21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2607 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_2607  hypothetical protein  100 
 
 
185 aa  373  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.611734  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5716  hypothetical protein  46.03 
 
 
186 aa  141  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.89569 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2253  hypothetical protein  41.71 
 
 
184 aa  135  4e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2760  hypothetical protein  45.26 
 
 
189 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.117203  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1631  hypothetical protein  44.21 
 
 
189 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1527  hypothetical protein  44.21 
 
 
189 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.963854  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1496  hypothetical protein  44.21 
 
 
189 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0315094  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0586  hypothetical protein  43.68 
 
 
189 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.634561  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0566  hypothetical protein  43.68 
 
 
189 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.963257  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1304  hypothetical protein  43.68 
 
 
189 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0791  hypothetical protein  43.68 
 
 
189 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.554817  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0864  hypothetical protein  40.96 
 
 
189 aa  124  7e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.381602  normal  0.499828 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6733  hypothetical protein  42.31 
 
 
190 aa  122  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317849  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3752  hypothetical protein  35.42 
 
 
196 aa  89  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3377  hypothetical protein  35.6 
 
 
170 aa  82.8  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1359  hypothetical protein  27.46 
 
 
209 aa  52.4  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0327501  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0117  hypothetical protein  28.4 
 
 
195 aa  51.2  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3878  hypothetical protein  27.53 
 
 
220 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3824  hypothetical protein  27.17 
 
 
231 aa  48.9  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112724  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3639  hypothetical protein  27.65 
 
 
220 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.331462  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0110  hypothetical protein  26.01 
 
 
231 aa  44.7  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00209579  normal  0.608248 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>