 
202 aa  42  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.335394  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3093  hypothetical protein  25.56 
 
 
231 aa  41.2  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.582297  normal  0.758482 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0772  phosphoglycerate mutase  33.75 
 
 
215 aa  41.2  0.01  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.366718  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>