30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3878 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3878  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4312  hypothetical protein  95 
 
 		 220 aa  410  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.85549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1555  hypothetical protein  96.36 
 
 		 220 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3639  hypothetical protein  89.55 
 
 		 220 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.331462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3753  hypothetical protein  67.73 
 
 		 224 aa  322  2e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0227432  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2790  hypothetical protein  62.27 
 
 		 272 aa  284  7e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0586384  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2518  hypothetical protein  63.86 
 
 		 228 aa  281  5.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.272562  normal  0.775663 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3824  hypothetical protein  41.71 
 
 		 231 aa  156  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0110  hypothetical protein  37.74 
 
 		 231 aa  155  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00209579  normal  0.608248 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1359  hypothetical protein  36.49 
 
 		 209 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0327501  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0117  hypothetical protein  40 
 
 		 195 aa  144  9e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3230  hypothetical protein  40.88 
 
 		 192 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389296  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3377  hypothetical protein  34.46 
 
 		 170 aa  89  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2760  hypothetical protein  27.32 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.117203  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1527  hypothetical protein  28.65 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.963854  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1631  hypothetical protein  28.65 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0586  hypothetical protein  28.65 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.634561  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0566  hypothetical protein  28.65 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.963257  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1304  hypothetical protein  28.65 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0791  hypothetical protein  28.65 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.554817  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46491  predicted protein  23.5 
 
 		 385 aa  55.1  0.0000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.427203  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1496  hypothetical protein  27.78 
 
 		 189 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0315094  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1111  hypothetical protein  26.95 
 
 		 484 aa  54.3  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.255858  hitchhiker  0.000181601 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3579  hypothetical protein  26.19 
 
 		 494 aa  52  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0885  hypothetical protein  26.15 
 
 		 482 aa  51.6  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0864  hypothetical protein  25.44 
 
 		 189 aa  49.3  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.381602  normal  0.499828 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2607  hypothetical protein  27.53 
 
 		 185 aa  49.3  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.611734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2253  hypothetical protein  24.1 
 
 		 184 aa  43.5  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4770  Phosphoglycerate mutase  29.49 
 
 		 168 aa  43.9  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.12947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5716  hypothetical protein  25.45 
 
 		 186 aa  43.1  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.89569 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>