19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2253 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_2253  hypothetical protein  100 
 
 
184 aa  377  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0864  hypothetical protein  52.17 
 
 
189 aa  192  3e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.381602  normal  0.499828 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1631  hypothetical protein  45.41 
 
 
189 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1527  hypothetical protein  45.41 
 
 
189 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.963854  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1496  hypothetical protein  45.41 
 
 
189 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0315094  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2760  hypothetical protein  45.65 
 
 
189 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.117203  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0586  hypothetical protein  44.86 
 
 
189 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.634561  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0566  hypothetical protein  44.86 
 
 
189 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.963257  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1304  hypothetical protein  44.86 
 
 
189 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0791  hypothetical protein  44.86 
 
 
189 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.554817  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6733  hypothetical protein  41.57 
 
 
190 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317849  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2607  hypothetical protein  41.71 
 
 
185 aa  135  4e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.611734  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5716  hypothetical protein  40 
 
 
186 aa  129  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.89569 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3752  hypothetical protein  35.53 
 
 
196 aa  104  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3377  hypothetical protein  28.8 
 
 
170 aa  68.2  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3639  hypothetical protein  25 
 
 
220 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.331462  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3878  hypothetical protein  24.1 
 
 
220 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0117  hypothetical protein  23.3 
 
 
195 aa  42.4  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1359  hypothetical protein  23.91 
 
 
209 aa  41.2  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0327501  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>