32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3377 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3377  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  349  8.999999999999999e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2760  hypothetical protein  38.25 
 
 		 189 aa  99.8  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.117203  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1631  hypothetical protein  36.61 
 
 		 189 aa  94  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1527  hypothetical protein  36.61 
 
 		 189 aa  94  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.963854  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1496  hypothetical protein  36.61 
 
 		 189 aa  94  9e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0315094  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0791  hypothetical protein  36.07 
 
 		 189 aa  91.3  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.554817  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0586  hypothetical protein  36.07 
 
 		 189 aa  91.3  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.634561  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1304  hypothetical protein  36.07 
 
 		 189 aa  91.3  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0566  hypothetical protein  36.07 
 
 		 189 aa  91.3  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.963257  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4312  hypothetical protein  33.9 
 
 		 220 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.85549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3878  hypothetical protein  34.46 
 
 		 220 aa  89  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1555  hypothetical protein  33.33 
 
 		 220 aa  87.8  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6733  hypothetical protein  34.81 
 
 		 190 aa  87  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2607  hypothetical protein  35.6 
 
 		 185 aa  82.8  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.611734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3639  hypothetical protein  33.33 
 
 		 220 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.331462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5716  hypothetical protein  33.87 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.89569 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0864  hypothetical protein  30.89 
 
 		 189 aa  77.8  0.00000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.381602  normal  0.499828 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2518  hypothetical protein  31.25 
 
 		 228 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.272562  normal  0.775663 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2790  hypothetical protein  35.43 
 
 		 272 aa  74.7  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0586384  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3753  hypothetical protein  31.25 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0227432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2253  hypothetical protein  28.8 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0117  hypothetical protein  30.32 
 
 		 195 aa  67.8  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1359  hypothetical protein  30.52 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0327501  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3824  hypothetical protein  26.9 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0110  hypothetical protein  27.61 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00209579  normal  0.608248 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46491  predicted protein  27.42 
 
 		 385 aa  55.1  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.427203  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3230  hypothetical protein  27.63 
 
 		 192 aa  52  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389296  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0884  hypothetical protein  26.92 
 
 		 235 aa  51.6  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0389371 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4770  Phosphoglycerate mutase  28.97 
 
 		 168 aa  46.2  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.12947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0187  Phosphoglycerate mutase  30.5 
 
 		 179 aa  46.6  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3752  hypothetical protein  32.54 
 
 		 196 aa  45.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3579  hypothetical protein  27.75 
 
 		 494 aa  43.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>