25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2302 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2302  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  100 
 
 		 185 aa  377  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2105  phosphoglycerate mutase  50.71 
 
 		 191 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0187  Phosphoglycerate mutase  43.48 
 
 		 179 aa  113  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3107  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  38.71 
 
 		 175 aa  87  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0257357 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0333  hypothetical protein  35.17 
 
 		 164 aa  86.3  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4259  phosphoglycerate mutase  37.67 
 
 		 179 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0856  phosphoglycerate mutase  34.73 
 
 		 178 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0807  phosphoglycerate mutase  32.65 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4770  Phosphoglycerate mutase  33.85 
 
 		 168 aa  76.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.12947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0941  hypothetical protein  28.33 
 
 		 181 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3698  phosphoglycerate mutase  31.29 
 
 		 205 aa  74.3  0.0000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.495695  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3522  phosphoglycerate mutase  31.37 
 
 		 197 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0749  hypothetical protein  31.37 
 
 		 197 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3822  phosphoglycerate mutase  31.29 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.579932 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3640  Phosphoglycerate mutase  31.29 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3352  phosphoglycerate mutase  30.07 
 
 		 197 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0601  phosphoglycerate mutase  30.07 
 
 		 197 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3232  phosphoglycerate mutase  29.41 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0991  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 179 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0170558 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0842  phosphoglycerate mutase  26.62 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.166737  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08861  hypothetical protein  30.88 
 
 		 167 aa  63.9  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2001  hypothetical protein  27.41 
 
 		 174 aa  46.6  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.149993 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  32.88 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0772  phosphoglycerate mutase  35 
 
 		 215 aa  41.6  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.366718  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  36.36 
 
 		 227 aa  41.2  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>