30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3824 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3824  hypothetical protein  100 
 
 
231 aa  476  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112724  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0110  hypothetical protein  91.94 
 
 
231 aa  410  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00209579  normal  0.608248 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1359  hypothetical protein  51.87 
 
 
209 aa  208  7e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0327501  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3878  hypothetical protein  41.71 
 
 
220 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3639  hypothetical protein  41.71 
 
 
220 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.331462  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2790  hypothetical protein  38.57 
 
 
272 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0586384  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4312  hypothetical protein  41.18 
 
 
220 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.85549  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1555  hypothetical protein  41.18 
 
 
220 aa  151  7e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0117  hypothetical protein  43.5 
 
 
195 aa  149  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2518  hypothetical protein  36.79 
 
 
228 aa  149  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.272562  normal  0.775663 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3753  hypothetical protein  38.42 
 
 
224 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0227432  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3230  hypothetical protein  38.29 
 
 
192 aa  132  5e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389296  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1111  hypothetical protein  33.73 
 
 
484 aa  76.6  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.255858  hitchhiker  0.000181601 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3579  hypothetical protein  30.91 
 
 
494 aa  65.1  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0885  hypothetical protein  30.56 
 
 
482 aa  62.4  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3377  hypothetical protein  26.9 
 
 
170 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3940  hypothetical protein  24.17 
 
 
488 aa  54.3  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.634833 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2668  hypothetical protein  23.68 
 
 
494 aa  51.6  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5716  hypothetical protein  27.27 
 
 
186 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.89569 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2607  hypothetical protein  27.17 
 
 
185 aa  48.9  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.611734  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3752  hypothetical protein  30.6 
 
 
196 aa  47.8  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0884  hypothetical protein  26.8 
 
 
235 aa  47.4  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0389371 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2105  phosphoglycerate mutase  26.67 
 
 
191 aa  44.7  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1496  hypothetical protein  26.2 
 
 
189 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0315094  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0586  hypothetical protein  24.87 
 
 
189 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.634561  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1527  hypothetical protein  24.87 
 
 
189 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.963854  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0566  hypothetical protein  24.87 
 
 
189 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.963257  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1304  hypothetical protein  24.87 
 
 
189 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1631  hypothetical protein  24.87 
 
 
189 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0791  hypothetical protein  24.87 
 
 
189 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.554817  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>